| 1. | 2019-2019. Auxilio FAPESP para publicacao de artigo Descrição: artigo publicado na Plos One: Structural characterization of a pathogenicity-related superoxide dismutase codified by a probably essential gene in Xanthomonas citri subsp. citri. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Maria Teresa Marques Novo Mansur - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Maria Teresa Marques Novo Mansur. |
| 2. | 2019-Atual. Avaliacao, recuperacao e conservacao da fauna ameacada de extincao do Centro de Endemismo Pernambuco (CEP) Descrição: A Mata Atlântica é um dos biomas com maior biodiversidade e, ao mesmo tempo, com um dos maiores níveis de degradação em todo o planeta. O Centro de Endemismo Pernambuco (CEP), que se estendia originalmente ao norte do Rio São Francisco, nos estados da Paraíba, Pernambuco e Alagoas, é hoje a área com o maior número de táxons ameaçados de extinção da Mata Atlântica, e cujos remanescentes florestais estão sob alto risco de desaparecimento, e já contando com espécies extintas. Paradoxalmente, o CEP é também a região mais pobre em estudos científicos em toda a Mata Atlântica. Ao mesmo tempo em que quatro espécies de aves foram recentemente declaradas extintas, novas espécies ainda estão sendo descritas na região, indicando que em muito pouco tempo a ciência não terá mais a chance de registrar possíveis novos táxons e será tarde demais para que ações possam ser propostas para a conservação das espécies ameaçadas. A falta de conhecimento recai não apenas sobre a composição da sua biodiversidade, mas também sobre ''onde'' ela está concentrada e ''por que''? Por isto, esta proposta traz como desafios: 1) aprimorar o conhecimento taxonômico das aves e mamíferos do CEP, que está sendo perdido antes mesmo de ser conhecido; 2) aprimorar o conhecimento sobre os fatores que afetam a distribuição e a persistência dos organismos, com foco no estado de Alagoas; 3) utilizar este conhecimento para propor e colocar em prática ações mais ostensivas e emergenciais de manejo e; 4) aumentar o conhecimento do público em geral sobre o CEP e sobre sua importância, através da divulgação científica. Projeto Temático Financiado pela FAPESP (2017/23548-2).. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Pedro Manoel Galetti Junior - Integrante / Mauro Galetti - Integrante / Mercival Roberto Francisco - Integrante / Luis Fábio Silveira - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Pedro Manoel Galetti Junior. Descrição: Temático Fapesp. Processo No. 2017/23548-2. R$ 2.472.585,72 U$ 44.005,91. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Patrícia Domingues de Freitas - Integrante / PEDRO MANOEL GALETTI JUNIOR - Integrante / Mercival Roberto Francisco - Integrante / Luís Fábio Silveira - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de SP - Auxílio financeiro. Membro: Patricia Domingues de Freitas. |
| 3. | 2019-Atual. Chromatin Immunoprecipitation-DNA sequencing (ChIP-seq) as a tool to identify genes regulated by the MADS Box transcription factor RlmA in Aspergillus fumigatus Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Iran Malavazi - Coordenador / CRAMER, ROBERT A. - Integrante. Membro: Iran Malavazi. |
| 4. | 2019-Atual. Citogenomica evolutiva, diversidade genetica e biogeografia de peixes Aruanas (Teleostei: Osteoglossiformes) Descrição: Este projeto está vinculado ao Projeto de Pesquisa (FAPESP 2018 / 22033-1) intitulado quot;Uma abordagem intercontinental para a investigação da evolução cromossômica, diversidade genética e biogeografia na ordem Osteoglossiformes (Teleostei: Osteoglossomorpha). Parte III quot;. Com este projeto específico, nos beneficiaremos da expertise científica de ambos os grupos de pesquisa para avançarmos na compreensão da citogenética, genômica e biogeografia das espécies de Aruanãs. Especificamente, o projeto será o primeiro a examinar conjuntamente as características genômicas e cromossômicas em todas as espécies de aruanã de três continentes diferentes. O projeto combina um modelo único entre os peixes, com avançados conceitos e ferramentas citogenéticas, genômicas e biogeográficas, juntamente com uma equipe internacional de pesquisadores altamente qualificados, para resolver os mecanismos envolvidos na organização e distribuição geográfica destes genomas de peixes. Usaremos o conjunto de dados obtido juntamente com informações fósseis para recuperar as relações filogenéticas entre as linhagens de aruanãs e estimar os tempos de divergência entre elas. Isso nos permitirá realizar uma reconstrução biogeográfica da história de diversificação da ordem e testar hipóteses biogeográficas que potencialmente expliquem a estreita relação filogenética de espécies distribuídas em diferentes continentes.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (3) . Integrantes: Marcelo de Bello Cioffi - Coordenador / Thomas Liehr - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de SP - Auxílio financeiro. Membro: Marcelo de Bello Cioffi. |
| 5. | 2019-Atual. ESTRUTURA GENETICA E RELACOES DE PARENTESCO NO MICO LEAO PRETO (LEONTOPITHECUS CHRYSOPYGUS) INFERIDAS POR MARCADORES DE MICROSSATELITES. Fapesp Processo Numero 2018/19577-0. Descrição: Fapesp, Processo Número 2018/19577-0.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado profissional: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Patrícia Domingues de Freitas - Coordenador / Paola Andrea Ayala-Burbano - Integrante / Nathalia Bulhoes Javarotti - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de SP - Bolsa. Membro: Patricia Domingues de Freitas. |
| 6. | 2019-Atual. ESTUDOS GENETICOS E GENOMICOS NO MICO LEAO PRETO Leontopithecus chrysopygus (CALITRICHIDAE, PRIMATES). Processo No 304477/2018-4 Descrição: Bolsas de Produtividade em Pesquisa - CNPq. Processo Número 304477/2018-4 Chamada CNPq Nº 09/2018 Modalidade: PQ Categoria/Nível: 2 R$ 42.900,00. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado profissional: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Patrícia Domingues de Freitas - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Membro: Patricia Domingues de Freitas. |
| 7. | 2019-Atual. Evolucao cariotipica e de cromossomos sexuais em peixes neotropicais. Parte III. Descrição: A ictiofauna neotropical de água doce é uma das mais ricas do mundo em número de espécies, muitas delas provavelmente ainda não descritas. Conseqüentemente, tal diversidade representa um desafio para o conhecimento científico, constituindo um universo ainda muito pouco explorado no tocante a questões fundamentais de natureza biológico-evolutiva. Nesse cenário, a citogenética vem contribuindo com significativos avanços, quer seja utilizando procedimentos investigativos clássicos ou da recente citogenética molecular. Por sua vez, algumas famílias de peixes se destacam como modelos investigativos apropriados, possibilitando abordagens a respeito da nossa real biodiversidade, seus processos e relacionamentos evolutivos. Algumas delas já vêm sendo objeto de nossos estudos há longa data, a partir das quais avanços significativos foram obtidos sobre biodiversidade críptica e complexos de espécies e evolução de cromossomos sexuais entre os vertebrados inferiores. Neste contexto, a presente proposta visa dar continuidade aos projetos anteriores (FAPESP- 2014/22532-7 e FAPESP- 2016/21411-7), aprofundando agora investigações em grupos ainda pouco estudados e igualmente promissores, tais como as famílias Lebiasinidae e Ctenolociidae, enfatizando marcadores genômicos específicos a partir da hibridização in situ fluorescente (FISH), microdissecção e pintura cromossômica total (WCP) e hibridização comparativa do genoma (CGH). Tais procedimentos terão em vista a investigação detalhada do cariótipo dessas duas famílias da nossa ictiofauna, dos prováveis inter-relacionamentos evolutivos entre elas e do processo de diferenciação e evolução de cromossomos sexuais presentes nesse grupo. Serão estreitadas parcerias científicas estabelecidas com diferentes grupos de pesquisa do Brasil e do exterior (Alemanha), assim como enfatizada a formação de recursos humanos na área em nível de iniciação científica, mestrado, doutorado e pós-doutorado. Avanços significativos no tocante à caracterização da biodiversidade e dos relacionamentos evolutivos de nossa ictiofauna deverão ser alcançados, embasados nas propostas formuladas e nas sólidas parcerias e interações científicas que vem sendo adotadas e mantidas pelo nosso grupo de pesquisa ao longo dos últimos anos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (3) . Integrantes: Luiz Antonio Carlos Bertollo - Coordenador / ELIANA FELDGERG - Integrante / ORLANDO MOREIRA FILHO - Integrante / TERUMI HATANAKA - Integrante / Thomas Liehr - Integrante / Marcelo de Bello Cioffi - Integrante / Ezequiel Aguiar de Oliveira - Integrante / Patrick F. Viana - Integrante / Manoela M. F. Marinho - Integrante / Renata L. R. de Moraes - Integrante / Francisco de Menezes Cavalcante Sassi - Integrante / Manolo Perez - Integrante / Gustavo Akira Toma - Integrante / José Francisco de Souza e Souza - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Luiz Antonio Carlos Bertollo. |
| 8. | 2019-Atual. Proposta de uma rede de interacao das vias de sinalizacao Notch, Wnt, Hippo, TGF-B, IIS e EGFR e a capacidade reprodutiva das abelhas sociais, Apini e Meliponini (Processo FAPESP no. 2019/02374-1) Descrição: O comportamento eussocial é uma recente e notável conquista dos Hymenoptera e é restrito aos Aculeata, um clado que compreende formigas, abelhas e vespas. Este modo de vida envolve três pilares: sobreposição de gerações, cooperação no cuidado da prole e divisão do trabalho reprodutivo. Este último pressupõe a divisão em castas, uma fêmea reprodutora que pode acasalar e pôr ovos, e operárias que abdicaram da reprodução e se dedicam ao trabalho de manutenção da colônia, da prole e da própria rainha. Embora a informação genômica e comportamental sobre Hymenoptera tenha aumentado muito nos últimos anos, os aspectos-chave da biologia, incluindo a dominância e a regulação da capacidade reprodutiva e como eles se relacionam com o desenvolvimento da eussocialidade, permanecem desconhecidos. Entre as abelhas mais estudadas está a Apis mellifera, aqui considerada como um organismo modelo. As abelhas são conhecidas pela eficiência de seu trabalho como polinizadores de espécies silvestres e cultivares e as plantas que polinizam produzem 30% dos alimentos consumidos pelo homem em todo o mundo. As operárias desta espécie são facultativamente estéreis. Entretanto, na falta da rainha, seus poucos ovaríolos funcionais podem ser ativados, produzindo óvulos que se desenvolvem em machos haploides. Quando consideramos nossas centenas de espécies de abelhas sociais nativas, as abelhas sem ferrão, que polinizam a maioria das plantas nativas de nosso país, encontramos uma grande diversidade de estratégias comportamentais e reprodutivas. No entanto, como no caso de A. mellifera, pouco se conhece sobre a história evolutiva da eussocialidade e processos associados nesse grupo. Infelizmente, tanto as abelhas melíferas como as abelhas sem ferrão estão muito ameaçadas pela perda de habitat e uso de pesticidas, gerando uma série de preocupações tanto pelo meio ambiente quanto pela produção de alimentos. Para entender melhor uma parte fundamental da biologia dessas abelhas, propomos estudar exemplos contrastantes de controle reprodutivo de operárias, usando A. mellifera como modelo de reprodução facultativa pelas operárias e as abelhas nativas Scaptotrigona bipunctata e Frieseomelitta varia como exemplos extremos de dominância e capacidade reprodutiva. As operárias de S. bipunctata regularmente ativam seus ovários e competem com suas rainhas pela produção de machos, enquanto em F. varia ocorre o contrário. Durante o desenvolvimento pré-imaginal, em um estágio precoce de pupa, os ovários das operárias desta espécie passam por um intenso programa de morte celular que resulta em ovários altamente modificados; consequentemente, as operárias não podem botar ovos. Aqui, propomos construir perfis morfológicos e comportamentais de fêmeas reprodutivas e não reprodutivas, e examinar possíveis correlações com a expressão e interação de componentes das vias metabólicas de Notch, EGFR, Hippo, TGF-², IIS e Wnt, conhecidas por estarem intimamente ligadas ao processo reprodutivo. Os resultados pretendidos devem nos ajudar a entender como a eussocialidade evoluiu e nos permitirá entender melhor essas espécies de abelhas, propor programas de manejo e manutenção de ambas, as nativas e as exóticas, lembrando que sua presença é fundamental para a estabilidade de nossos ecossistemas.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (2) . Integrantes: Francis de Morais Franco Nunes - Integrante / Zilá Luz Paulino Simões - Coordenador / Flávia Cristina de Paula Freitas - Integrante / Fernanda Camila Sanches - Integrante. Membro: Francis de Morais Franco Nunes. |
| 9. | 2019-2020. Return Fellowships for Research Fellows of the Alexander von Humboldt Foundation. Part I Descrição: This Fellowship aims at supporting the development of the research fellows after successfully completing the initial research stay in Germany sponsored by the Humboldt Foundation. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcelo de Bello Cioffi - Coordenador. Financiador(es): Alexander Von Humboldt-Stiftung/Foundation - Auxílio financeiro. Membro: Marcelo de Bello Cioffi. |
| 10. | 2019-Atual. Uma abordagem intercontinental para a investigacao da evolucao cromossomica, diversidade genetica e biogeografia na ordem Osteoglossiformes (Teleostei: Osteoglossomorpha). Parte III. Descrição: O presente projeto dará continuidade ao projeto anterior (FAPESP- 2016/22196-2), enfocando na evolução cromossômica, diversidade genética e filogeografia de espécies de Osteoglossiformes representativas de distintas regiões intercontinentais, contando com uma rede de colaboradores internacionais igualmente interessados nesta promissora abordagem. Será utilizado o sequenciamento de nova geração de regiões associadas a Elementos Ultra Conservados (EUCs) e de marcadores DArT-Seq (Diversity Array Technology Sequencing), em uma ampla amostragem de representantes de todas as famílias da ordem. Buscar-se-á inferir sobre a diversificação de espécies próximas, atualmente presentes em continentes diferentes, tendo em vista o processo de fragmentação dos mesmos e a ocorrência de dispersões marinhas de ancestrais atualmente extintos. Neste contexto destacam-se, particularmente, as espécies de aruanãs (Osteoglossidae), por apresentarem investigações ainda totalmente a descoberto, onde serão enfocadas análises cromossômicas e genômicas comparativas em todas as espécies presentes na América do Sul, Ásia e Austrália, com foco nos processos de evolução cariotípica e reconstrução de modelos biogeográficos que possam esclarecer a atual distribuição geográfica desse grupo. Além disso, a história filogeográfica de uma das espécies mais conhecidas e representativas dos Osteoglossiformes, o pirarucu (Arapaima gigas) será investigada a partir do desenvolvimento de modelos evolutivos, que serão testados com metodologias recentes de análise filogeográfica. Aliada a este projeto encontra-se uma equipe integrada de 06 grupos de pesquisa, representativa de todos os 05 continentes, somando esforços para a viabilização e execução dos objetivos que estão sendo propostos. A presente proposta propiciará avanços significativos para o entendimento de evolução cromossômica, organização e diversificação genômica e biodiversidade dos Osteoglossiformes, uma das ordens mais basais dentre os peixes e amplamente distribuída por diversos continentes do velho e do novo mundo.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Marcelo de Bello Cioffi - Coordenador / Moreira-Filho, O. - Integrante / Bertollo, L A C - Integrante / FELDBERG, ELIANA - Integrante / Manolo Fernandez Perez - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de SP - Auxílio financeiro. Membro: Marcelo de Bello Cioffi. Descrição: O presente projeto dará continuidade ao projeto anterior (FAPESP- 2016/22196-2), enfocando na evolução cromossômica, diversidade genética e filogeografia de espécies de Osteoglossiformes representativas de distintas regiões intercontinentais, contando com uma rede de colaboradores internacionais igualmente interessados nesta promissora abordagem. Será utilizado o sequenciamento de nova geração de regiões associadas a Elementos Ultra Conservados (EUCs) e de marcadores DArT-Seq (Diversity Array Technology Sequencing), em uma ampla amostragem de representantes de todas as famílias da ordem. Buscar-se-á inferir sobre a diversificação de espécies próximas, atualmente presentes em continentes diferentes, tendo em vista o processo de fragmentação dos mesmos e a ocorrência de dispersões marinhas de ancestrais atualmente extintos. Neste contexto destacam-se, particularmente, as espécies de aruanãs (Osteoglossidae), por apresentarem investigações ainda totalmente a descoberto, onde serão enfocadas análises cromossômicas e genômicas comparativas em todas as espécies presentes na América do Sul, Ásia e Austrália, com foco nos processos de evolução cariotípica e reconstrução de modelos biogeográficos que possam esclarecer a atual distribuição geográfica desse grupo. Além disso, a história filogeográfica de uma das espécies mais conhecidas e representativas dos Osteoglossiformes, o pirarucu (Arapaima gigas) será investigada a partir do desenvolvimento de modelos evolutivos, que serão testados com metodologias recentes de análise filogeográfica. Aliada a este projeto encontra-se uma equipe integrada de 06 grupos de pesquisa, representativa de todos os 05 continentes, somando esforços para a viabilização e execução dos objetivos que estão sendo propostos. A presente proposta propiciará avanços significativos para o entendimento de evolução cromossômica, organização e diversificação genômica e biodiversidade dos Osteoglossiformes, uma das ordens mais basais dentre os peixes e amplamente distribuída por diversos continentes do velho e do novo mundo.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Luiz Antonio Carlos Bertollo - Integrante / ELIANA FELDGERG - Integrante / ORLANDO MOREIRA FILHO - Integrante / TERUMI HATANAKA - Integrante / Thomas Liehr - Integrante / Marcelo de Bello Cioffi - Coordenador / ALONGKLOD TANOMTONG - Integrante / TARIK EZAZ - Integrante / PETR RAB - Integrante / Alexandr Sember - Integrante / Ezequiel Aguiar de Oliveira - Integrante / Oladele Jezede - Integrante / Renata L. R. de Moraes - Integrante / Patrick Viana - Integrante / Francisco de Menezes Cavalcante Sassi - Integrante / Manolo Perez - Integrante / Gustavo Akira Toma - Integrante / Andrzej Killian - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Luiz Antonio Carlos Bertollo. |
| 1. | 2018-2019. Auxilio a Pesquisa FAPESP - Reparo de Equipamentos Descrição: - Conserto de freezer -80. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Maria Teresa Marques Novo Mansur - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Maria Teresa Marques Novo Mansur. |
| 2. | 2018-Atual. Consequencias funcionais de rearranjos no gene FBXL17, presentes em amostras de pacientes e linhagens celulares de cancer de mama, na atividade da E3 ubiquitina-ligase SCF(Fbxl17) Descrição: Fbxl17 é uma das 69 proteínas do tipo F-box (Fbx) em humanos que interage com SKP1, Cullina e RBX para formar o complexo E3 ubiquitina-ligase denominado SCF(Fbxl17) que medeia ubiquitinação de seus substratos. As Fbxls possuem além do domínio F-box de interação com SKP1, o domínio LRR (Leucine Rich Repeat) de interação com seus substratos. Mutações no gene FBXL17 que geram truncamentos no domínio LRR foram encontradas em 135 de 1992 amostras de pacientes do projeto METABRIC (Molecular Taxonomy of Breast Cancer International Consortium). Além disso, CGH-array (Comparative Genomic Hybridization) de 746 linhagens de células cancerosas mostrou que FBXL17 apresentou quebra em 3 linhagens de câncer de mama, BT-474, HCC38 e HCC1395 e 1 de câncer esofágico/gástrico OE-19 que levou a formação de versões de Fbxl17 com truncamentos no seu domínio LRR. Não há nenhum trabalho que relaciona Fbxl17 com tumorigenicidade e pretendemos nesse projeto identificar os substratos da E3 ligase SCF(Fbxl17) e avaliar quais deles tem sua ubiquitinação prejudicada em função da depleção do domínio LRR presente nas células tumorais. Para isso, utilizaremos os microarranjos de proteínas (protoarrays) como fonte de substratos e complexos SCF(Fbxl17) ou SCF(Fbxl17 mutantes) purificados de células de mamíferos em reações de ubiquitinação in vitro. Substratos diferencialmente ubiquitinados serão validados in vitro e in cellulo e realizaremos o mapeamento de cadeias de ubiquitina de cada um para inferirmos sofre a função da sua ubiquitinação por SCF(Fbxl17). Células expressando a forma mutante de Fbxl17-#148;3LRR (HCC1395, OE-19) e Fbxl17 (MCF7, HB4a) serão utilizadas para avaliação das consequências funcionais da ubiquitinação dos seus substratos identificados. Temos experiência comprovada para realização desses procedimentos e conto como colaboradores diretos o Prof. Dr. Marcelo D. Gomes do Depto. de Bioquímica e Imunologia da FMRP/USP e a Dra. Heike Laman e Dr. Paul Edwards do Department of Pathology da University of Cambridge/UK. A principal contribuição desse projeto é entender o papel da E3 ligase SCF(Fbxl17) e sua forma mutante SCF(Fbxl17-#148;3LRR) na tumorigenicidade de células de câncer de mama. Com isso, contribuiremos para definição de FBXL17 como um potencial biomarcador e alvo terapêutico para o câncer.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . Integrantes: Felipe Roberti Teixeira - Coordenador / Heike Laman - Integrante. Membro: Felipe Roberti Teixeira. |
| 3. | 2018-2019. ESTRUTURA GENETICA MATRILINEAR E RELACOES DE PARENTESCO NO MICO LEAO PRETO, LEONTOPITHECUS CHRYSOPYGUS (PRIMATAS) UMA ESPECIE AMEACADA QUE APRESENTA SISTEMA DE REPRODUCAO COOPERATIVA. Fapesp Processo Numero 2017/26379-7 Descrição: Fapesp Processo Número 2017/26379-7. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Patrícia Domingues de Freitas - Coordenador / Paola Andrea Ayala-Burbano - Integrante / Nathalia Bulhoes Javarotti - Integrante / Yngrid Karina Veltroni - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de SP - Bolsa. Membro: Patricia Domingues de Freitas. |
| 4. | 2018-Atual. GENOMICS OF ALOUATTA SPECIES (ATELIDAE, PRIMATES) Descrição: International Collaboration Project with Duke University and Cold Spring Habor Laboratory. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Patrícia Domingues de Freitas - Coordenador / Luana Portela Faria e Ávila - Integrante / Amy Goldberg - Integrante. Financiador(es): Duke University - Cooperação. Membro: Patricia Domingues de Freitas. |
| 5. | 2018-Atual. Genomica comparada e filogenomica de moscas-das-frutas do genero Anastrepha, com enfase no grupo fraterculus Descrição: Moscas-das-frutas do gênero Anastrepha são endêmicas da America do Sul e apresentam várias espécies de grande importância econômica por serem importantes pestes agrícolas, particularmente no grupo fraterculus. Não obstante sua importância econômica, que fomentou a publicação de diversos artigos com relevantes dados genéticos e morfológicos sobre diversas espécies do grupo, existem ainda diversas questões importantes não resolvidas, particularmente acerca das relações filogenéticas entre espécies de Anastrepha e sua história evolutiva. O objetivo desta proposta é gerar dados que permitam estabelecer linhagens evolutivas em espécies de Anastrepha ao longo do Brasil, com um foco especial em espécies do grupo fraterculus, que são as de maior impacto econômico no país. Usando de dados genômicos e transcriptômicos de diversas espécies de Anastrepha e Bactrocera, e ferramentas de bioinformática, selecionaremos 2000 regiões gênicas que serão sequenciadas de mais de 1000 amostras coletadas de diversas espécies de várias partes do Brasil por meio de uma estratégia de captura das regiões alvo e sequenciados na plataforma MiSeq da Illumina. Esta estratégia produzirá fragmentos contínuos de cerca de 500 pb por região genômica, o que permitirá a resolução direta da sua fase gamética. Estes dados serão utilizados para análises populacionais e de coalescência não apenas para determinar as forças evolutivas afetando tais regiões, mas também para inferir a divergência entre populações e espécies do gênero Anastrepha, com ênfase no grupo fraterculus, usando-se de várias estratégias modernas de delimitação de espécies. Os resultados serão úteis auxiliar a identificar linhagens evolutivas distintas e avaliar o fluxo gênico histórico e recorrente entre estas, o que será importante para determinar o status taxonômico de espécies deste grupo. Além disso, estes resultados auxiliarão no entendimento das mudanças genéticas acontecidas durante o processo de especiação deste importante grupo. Finalmente, este projeto permitirá a identificação de marcadores genéticos específicos para as espécies economicamente mais importantes do gênero e deste complexo, inclusive as crípticas, o que, apesar de imensos esforços, tem sido ainda elusivo, o que promete facilitar o estabelecimento de melhores condições para o controle dessas importantes pragas agrícolas.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Reinaldo Otávio Alvarenga Alves de Brito - Coordenador / Carlos Congrains - Integrante / Samira Chahad-Ehlers - Integrante / Scott Geib - Integrante / Julian Dupuis - Integrante. Número de orientações: 2 Membro: Reinaldo Otavio Alvarenga Alves de Brito. |
| 6. | 2018-Atual. Mitochondrial dynamics during oogenesis Descrição: This proposal is based on previous findings of M. Chiaratti's group, which with the expertise provided by the H. Clarke's group seeks to characterize mitochondrial dynamics in oocytes in greater depth, with potential implications to human welfare and health. The proposed scientific activities will investigate three hypotheses in mice: 1) Mfn1 conditional knockout (cKO) inhibits the PI3K/Akt pathway and enhances mitochondria-endoplasmic reticulum (ER) contacts in oocytes, which is reversed in Mfn1+Mfn2 cKO oocytes; 2) Mfn2 overexpression (OE), but not Mfn1+Mfn2 OE, prevents oocyte growth and maturation; and, 3) mitophagy underpins the purifying filter against mutant mitochondrial DNA (mtDNA) in growing oocytes. Also, two one-day workshops on oogenesis will be organized in São Carlos (in 08/2018 and 11/2019) and M. Chiaratti will chair a session on folliculogenesis during the Annual Meeting of the Brazilian Society for Embryo Technology (SBTE) in which H. Clarke will contribute with a speech. The resources sought will cover the travelling and subsistence cost for Principal Investigators (PIs) between Montreal and São Carlos. At Federal University of São Carlos (UFSCar), M. Chiaratti studies mitochondria in the female germline and their effect on fertility and mtDNA inheritance. H. Clarke studies growth and meiotic maturation of the mammalian oocyte at McGill University. He is currently the Co-Editor-in-chief of Biology of Reproduction and has authored/co-authored over 50 publications and book chapters.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (4) / Doutorado: (2) . Integrantes: Marcos Roberto Chiaratti - Coordenador / Hugh Clarke - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de SP - Auxílio financeiro. Membro: Marcos Roberto Chiaratti. |
| 7. | 2018-Atual. Modeling the human mitochondrial bottleneck in vitro Descrição: Diseases caused by mutations in mitochondrial DNA (mtDNA) affect ~1 in 4,300 people. In addition, almost every person carries very low levels of mutated mtDNA, which may be transmitted down to the maternal lineage and associate with late-onset degenerative diseases. Inheritance of mutated mtDNAs in germ cells relies upon the mitochondrial bottleneck, which results in drastic changes in the frequency of mtDNA variants within one generation. Yet, counteracting forces seem to act during specific stages of germline development to filter out pathogenic mutations in mtDNA. Mitochondria in the human germline differ from those of somatic tissues by their fragmented morphology, rounded shape and small size, suggesting fusion downregulation. In addition, the number of mtDNA molecules per mitochondrion is decreased in the germline to a level close to haploidy. These characteristics are expected to contribute with the bottleneck effect and the filter that prevents mutation expansion. Similarly, induction of somatic cells to reprogram into pluripotent stem cells (iPSCs) involves remodeling of the mitochondrial network, resulting in morphological and functional changes in mitochondria that closely resemble those in the germline. Moreover, both mtDNA copy number and the level of mutated mtDNA decrease during iPSC derivation, mimicking the bottleneck effect. This highlights the importance of mitochondrial remodeling in germ cells and places iPSC as a reliable model to study mtDNA inheritance in humans. Currently, it is challenging to estimate the mutation level that will be transmitted by a woman with mutated mtDNA. Moreover, in the case of oocytes containing high levels of mutated mtDNA, the mitochondrial replacement therapy (MRT) has been proposed as the only way of generating healthy offspring. However, this requires a healthy oocyte donor, which is challenging. In addition, pre-clinical studies with the MRT have shown unexpected reversion to the original genotype in ~15% of cases. A complete understanding of the underlying mechanisms leading to shifts in the level of mutated mtDNA could be used to help generate healthy offspring, potentially even avoiding the need for in vitro embryo manipulation. Hence, we propose to establish a human model of the mitochondrial bottleneck based on in vitro specification of primordial germ cells (PGC)-like cells (PGCLCs) from iPSCs. In addition, we will manipulate mitochondrial dynamics during PGCLC specification to assess its impact on segregation of polymorphisms and pathogenic mtDNA variants.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (2) . Integrantes: Marcos Roberto Chiaratti - Coordenador / MACABELLI, CAROLINA HABERMANN - Integrante / Patrick F Chinnery - Integrante. Financiador(es): The Academy of Medical Sciences e Newton Fund - Auxílio financeiro. Membro: Marcos Roberto Chiaratti. |
| 8. | 2018-Atual. Revisao das especies nominais da ictiofauna de rios do estado de Sao Paulo atraves de analises morfologicas e moleculares de topotipos, incluindo a caracterizacao da diversidade ictiologica remanescente nas localidades-tipo e suas proximidades Descrição: A fauna de peixes dos rios do estado de São Paulo, principalmente aquela dos rios Tietê e Grande na Bacia do Alto Rio Paraná, possui histórico de investigações biológicas que resultou no conhecimento parcial de sua diversidade. As primeiras descrições de espécies a partir de material proveniente desses rios datam da primeira metade do século XIX e, desde então, estudos sobre taxonomia, sistemática, biologia, ecologia e, recentemente, genética molecular foram realizados. Embora exista grande volume de informações sobre a ictiofauna dos rios de São Paulo, ainda restam muitos problemas taxonômicos a serem resolvidos. São ainda necessários novos estudos que disponibilizem dados de genética molecular, anatomia funcional e relações filogenéticas das espécies para melhor caracterização da diversidade ictiológica. A coleção de peixes do Laboratório de Ictiologia Sistemática da UFSCar (LISDEBE) abriga considerável acervo de exemplares provenientes de rios da bacia do alto Rio Paraná (Grande, Tietê e Paranapanema), das pequenas bacias litorâneas, do Rio Paraíba do Sul e do Ribeira de Iguape no estado de São Paulo. Inclui lotes de exemplares topótipos recentemente coletados e associados a um banco de tecidos para análises moleculares. Também, parte do material é derivado de coletas antigas (de mais de trinta anos) realizadas nessas bacias em ambientes atualmente alterados, mas que ainda se encontram pouco estudados. Este projeto propõe uma ampla revisão de material depositado em coleções ictiológicas, incluindo a revisão taxonômica de espécies e grupos de espécies cujas localidades-tipo se inserem nos rios do estado. Além da análise de material topotipo já presente na coleção do LISDEBE e sua caracterização molecular (DNA barcode), serão realizadas coletas e análises de material ictiológico adicional em outras localidades-tipo. As informações levantadas durante o estudo desse material possibilitarão uma apreciação da diversidade e distribuição das espécies nas drenagens. Finalmente pretende-se com a caracterização da diversidade da ictiofauna elaborar manuais de identificação de espécies para as bacias dos rios Tietê e Grande.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Pedro Manoel Galetti Junior - Integrante / Julio Cesar Caravello - Coordenador / Alexandre Kannebley de Oliveira - Integrante / Fernando Apone - Integrante / Henrique Rosa Varella - Integrante / Jorge Luis Ramirez Malaver - Integrante / José Luís Olivan Birindelli - Integrante / Oscar Akio Shibatta - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Pedro Manoel Galetti Junior. |
| 9. | 2018-Atual. Selecao e evolucao dirigida de leveduras - Identificacao e analise de vias metabolicas importantes para aplicacao nas industrias do bioetanol e de bebidas fermentadas. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Doutorado: (3) . Integrantes: Anderson Ferreira da Cunha - Coordenador / MALAVAZI, I. - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Anderson Ferreira da Cunha. |
| 10. | 2018-Atual. Truncamentos no gene FBXL17, presentes emamostras de pacientes e linhagens celulares de cancer de mama, afetama atividade da E3 ubiquitina-ligase SCF(Fbxl17) Descrição: Fbxl17 é uma das 69 proteínas do tipo F-box (Fbx) emhumanos que interage comSKP1, Cullina e RBX para formar o complexo E3 ubiquitina-ligase denominado SCF(Fbxl17) que medeia ubiquitinação de seus substratos. As Fbxls possuem além do domínio F-box de interação com SKP1, o domínio LRR (Leucine Rich Repeat) de interação comseus substratos. Mutações no gene FBXL17 que geramtruncamentos no domínio LRRforamencontradas em135 de 1992 amostras de pacientes do#10;p r o j e t o M E T A B R I C ( M o l e c u l a r Ta x o n o m y o f B r e a s t C a n c e r I n t e r n a t i o n a l C o n s o r t i u m ) . A l é m d i s s o , C G H - a r r a y ( C o m p a r a t i v e G e n o m i c H y b r i d i z a t i o n ) d e 7 4 6 l i n h a g e n s d e células cancerosas mostrou que FBXL17 apresentou quebra em3 linhagens de câncer de mama, BT-474, HCC38 e HCC1395 e 1 de câncer esofágico/gástrico OE-19 que levou a formação de versões de Fbxl17 comtruncamentos no seu domínio LRR. Não há nenhumtrabalho que relaciona Fbxl17 comtumorigenicidade e pretendemos nesse projeto identificar os substratos da E3 ligase SCF(Fbxl17) e avaliar quais deles temsua ubiquitinação prejudicada emfunção da depleção do domínio LRRpresente nas células tumorais. Para isso, utilizaremos os microarranjos de proteínas (protoarrays) como fonte de substratos e complexos SCF(Fbxl17) ou SCF(Fbxl17 mutantes) purificados de células de mamíferos emreações de ubiquitinação in vitro. Substratos diferencialmente ubiquitinados serão validados in vitro e in cellulo e realizaremos o mapeamento de cadeias de ubiquitina de cada umpara inferirmos sofre a função da sua ubiquitinação por SCF(Fbxl17). Células expressando a forma mutante de Fbxl17- #916;3LRR(HCC1395, OE-19) e Fbxl17 (MCF7, HB4a) serão utilizadas para avaliação das consequências funcionais da ubiquitinação dos seus#10;substratos identificados. Temos experiência comprovada para realização dessesprocedimentos e conto como colaboradores diretos o Prof. Dr. Marcelo D. Gomes do Depto. de Bioquímica e Imunologia da FMRP/USPe a Dra. Heike Laman e Dr. Paul Edw ards do Department of Pathology da University of Cambridge/UK. A principal contribuição desse projeto é entender o papel da E3 ligase SCF(Fbxl17) e sua f orma mutante SCF(Fbxl17-#916;3LRR) na tumorigenicidade de células de câncer de mama. Com#10;isso, contribuiremos para definição de FBXL17 como umpotencial biomarcador e alvo terapêutico para o câncer.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Felipe Roberti Teixeira - Coordenador / Heike Laman - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Felipe Roberti Teixeira. |
| 11. | 2018-Atual. Pontos de quebras de DNA e rearranjos cromossomicos em peixes da familia Loricariidae (Teleostei, Siluriformes): Uma abordagem citogenetica e molecular Descrição: Os peixes da família Loricariidae(Teleostei, Siluriformes) apresentam uma ampla variação morfológica, assim como uma ampla diversidade cromossômica numérica (2n) e estrutural decorrentes de rearranjos cromossômicos ocorridos ao longo da história evolutiva das espécies.A ocorrência de rearranjos cromossômicos estáintimamenteassociada a quebras do DNA em sítios ricos em sequências repetitivas. Telômeros são sequências de DNA repetitivo in tandem,localizadas na região terminal dos cromossomos, que tem como função manter a sua estabilidade e integridade. Tais sequências podem eventualmente ser encontradas em outras regiões do cromossomo, os chamados sítios teloméricos intersticiais (ITS). É proposto que os ITS surgiram como resultado de rearranjos cromossômicos na evolução dos genomas e que sua ocorrência pode causar instabilidade cromossômica. Adicionalmente, há também indícios da participação dos DNAsribossomais em parte das quebras e reorganizações cromossômicas. O re-uso da mesma sequência de DNA na origem dos rearranjos cromossômicos em genomas de linhagens próximas é a característica chave do modelo evolutivo dos pontos de quebras da dupla fita. Essa predisposição à instabilidade e quebras de certas regiões genômicas é descrita como ponto de quebras evolutivas, os quais são considerados hotspots para rearranjos cromossômicos.Entretanto, o estudo de caracterização de famílias de DNAs repetitivos em peixes Neotropicais, correlacionando estes DNAs repetitivos aos eventos de rearranjos cromossômicos, ainda são bastante escassos.Assim, este trabalho tem como objetivo a caracterização de DNAs repetitivos em peixes da família Loricariidae, com enfoque em pontos de quebras cromossômicas responsáveis pela sua diversidade cariotípica,visandoo entendimento da evolução genômica desse especioso grupo da ictiofauna Neotropical.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (3) . Integrantes: Orlando Moreira Filho - Coordenador / Luiz Antônio Carlos Bertllo - Integrante / Marcelo Ricardo Vicari - Integrante / Viviane Nogaroto - Integrante / CIOFFI, MARCELO DE BELLO - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Orlando Moreira Filho. |
| 1. | 2017-Atual. A influencia de proteinas quinases ativadas por mitogenos (MAPK) na expressao de determinantes geneticos importantes para a virulencia de Aspergillus fumigatus Descrição: Projeto Temático FAPESP (2016/07870-9). Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Iran Malavazi - Integrante / Gustavo Henrique Goldman - Coordenador. Membro: Iran Malavazi. |
| 2. | 2017-Atual. Abordagens moleculares para o controle do bicudo da cana-de-acucar Descrição: O projeto trata da busca de canas-de-açúcar mais resistentes ao ataque de insetos pragas, em particular, coleópteros. Parte do projeto trata da superexpressão de uma nova canacistatina em vacúolos de cana-de-açúcar. Esta proteína (CaneCPI-5), recentemente identificada em nosso laboratório, mostrou-se excelente inibidora de diversas cisteino peptidases (incluindo a principal digestiva de S.levis). Por outro lado, ela possui um grande potencial de aplicação biotecnológica em odontologia, visto que se mostrou capaz de ligar fortemente ao esmalte dentário e protege-lo do ataque ácido, podendo contribuir para evitar a erosão dentária. Assim, produzi-la em grandes quantidades nas plantas pode torna-las mais resistentes ao ataque de S.levis e também proporcionar grandes quantidades da mesma, purificada a partir da garapa, e com o potencial de ser utilizada industrialmente. O projeto trata também da utilização da abordagem de RNAi para controle de S.levis, utilizando genes alvo já identificados em nosso laboratório. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Flavio Henrique da Silva - Coordenador / Danyelle Toyama - Integrante / Andrea Soares da Costa Fuentes - Integrante / CHAKRAVARTHI, MOHAN - Integrante / Priscilla Shibao - Integrante. Membro: Flavio Henrique da Silva. |
| 3. | 2017-Atual. Conservacao de mamiferos ameacados de extincao no Corredor de Biodiversidade da Serra do Mar: integrando ecologia, dimensoes humanas e planejamento Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Pedro Manoel Galetti Junior - Integrante / Mauro Galetti - Integrante / Bruno Henrique Saranholi - Integrante / FERRAZ, KATIA M. P. M. B. - Coordenador / MORATO, RONALDO G. - Integrante / Adriano Garcis Chiarello - Integrante / Roberto Fusco - Integrante / Rogério Cunha de Paula - Integrante. Financiador(es): Fundação O Boticário de Proteção à Natureza - Auxílio financeiro. Membro: Pedro Manoel Galetti Junior. |
| 4. | 2017-Atual. DNA mitocondrial: mecanismos de manutencao de sua estabilidade e mutagenese Descrição: Descrição: Mitocôndrias desempenham papeis fundamentais tanto no metabolismo energético quanto em sinalização em células eucarióticas. Essas organelas são responsáveis pela produção de ATP, e desempenham funções centrais na sinalização redox, homeostase de cálcio e sinalização apoptótica. Um aspecto particular da biologia mitocondrial é que essas organelas contêm um genoma próprio, independente do genoma nuclear. Em humanos, o genoma mitocondrial (mtDNA) contem 16.569 pares de bases e codifica 13 proteínas, 2 rRNAs e 22 tRNAs. A estabilidade do mtDNA é essencial para a integridade funcional da organela e da célula, e mutações nesse genoma estão associadas com várias doenças. No entanto, o genoma mitocondrial está exposto a vários agentes genotóxicos, incluindo espécies reativas de oxigênio geradas normalmente como subprodutos do transporte de elétrons durante a fosforilação oxidativa. De fato, o mtDNA acumula lesões de DNA em níveis maiores do que o genoma nuclear. Desta forma, o entendimento dos mecanismos envolvidos na manutenção da estabilidade genética e funcional do mtDNA é fundamental para a melhor compreensão de processos fisiológicos e/ou patológicos. Esse projeto é subdivido em 5 subprojetos que abordam desde aspectos moleculares dos mecanismos de manutenção da integridade do mtDNA até a relevância funcional desses em patologias humanas. Esses são: 1) estudo dos mecanismos moleculares de reparo de DNA em mitocôndrias de mamíferos; 2) estudo do papel de proteínas de replicação na estabilidade do mtDNA; 3) estudo do papel de Rad51 mitocondrial na linhagem germinativa feminina e na fertilidade; 4) estudo da heterogeneidade do mtDNA em carcinoma renal; e 5) investigação de defeitos na manutenção do mtDNA em pacientes com intolerância ao exercício. Os resultados obtidos aqui devem avançar significativamente o entendimento molecular dos mecanismos de manutenção da estabilidade genômica em mitocôndrias, bem como da participação de alterações nessas vias em processos patológicos, e assim podem contribuir para o desenvolvimento de estratégias terapêuticas ou preventivas.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcos Roberto Chiaratti - Integrante / Nadja Cristhina de Souza Pinto - Coordenador / Marcos Túlio de Oliveira - Integrante / Cláudia Ferreira da Rosa Sobreira - Integrante / Rodolfo Borger dos Reis - Integrante. Membro: Marcos Roberto Chiaratti. |
| 5. | 2017-2019. Efeito do nocaute das mitofusinas no oocito murino: implicacoes para a fertilidade e heranca mitocondrial Descrição: Mitocôndrias têm papel fundamental no crescimento do oócito, podendo, em casos de disfunções ou mutações no DNA mitocondrial (mtDNA), resultar em síndromes de infertilidade e transmissão de doenças mitocondriais. Comparado com outras células, as mitocôndrias oocitárias distinguem-se pela maior quantidade, pequeno tamanho e formato arredondado. Tais características são dependentes da fusão e fissão mitocondrial, o que é determinante para a função e herança da organela. A fusão mitocondrial é coordenada, entre outros fatores, por mitofusinas (Mfn1 e Mfn2). Estas proteínas desempenham importante papel na regulação da função da mitocôndria e do retículo endoplasmático (RE), uma vez que o Mfn2 também está presente na membrana do RE. Recentemente, verificamos que o Mfn1 é essencial para o crescimento e fertilidade do oócito, fenótipo este que foi parcialmente revertido pelo nocaute do Mfn2 em oócitos duplo-mutantes (DM). Por outro lado, a deficiência oocitária de Mfn2 interferiu sobre a eliminação do mtDNA mutante NZB/BINJ (NZB) e resultou em anormalidades metabólicas na progênie. Assim, propomos neste trabalho aprofundar esses achados com o objetivo de explicar i) o mecanismo molecular que conecta o nocaute do Mfn1 no oócito ao bloqueio da foliculogênese; ii) o efeito do nocaute do Mfn2 sobre o metabolismo energético no oócito, nas células do cumulus (CC) e na progênie; iii) as razões do duplo mutante Mfn1 + Mfn2 (DM) ter efeito mais brando sobre o desenvolvimento do oócito e a foliculogênese do que o nocaute do Mfn1; e, iv) o papel do Mfn2 na eliminação do mtDNA NZB no oócito. Para tanto, os genes Mfn1 e/ou Mfn2 serão condicionalmente nocauteados nos oócitos utilizando camundongos heteroplásmicos (contendo mtDNA NZB e C57BL/6). Oócitos selvagens (WT) e homozigotos nocautes para Mfn1, Mfn2 e Mfn1 + Mfn2 serão comparados por sequenciamento de RNA (RNAseq) quanto a abundância de transcritos gênicos. Isso deve fornecer importantes evidências dos efeitos dos nocautes sobre o oócito. Além disso, outros experimentos (análises metabólicas, análises bioquímicas, microscopia de fluorescência, microscopia eletrônica de transmissão, PCR em tempo real, western blot, entre outros) serão realizados em paralelo para testar algumas das hipóteses já formuladas. Uma vez que estes experimentos envolverão a análise de oócitos, CC e progênie, espera-se que eles complementem a abordagem por RNAseq e que acelerem a publicação de parte dos achados já obtidos. Os resultados desse projeto devem possibilitar um melhor entendimento do efeito das mitocôndrias, do RE e das mitofusinas sobre o oócito, a fertilidade e a herança mitocondrial.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . Integrantes: Marcos Roberto Chiaratti - Coordenador / Thiago Simões Machado - Integrante / Meirelles, F. V. - Integrante / Perecin, F. - Integrante / Carolina Habermann Macabelli - Integrante / Karen F Carvalho - Integrante / Bruna M Garcia - Integrante / Patrick F Chinnery - Integrante / Katiane Tostes - Integrante / Fabrícia Heloísa Cavichioli Sugiyama - Integrante / Mateus Priolo Grejo - Integrante / José Djaci Augusto Neto - Integrante / Anand K Pandey - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Marcos Roberto Chiaratti. |
| 6. | 2017-2019. Evolucao cariotipica e de cromossomos sexuais em peixes neotropicais. Parte II. Descrição: Os peixes das famílias Erythrinidae e Triportheidae constituem excelentes modelos investigativos para a citogenética evolutiva. Um destacado acervo de dados cariotípicos e marcadores cromossômicos, particularmente dos gêneros Hoplias (Erythrinidae) e Triportheus (Triportheidae), já foram obtidos em nossos estudos prévios. O presente projeto dará continuidade ao projeto anterior (FAPESP- 2014/22532-7), enfocando agora as inter-relações dessas famílias com outros grupos da nossa ictiofauna e a obtenção de novos avanços no que se refere ao processo evolutivo dos cromossomos sexuais. No tocante à família Erythrinidae, serão investigadas suas relações cromossômicas com as famílias Hepsetidae, Lebiasinidae e Ctenolucidae, tendo em vista propostas filogenéticas apontando a proximidade entre elas. Buscar-se-ão subsídios cromossômicos robustos, obtidos a partir de marcadores resolutivos da citogenética molecular, que contribuam para o esclarecimento das relações evolutivas entre essas famílias, um campo ainda em aberto na ictiologia Neotropical. Serão também enfatizadas a gênese e a diferenciação de um raro sistema XX/XY1Y2 entre os peixes, avançando assim no entendimento do processo evolutivo dos cromossomos sexuais entre os vertebrados inferiores. Por sua vez, a prospecção de homologias e divergências genômicas entre os cariomorfos de Hoplias malabaricus propiciará um passo significativo na caracterização da biodiversidade críptica presente neste provável complexo de espécies. Para tanto, serão utilizadas abordagens da hibridização genômica comparativa (CGH) e pintura cromossômica total (WCP), com sondas obtidas a partir de procedimentos de microdissecção cromossômica. Quanto à família Triportheidae, a citogenética comparativa de espécies de Triportheus com outros grupos congenéricos, assim como com famílias irmãs, permitirá investigar a gênese evolutiva do sistema de cromossomos sexuais ZZ/ZW, característico de Triportheus, entre grupos aparentados. Significativamente, o compartilhamento de um mesmo sistema de cromossomos sexuais entre grupos irmãos poria em destaque a trajetória particular desta condição entre os peixes, revelando uma novidade evolutiva neste grupo biológico. Para tal fim serão empregados experimentos de CGH e de pintura cromossômica total (WCP) com sondas derivadas dos cromossomos sexuais Z e W de Triportheus. Por fim, a prospecção de genes associados aos cromossomos sexuais de Triportheus propiciará subsídios significativos para uma futura investigação de genes candidatos à determinação do sexo entre os peixes, um campo ainda altamente carente de conhecimento neste grupo biológico. Neste sentido, será utilizado o seqüenciamento de nova geração pelo método DARt-Seq, altamente informativo e ainda com aplicação inédita entre os peixes, em parceria com pesquisadores da Universidade de Canberra (Austrália). Assim sendo, os resultados esperados neste projeto deverão possibilitar avanços relevantes no tocante à evolução cariotípica e dos cromossomos sexuais, caracterização da biodiversidade críptica da nossa ictiofauna, suas relações evolutivas e sua composição genômica, tendo como ponto de partida os sólidos conhecimentos anteriores já adquiridos com os dois grupos modelos que embasam a presente proposta. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Luiz Antonio Carlos Bertollo - Coordenador / ORLANDO MOREIRA FILHO - Integrante / ELIANA FELDGERG - Integrante / Thomas Liehr - Integrante / Marcelo de Bello Cioffi - Integrante / Cássia Fernando Yano - Integrante / TARIK EZAZ - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Luiz Antonio Carlos Bertollo. |
| 7. | 2017-Atual. Evolucao cromossomica na familia Notopteridae (Teleostei, Osteoglossiformes) revelada por pintura cromossomica e Hibridizacao Genomica Comparativa (CGH). Descrição: Os peixes constituem um grupo extremamente importante para o estudo de uma série de questões evolutivas, considerando que apresentam a maior biodiversidade entre os vertebrados. De fato, uma vez que ocupam uma posição basal na filogenia dos vertebrados, estudos em espécies modelos contribuem para esclarecer diversas questões relacionadas com a organização do genoma e evolução dos vertebrados como um todo. Os peixes da ordem Osteoglossiformes representam um dos grupos mais primitivos de teleósteos restritos à água-doce, possuindo pelo menos um representante presente em cada um dos continentes do hemisfério sul, com a exceção da Antártica, sendo, portanto, um importante modelo para estudos biogeográficos. Dentro deste grupo, a família Notopteridae representa um grupo de grande interesse científico, assim como biogeográfico, considerando sua atual distribuição geográfica. Seus quatro gêneros estão distribuídos nos continentes Áfricano (Papyrocranus e Xenomystus) e Asiático (Chitala e Notopterus), em isolamento decorrente da separação de grandes massas continentais ocorrida há milhões de anos atrás. No presente projeto nós temos como objetivo utilizar a técnica de CGH (hibridização genômica comparativa) para explorar as diferenças genômicas interespecíficas entre estas espécies, estimando o grau de similaridade e variabilidade existente entre elas. Adicionalmente, a espécie Xenomystus nigri apresenta 2n=42 cromossomos nos machos e nas fêmeas, onde o cromossomo no. 1 corresponde ao maior par cromossômico já encontrado em toda a família Notopteridae. Neste sentido, trata-se de um cromossomo marcador que pode fornecer subsídios importantes para avaliar o quanto de homologia ainda persiste em relação a este cromossomo nas diferentes espécies dessa família. Esta ocorrência será investigada por procedimentos da Citogenética Molecular, incluindo a microdissecção cromossômica desse par marcador e a obtenção de sondas específicas do mesmo, com experimentos subseqüentes de pintura cromossômica por FISH multicolor (m-FISH) entre as espécies de Notopteridae. Assim sendo, a análise de representantes da família Notopteridae de diferentes continentes possibilitará uma abordagem geral do processo de evolução cariotípica ocorrido nesta família, contribuindo também com importantes subsídios filogenéticos. Adicionalmente, a execução do presente projeto propiciará a formação de recursos humanos na área, bem como a interação com pesquisadores nacionais e internacionais, a publicação de artigos científicos colaborativos e a internacionalização da pesquisa nacional. O presente projeto está vinculado a um projeto de pesquisa mais amplo intitulado: Uma abordagem intercontinental para a investigação da evolução cromossômica na ordem Osteoglossiformes (Teleostei: Osteoglossomorpha) que visa investigar espécies da desta ordem com o intuito de contribuir com a filogenia e o entendimento dos mecanismos de diversificação cromossômica neste grupo de peixes.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Marcelo de Bello Cioffi - Coordenador / Moreira-Filho, O. - Integrante / Bertollo, L A C - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Marcelo de Bello Cioffi. Descrição: Os peixes constituem um grupo extremamente importante para o estudo de uma série de#10;questões evolutivas, considerando que apresentam a maior biodiversidade entre os#10;vertebrados. De fato, uma vez que ocupam uma posição basal na filogenia dos#10;vertebrados, estudos em espécies modelos contribuem para esclarecer diversas questões#10;relacionadas com a organização do genoma e evolução dos vertebrados como um todo.#10;Os peixes da ordem Osteoglossiformes representam um dos grupos mais primitivos de#10;teleósteos restritos à água-doce, possuindo pelo menos um representante presente em#10;cada um dos continentes do hemisfério sul, com a exceção da Antártica, sendo, portanto, um importante modelo para estudos biogeográficos. Dentro deste grupo, a família Notopteridae representa um grupo de grande interesse científico, assim como#10;biogeográfico, considerando sua atual distribuição geográfica. Seus quatro gêneros estão distribuídos nos continentes Áfricano (Papyrocranus e Xenomystus) e Asiático (Chitala e Notopterus), em isolamento decorrente da separação de grandes massas continentais ocorrida há milhões de anos atrás. No presente projeto nós temos como objetivo utilizar a técnica de CGH (hibridização genômica comparativa) para explorar as diferenças genômicas interespecíficas entre estas espécies, estimando o grau de similaridade e variabilidade existente entre elas. Adicionalmente, a espécie Xenomystus nigri apresenta 2n=42 cromossomos nos machos e nas fêmeas, onde o cromossomo no. 1 corresponde ao maior par cromossômico já encontrado em toda a família Notopteridae. Neste sentido, trata-se de um cromossomo marcador que pode fornecer subsídios importantes para avaliar o quanto de homologia ainda persiste em relação a este cromossomo nas diferentes espécies dessa família. Esta ocorrência será investigada por procedimentos da Citogenética Molecular, incluindo a microdissecção cromossômica desse par marcador e a obtenção de sondas específicas do mesmo, com experimentos subseqüentes de pintura cromossômica por FISH multicolor (m-FISH) entre as espécies de Notopteridae. Assim sendo, a análise de representantes da família Notopteridae de diferentes continentes possibilitará uma abordagem geral do processo de evolução cariotípica ocorrido nesta família, contribuindo também com importantes subsídios filogenéticos. Adicionalmente, a execução do presente projeto propiciará a formação de recursos humanos na área, bem como a interação com pesquisadores nacionais e internacionais, a publicação de artigos científicos colaborativos e a internacionalização da pesquisa nacional. O presente projeto está vinculado a um projeto de pesquisa mais amplo intitulado: Uma abordagem intercontinental para a investigação da evolução cromossômica na ordem Osteoglossiformes (Teleostei: Osteoglossomorpha) que visa investigar espécies da desta ordem com o intuito de contribuir com a filogenia e o entendimento dos mecanismos de diversificação cromossômica neste grupo de peixes.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Luiz Antonio Carlos Bertollo - Integrante / Thomas Liehr - Integrante / Marcelo de Bello Cioffi - Coordenador / Cássia Fernando Yano - Integrante / Ahmed B Hamid Al-Rikabi - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Luiz Antonio Carlos Bertollo. |
| 8. | 2017-2017. GENETIC ASSESSMENTS FOR THE ENDANGERED BLACK LION TAMARIN LEONTOPITHECUS CHRYSOPYGUS (PRIMATES) Descrição: Fapesp Número de Processo 2017/11282-8 R$ 3.517,60 U$ 2.939,83. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Patrícia Domingues de Freitas - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de SP - Auxílio financeiro. Membro: Patricia Domingues de Freitas. |
| 9. | 2017-2109. Identificacao do papel das proteinas de choque termico HsfA e Hsp90 e do regulador SmiA na atividade da via da integridade da parede celular no fungo patogenico oportunista humano Aspergillus fumigatus Descrição: Projeto Regular FAPESP (2017/19694-3). Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Iran Malavazi - Coordenador / Felipe Roberti Teixeira - Integrante. Membro: Iran Malavazi. |
| 10. | 2017-Atual. INCT-HYMPAR. Hymenoptera parasitoides de moscasdasfrutas e o controle biologico (INCT Hympar) Descrição: O Hympar Sudeste é um centro de investigação e gestão da biodiversidade da Região Sudeste brasileira, idealizado para apoiar os esforços para o conhecimento da diversidade biológica brasileira e promover a sua sustentabilidade. O instituto trabalha sob a premissa de que a melhor maneira para conservar a biodiversidade é estudá-la, valorizá-la e aproveitar as oportunidades que esta oferece para melhorar a qualidade de vida do homem. Nesta ação, envolverá universidades, empresas, institutos de pesquisa e outras entidades públicas e privadas nacionais e internacionais.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Reinaldo Otávio Alvarenga Alves de Brito - Integrante / Manoel Martins Dias Filho - Integrante / Emeline Boni campanini - Integrante / Angélica Maria Penteado-Dias - Coordenador / Carlos Congrains - Integrante / Nelson Wanderley Perioto - Integrante / Lino Bittencourt Monteiro - Integrante. Número de orientações: 1 Membro: Reinaldo Otavio Alvarenga Alves de Brito. |
| 11. | 2017-2020. Inter-relacoes evolutivas da familia Erythrinidae. Citogenetica comparativa em Lebiasinidae, Ctenolucidae e Hepsetidae (Teleostei, Characiformes) Descrição: A ictiofauna Neotropical de água-doce apresenta uma enorme biodiversidade, com 71#10;famílias incluindo cerca de 4.500 espécies. Entretanto, às relações filogenéticas de muitos desses grupos encontram-se ainda por serem esclarecidas. Entre esses se encontra a família Erythrinidae, onde algumas propostas se mostram divergentes quanto aos grupos irmãos a ela associados. Nesta proposta está sendo enfocada a citogenética comparativa entre espécies de Erythrinidae, Lebiasinidae, Ctnolucidae e a africana Hepsetidae, considerando a possível proximidade evolutiva entre estas famílias. Marcadores cromossômicos decorrentes de análises citogenéticas clássicas, bandamentos cromossômicos, citogenética molecular pelo mapeamento de diferentes classes de DNA repetitivos e pintura cromossômica, serão utilizados como indicadores para as investigações propostas. Será dada ênfase na prospecção de cromossomos sexuais entre essas famílias, como importantes marcadores evolutivos. De fato, a diversidade de mecanismos de determinação do sexo entre os peixes, somada à ausência de cromossomos sexuais heteromórficos em muitas espécies, faz deste grupo um modelo ímpar para uma melhor compreensão dos processos evolutivos. Um grande acervo de dados citogenéticos de Erythrinidae já se encontra disponível em nosso grupo de pesquisa, incluindo sondas isoladas dos cromossomos sexuais, decorrente de nossos#10;estudos prévios com representantes desta família há longa data. Por outro lado, as#10;investigações cromossômicas em Lebiasinidae e Hepsetidae são ainda insipientes, onde#10;os dados a serem obtidos representarão informações inéditas para a citogenética evolutiva e a ictiologia. Assim sendo, a presente proposta possibilitará investigar estágios da diferenciação e evolução cromossômica entre grupos próximos, bem como gerar importantes subsídios para o conhecimento das relações evolutivas entre Lebiasinidae, Ctenolucidae, Hepsetidae e Erythrinidae, contribuindo para o embasamento de suas relações filogenéticas. Adicionalmente, será também propiciada a formação de recursos humanos, bem como a interação com pesquisadores nacionais e internacionais, a publicação de artigos científicos colaborativos e a internacionalização da pesquisa nacional.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Luiz Antonio Carlos Bertollo - Coordenador / ELIANA FELDGERG - Integrante / Thomas Liehr - Integrante / Marcelo de Bello Cioffi - Integrante / Cássia Fernando Yano - Integrante / Oladele Jezede - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Luiz Antonio Carlos Bertollo. |
| 12. | 2017-Atual. Investigacao de virus Zika e outros virus emergentes em metagenomas Descrição: Atualmente, o vírus Zika (ZIKV) é problema de saúde global, especialmente no Brasil onde tem sido associado a um aumento no número de casos de má formação fetal. Antes de ele se tornar pandêmico, este vírus circulou em ambientes silvestres na África e no sudeste asiático, causando epidemias localizadas nos anos de 2013 e 2014 nas ilhas do pacífico. A linhagem pandêmica deste vírus foi exportada da África ainda na primeira metade do século XX e permaneceu circulando silenciosamente até a primeira década do século XXI. Outros vírus transmitidos por mosquitos poderão emergir nos próximos anos, portanto pretendemos com o estudo aqui proposto, identificar vírus potencialmente emergentes que podem estar circulando silenciosamente na região de São Carlos e, assim como o ZIKV, linhagens podem ser selecionadas para serem melhor transmitidas em humanos. Portnato pretendemos neste projeto investigar por meio de metagenomas os vírus circulantes em mosquitos capturados na região de São Carlos, onde recentemente ocorreu uma epidemia de Dengue, o que demonstra que esta cidade pode vir a ser afetada brevemente por epidemias de Zika e outros arbovírus. Ademais, a grande quantidade de dados públicos disponível permite que uma análise computacional exaustiva seja realizada para buscar vírus potencialmente emergentes em milhares de metagenomas de diversos tecidos humanos. Diante disto, o presente projeto é justificado pela necessidade de se conhecer a dinâmica de tropismo tecidual e espalhamento espaço-temporal de vírus potencialmente emergentes como era o status do ZIKV até 2012. Em suma, objetivamos neste projeto identificar e descrever possíveis vírus pandêmicos emergentes que podem não ter sido previamente percebidos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Caio César de Melo Freire - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Caio Cesar de Melo Freire. |
| 13. | 2017-2019. Ocorrencia de mamiferos e invasao biologica em remanescentes de Cerrado de paisagens agricolas Descrição: A conservação de espécies fora de unidades de conservação (UCs) é uma crescente tendência da comunidade conservacionista, já que UCs não detém parcela majoritária dos remanescentes de habitat nativos. Nos últimos 50 anos, o Cerrado do estado de São Paulo passou por uma drástica transformação, tendo sido substituído inicialmente por pastagens e, depois, por extensos canaviais e, em menor escala, por silvicultura. Neste cenário de forte economia agrícola e crescente demanda por biocombustíveis, é imprescindível avaliar o grau de dependência da mastofauna aos remanescentes de Cerrado representados sobretudo pelas Áreas de Preservação Permanente (APPs) e Reservas Legais (RLs) imersas em matrizes agrícolas. A compreensão da relação entre degradação ambiental e preservação da comunidade biótica deve incluir, também, a investigação do processo de invasão biológica, já que sua dinâmica está intimamente relacionada com a degradação resultante da transformação da paisagem. Todavia, estudos com este enfoque em matrizes agrícolas ainda são incipientes no Brasil. Deste modo, este projeto tem como principais objetivos: 1) examinar a ocorrência de mamíferos, em particular de espécies negligenciadas e com relevante contribuição ecológica (tatus), em remanescentes de Cerrado imersos em paisagens dominadas por agrosilviculturas e 2) investigar concomitantemente o processo de invasão biológica examinando a ocorrência de três das principais espécies de mamíferos invasores no Brasil: lebre-europeia (Lepus europaeus), javali asselvajado (Sus scrofa) e cão-doméstico. O estudo envolverá paisagens agrícolas do interior de São Paulo e será baseado em dados provenientes de métodos amostrais complementares (armadilhas fotográficas e registro de rastros e de tocas em transecções). As análises envolverão modelos de ocupação em múltiplas escalas, possibilitando estimar a detecção separadamente por método (armadilha/transecção) e a ocupação em várias escalas espaciais. Selecionaremos para amostragem 72 paisagens de 200 ha cada, usando critérios que maximizem a variância da cobertura por remanescentes de vegetação nativa e minimizem a interferência de fatores não controlados. Adicionalmente, amostras biológicas (principalmente fezes) da lebre-europeia e do tapiti (Sylvilagus brasiliensis) serão examinadas com a finalidade de testar a viabilidade de registro e identificação destas espécies por meio de análises genéticas não invasivas. Este estudo pretende elucidar o papel de dois dos principais processos responsáveis pelo declínio da biodiversidade em paisagens da zona rural com forte economia agrícola. Os dados gerados têm, portanto, implicações não apenas para a conservação da fauna e flora nativas como também para a política e economia agrícola de maneira geral. Processo FAPESP 2016/19106-1. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Pedro Manoel Galetti Junior - Integrante / TORRES-FLOREZ, JUAN PABLO - Integrante / Adriano Garcia Chiearello - Coordenador / Danilo Boscolo - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Pedro Manoel Galetti Junior. |
| 14. | 2017-Atual. Plano de aplicacao dos recursos da RTI-FAPESP exercicio 2017 no Centro de Ciencias Biologicas e da Saude da Universidade Federal de Sao Carlos Descrição: Destina-se a aplicação do montante de RTI FAPESP do CCBS/UFSCar visando melhoria nas condições de pesquisa multiusuária.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Felipe Roberti Teixeira - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Felipe Roberti Teixeira. |
| 15. | 2017-Atual. Uma abordagem intercontinental para a investigacao da evolucao cromossomica na ordem Osteoglossiformes (Teleostei: Osteoglossomorpha). Parte II Descrição: A ordem Osteoglossiformes possui pelo menos um representante em cada um dos continentes do hemisfério sul, com a exceção da Antártica, sendo um modelo ímpar para a integração de estudos cromossômicos e biogeográficos. Entretanto, os dados cromossômicos em Osteoglossiformes são ainda escassos e restritos a poucas espécies. O presente projeto dará continuidade ao projeto anterior (FAPESP- 2014/23172-4), enfocando a biogeografia e a evolução cromossômica de espécies da ordem Osteoglossiformes, representativas de distintas regiões intercontinentais, contando com uma rede de colaboradores internacionais igualmente interessados nesta promissora abordagem. Especificamente em relação às famílias Arapaimidae e Notopteridae, nossos resultados anteriores destacaram uma grande variação cromossômica intrafamiliar, dando abertura para investigações genômicas e populacionais avançadas, aprofundando assim o conhecimento de suas inter-relações evolutivas. Assim sendo, em continuidade ao projeto inicial, objetivamos agora estudos inéditos na família Gymnarchidae e adicionais nas famílias Notopteridae e Arapaimidae. Para tanto, serão utilizadas abordagens de Citogenética Classica (coloração convencional e bandamento C) e da Citogenética Molecular, incluindo o mapeamento cromossômico de diferentes sequências repetitivas de DNA, hibridização genômica comparativa (CGH) e pintura cromossômica total (WCP) com sondas obtidas a partir de procedimentos de microdissecção cromossômica. Adicionalmente, será dado um passo significativo para a prospecção da variabilidade genética presente nas famílias investigadas pelo emprego do sequenciamento de nova geração DArT-Seq (Diversity Array Technology Sequencing), altamente informativo e ainda inédito entre os peixes. Aliada a este projeto encontra-se uma equipe integrada de pesquisadores de 05 países distintos, onde todos os 05 continentes encontram-se representados, somando esforços para a investigação que está sendo proposta e garantindo assim a sua exequibilidade. Os dados a serem obtidos constituirão uma base sólida para a continuidade dos estudos com as demais famílias de Osteoglossiformes, a fim de viabilizar uma ampla abordagem cromossômica nesta ordem, sua organização e diversificação genômica e sua biodiversidade. O modelo investigativo propiciado por este grupo, associado à sua ampla distribuição geográfica e à sua posição basal na filogenia dos peixes, fazem dele um importante objeto para estudos sistemáticos e evolutivos, possibilitando dimensionar o impacto da fragmentação dos continentes na sua história evolutiva, evidenciada ao nível de sua constituição cromossômica.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Marcelo de Bello Cioffi - Coordenador / Orlando Moreira Filho - Integrante / Bertollo, L A C - Integrante / Eliana Feldberg - Integrante / Terumi Hatanaka - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Marcelo de Bello Cioffi. Descrição: A ordem Osteoglossiformes possui pelo menos um representante em cada um dos continentes do hemisfério sul, com a exceção da Antártica, sendo um modelo ímpar para a integração de estudos cromossômicos e biogeográficos. Entretanto, os dados cromossômicos em Osteoglossiformes são ainda escassos e restritos a poucas espécies. O presente projeto dará continuidade ao projeto anterior (FAPESP- 2014/23172-4), enfocando a biogeografia e a evolução cromossômica de espécies da ordem Osteoglossiformes, representativas de distintas regiões intercontinentais, contando com uma rede de colaboradores internacionais igualmente interessados nesta promissora abordagem. Especificamente em relação às famílias Arapaimidae e Notopteridae, nossos resultados anteriores destacaram uma grande variação cromossômica intrafamiliar, dando abertura para investigações genômicas e populacionais avançadas, aprofundando assim o conhecimento de suas inter-relações evolutivas. Assim sendo, em continuidade ao projeto inicial, objetivamos agora estudos inéditos na família Gymnarchidae e adicionais nas famílias Notopteridae e Arapaimidae. Para tanto, serão utilizadas abordagens de Citogenética Classica (coloração convencional e bandamento C) e da Citogenética Molecular, incluindo o mapeamento cromossômico de diferentes sequências repetitivas de DNA, hibridização genômica comparativa (CGH) e pintura cromossômica total (WCP) com sondas obtidas a partir de procedimentos de microdissecção cromossômica. Adicionalmente, será dado um passo significativo para a prospecção da variabilidade genética presente nas famílias investigadas pelo emprego do sequenciamento de nova geração DArT-Seq (Diversity Array Technology Sequencing), altamente informativo e ainda inédito entre os peixes. Aliada a este projeto encontra-se uma equipe integrada de pesquisadores de 05 países distintos, onde todos os 05 continentes encontram-se representados, somando esforços para a investigação que está sendo proposta e garantindo assim a sua exequibilidade. Os dados a serem obtidos constituirão uma base sólida para a continuidade dos estudos com as demais famílias de Osteoglossiformes, a fim de viabilizar uma ampla abordagem cromossômica nesta ordem, sua organização e diversificação genômica e sua biodiversidade. O modelo investigativo propiciado por este grupo, associado à sua ampla distribuição geográfica e à sua posição basal na filogenia dos peixes, fazem dele um importante objeto para estudos sistemáticos e evolutivos, possibilitando dimensionar o impacto da fragmentação dos continentes na sua história evolutiva, evidenciada ao nível de sua constituição cromossômica.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Luiz Antonio Carlos Bertollo - Integrante / ELIANA FELDGERG - Integrante / ORLANDO MOREIRA FILHO - Integrante / TERUMI HATANAKA - Integrante / Marcelo de Bello Cioffi - Coordenador / Cássia Fernando Yano - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Luiz Antonio Carlos Bertollo. |
| 16. | 2017-Atual. Utilizacao de CTV (Citrus tristeza virus) como ferramenta para o silenciamento genico de cisteino peptidases de Diaphorina citri, inseto vetor do Huanglongbing (HLB) visando o controle da doenca em citrus Descrição: A citricultura brasileira é uma das mais importantes atividades agrícolas para a economia mundial. Os pomares de citros vêm sendo constantemente atacados por diversas pragas e patógenos, que causam sérios danos às plantas. A doença conhecida como Greening Huanglongbing (HLB) vem causando sérios prejuízos à citricultura. Esta doença é causada pela bactéria Candidatus Liberibacter spp (CLas) que coloniza os vasos do floema e é transmitida às plantas de citrus pelo inseto Diaphorina citri. Esse projeto tem ênfase no controle de D. citri e propõe o silenciamento gênico de cisteíno peptidases do inseto Diaphorina citri por RNA de interferência utilizando um vetor de expressão transiente baseado no Citrus tristeza vírus (CTV). A coincidente habitação no floema por Clas, D. citri e CTV permite o desenvolvimento de um sistema de expressão transiente para atenuar o HLB através de RNA de interferência (RNAi).. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . Integrantes: Andrea Soares da Costa Fuentes - Coordenador / William O Dawson - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Andrea Soares da Costa Fuentes. |
| 1. | 2016-2017. Auxilio FAPESP para publicacao de artigo Descrição: artigo para Plos One : quot;treA codifica para uma trealase com envolvimento na patogenicidade de Xanthomonas citri subsp. citriquot;. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Maria Teresa Marques Novo Mansur - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Maria Teresa Marques Novo Mansur. |
| 2. | 2016-2017. Auxilio FAPESP para publicacao de artigo Descrição: artigo publicado em Data in Brief intitulado quot;Interaction network and mass spectrometry data of Xanthomonas citri subsp. citri surface proteins from differential proteomic analysis of infectious and non-infectious cellsquot;. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Maria Teresa Marques Novo Mansur - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Maria Teresa Marques Novo Mansur. |
| 3. | 2016-Atual. Avaliacao da Expressao Imuno-histoquimica das Proteinas C-erB-B, p53, Instabilidade de Microssatelites e Mutacoes do K-RAS em Pacientes com Adenocarcinoma Colorretal Descrição: O câncer colorretal é uma doença com grande heterogeneidade e apresentação de tumores clinico-patológicos semelhantes, que apresentam às vezes respostas diferentes ao tratamento e sobrevida. Estas diferenças são apenas explicadas parcialmente com os conceitos atuais sobre os eventos moleculares. A instabilidade de microssatélites hoje é um importante fator de impacto prognóstico com um significativo potencial na classificação dos pacientes para a quimioterapia. Outros marcadores moleculares, que mostram o estado de alterações e mutações como as proteínas Braf ou Kras, p53 e cerb B2, atualmente estão sendo muito usados para orientar o prognostico e tratamento do câncer colorretal. Portanto, esperamos com esse trabalho poder contribuir para uma melhor classificação dos subtipos de tumores colorretais e colaborar com as pesquisas que contemplam a padronização e a caracterização deste tipo de tumor, propiciando terapias mais eficazes. O conhecimento dos fatores genéticos específicos para cada paciente, permitirá no futuro um tratamento mais individualizado, seja cirúrgico, seja quimioterapia ou radioterapia, resultando em um melhor prognóstico para o doente.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Maria Cristina da Silva Pranchevicius - Coordenador / Virgílio Ribeiro Guedes - Integrante. Membro: Maria Cristina da Silva Pranchevicius. |
| 4. | 2016-Atual. Caracterizacao funcional da E3 ubiquitina-ligase SCF(Fbxo7/PARK15) na via oncogenica Wnt e homeostase mitocondrial Descrição: Fbxo7 é uma das 69 proteínas do tipo F-box (Fbx) em humanos que interage com SKP1, Cullina e RBX para formar o complexo E3 ubiquitina-ligase denominado SCF(Fbxo7) que medeia ubiquitinação de seus substratos. A proteína Fbxo7 está diretamente associada a diferentes tipos de câncer, sendo expressa em linhagens de tumores epiteliais (adenocarcinoma colorretal e pulmão) mas não nesses tecidos normais. Além disso, quatro mutações em FBXO7/PARK15 (T22M, R378G, R481C e R498X) foram encontradas em pacientes com Doença de Parkinson (DP) que apresentavam deficiência no processo de mitofagia. Embora a SCF(Fbxo7) seja a quinta mais abundante E3 ligase do tipo SCF em humanos, apenas poucos substratos dessa E3 ligase são conhecidos e nenhum deles explica seu papel em processos associados a essas patologias. Utilizando microarranjos de proteínas (protoarrays) em reações de ubiquitinação in vitro, identificamos 366 novos substratos de SCF(Fbxo7), dos quais 3 (GSK3², TOMM20 e UXT) foram validados. Eles estão envolvidos na via Wnt, homeostase mitocondrial e sinalização via NF-ºB, respectivamente. Mapeamos a região de interação e as cadeias de ubiquitina que SCF(Fbxo7) introduziu em dois deles. Em GSK3² levou a sua inibição e consequente ativação da via Wnt por um mecanismo desconhecido. A poliubiquitinação de TOMM20 via lisina 63 é um sinal de regulação de sua função, mas seus efeitos na homeostase mitocondrial e mitofagia não foram avaliados. A presente proposta tem como objetivo caracterizar a relação funcional de Fbxo7 com TOMM20 e GSK3² nos processos de homeostase mitocondrial e via Wnt, respectivamente. Esperamos determinar os mecanismos de regulação desses processos por SCF(Fbxo7) e com isso contribuir com o entendimento dos mecanismos moleculares que vinculam essa E3 ligase ao câncer e Doença de Parkinson.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Felipe Roberti Teixeira - Coordenador / Gomes, Marcelo Damário - Integrante / Marcos Roberto Chiaratti - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Felipe Roberti Teixeira. |
| 5. | 2016-Atual. Epitranscriptomica no ciclo de vida de Apis mellifera Descrição: A epitranscriptômica é campo de investigação emergente dedicado ao estudo das modificações pós-transcricionais de moléculas de RNAs. Atualmente são conhecidas mais de 100 tipos de modificações de RNA, sendo as mais comuns e estudadas: N6 metiladenosina (m6A, metilação do nitrogênio N6 da adenosina) e 5-metilcitosina (m5C, metilação do carbono C5 da citosina). As modificações são reversíveis e geradas por uma maquinaria de enzimas writers (que realizam a modificação), readers (que reconhecem a modificação) e erasers (que removem a modificação). Tais modificações afetam a expressão gênica a nível pós-transcricional e regulam diversos processos como splicing alternativo, estabilidade de mRNAs, processamento de miRNAs, tradução CAP-independente, entre outros. A maquinaria epitranscriptômica também está relacionada com a regulação da expressão gênica, com o desenvolvimento dos organismos (incluindo a reprodução e a longevidade) e com respostas às variações ambientais. Nesse contexto, as abelhas Apis mellifera tornam-se um exímio modelo biológico em que podemos hipotetizar a ação de tal maquinaria, tanto nos processos de desenvolvimento associados à diferenciação de sexo (desencadeada pela haplodiploidia), ao polifenismo (diferenças entre as castas fêmeas, operárias e rainhas), ao polietismo etário (divisão de trabalho ao longo da vida adulta), quanto nas questões nutricionais e sociais aliadas à toda a plasticidade fenotípica intrínseca a todos estes eventos mencionados acima.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Francis de Morais Franco Nunes - Coordenador / Zilá Luz Paulino Simões - Integrante / Luana Bataglia - Integrante / Marcela Aparecida Framartino Bezerra Laure - Integrante. Número de produções C, T A: 10 Membro: Francis de Morais Franco Nunes. |
| 6. | 2016-Atual. Expressao genica no desenvolvimento adulto de operarias de Frieseomelitta varia Descrição: Processos moleculares que controlam as vias de desintoxicação e antioxidantes são de suma importância para os insetos que estão em contato com pesticidas, xenobióticos e patógenos, pois estes últimos algumas das causas do declínio global de polinizadores. As abelhas operárias são alvos diretos deste declínio. A fim de avançar o conhecimento sobre a biologia da abelha polinizadora Frieseomelitta varia, estamos investigando as variações da expressão gênica de genes de diferentes famílias e categorias funcionais, relacionados à progressão do desenvolvimento adulto (longevidade/envelhecimento e politeísmo temporal) e/ou envolvidos com mecanismos gerais de defesa (detoxificação/xenobióticos, antioxidantes e sistema imunológico) em operárias novas (0-5 dias), intermediárias (10-20 dias) e forrageiras (25-50 dias). Estamos focando nos seguintes genes: vitelogenina (Vg), esterase do hormônio juvenil (JHE), proteína de choque térmico 90 (HSP90), chico, foxo, kruppel, calponina (CAL), germ-cell expressed (GCE), hexamerinas (70a, 70b, 70c e 110), catalases (CAT), superóxido dismautases (SOD), citocromos P450 (6AQ1, 6AS5, MFE, Shade, Spook) e glutationa-S-transferases (GST-S1 e GST-S4).. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Francis de Morais Franco Nunes - Coordenador / Michael Christopher Jaskot - Integrante. Membro: Francis de Morais Franco Nunes. |
| 7. | 2016-Atual. FILOGEOGRAFIA DE PEIXES DAS BACIAS COSTEIRAS DO LESTE DO ESCUDO BRASILEIRO: ANOSTOMIDAE COMO MODELO DE ESTUDO Descrição: As bacias costeiras são ecossistemas que estão sendo ameaçados pela expansão das atividades humanas, bem como pelas mudanças climáticas. A situação fica pior se considerado o alto nível de endemismo que elas apresentam. Apesar dessas ameaças, os estudos em diversidade de peixes das bacias costeiras são ainda escassos, especialmente com ferramentas moleculares. A família Anostomidae e em especial o gênero Leporinus são elementos conspícuos da ictiofauna brasileira. O projeto visa ajudar no entendimento da grande diversidade de espécies e das relações evolutivas do grupo. Além disso, os Anostomidae oferecem uma oportunidade para entender os processos históricos que levaram a diversificação da ictiofauna das bacias hidrográficas costeiras. Nossa hipótese é que o padrão de distribuição filogeográfica seja resultante de dois principais processos: as conexões entre rios contíguos por flutuações no nível do mar e as capturas de cabeceiras com as bacias adjacentes não costeiras. Além dos resultados científicos, o projeto irá permitir a consolidação de parcerias no Brasil, e no exterior, particularmente com a California Academy of Sciences, um centro de excelência no estudo da ictiofauna e suas relações biogeográficas. O projeto também permitirá a formação de novos recursos humanos, que terão oportunidade de combinar métodos moleculares clássicos e de última geração no estudo da filogeografia de peixes.Processo CNPq 405309/2016-3. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Pedro Manoel Galetti Junior - Coordenador / Jorge Luis Ramirez Malaver - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Pedro Manoel Galetti Junior. |
| 8. | 2016-Atual. Influencia Da Citroterapia Na Producao De Prostaglandinas De Mulheres Saudaveis Durante A Menstruacao Descrição: As PGF2#945; e a PGE2, muito produzidas durante a menstruação, são vasoconstritoras e possivelmente participam da contração do endométrio, causando dor uterina intensa, conhecida como dismenorreia. Dependendo da intensidade, as cólicas menstruais podem ser controladas pelo uso de anti-inflamatórios não hormonais por meio do bloqueio da síntese de PGs. Entretanto, esse tipo de opção terapêutica produz efeitos colaterais que podem restringir sua utilização por longos períodos. Neste sentido, a utilização de produtos fitoterápicos vem sendo proposta como alternativa para o controle dos sintomas inflamatórios. O limão Taiti (Citrus latifolia) tem se mostrado eficaz no controle dos efeitos da menstruação em mulheres que apresentam ciclos desregulados. Entretanto, os mecanismos de atuação não são conhecidos mas, a inibição da cascata de produção dos ácidos araquidônicos é uma das possibilidade. Deste modo, pretende-se estudar o efeito da citroterapia a base de suco do limão Taiti na produção de PGs e na expressão gênica de transcritos envolvidos nas vias de síntese das PGs em mulheres saudáveis durante a menstruação. Para isso, serão convidadas mulheres voluntárias normais (n=45) em período fértil e na faixa etária entre 18 a 40 anos de idade. Para realização da pesquisa, as voluntárias serão divididas de forma aleatória em três grupos em função do tipo de estimulação a que serão expostas: Grupo Limão (G1, n=15), Grupo Meloxican (G2, n=15) e Grupo Controle (G3, n=15), o qual não sofrerá intervenção. O sangue menstrual e total serão coletados e utilizados para dosagem plasmática de PGE2 e PGF2#945; a fim de comparar o efeito uterino e sistêmico da citroterapia. Por outro lado, pretende-se realizar cultura de células sanguíneas (periférico) estimulada ou não com LPS para analisar a atividade regulatória do limão na expressão gênica de transcritos envolvidos na via de síntese das PGs como, por exemplo, IL-1#946;, IL-6, TNF-#945;, AKR1B1 e AKR1C3.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Ricardo Carneiro Borra - Integrante / PRISCILA MARIA ANDRADE - Coordenador / Maria Fátima das Graças Fernandes da Silva - Integrante / Maristela Carbo - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Ricardo Carneiro Borra. |
| 9. | 2016-Atual. Isolamento de microssatelites e de SNPs em Garca-vaqueira (Bubulcus ibis, Ardeidae, Aves) e sua aplicacao em estudos familiais e populacionais Descrição: Essa proposta objetiva isolar novos marcadores genético, do tipo microssatélites e SNPs (Polimorfismos de nucleotídeo único) e aplicá-los juntamente com dados mitocondriais nos estudos familiais e populacionais da garça-vaqueira (Bubulcus ibis). Dados de sequências mitocondriais já levantados nas populações africanas de garças vaqueiras e nos seus hemoparasitas serão usados para análise filogeográfica comparativa, visando verificar se ocorreu co-evolução ou não. O painel dos microssatélites polimórficos será ampliado com o uso dos dados gerados pelo sequenciamento de próxima geração( NGS). Os SNPs serão identificados pelo método GBS (Genotipagem pelo Sequenciamento). Os genótipos nesses novos locos de microssatélites serão identificados em todos integrantes das 30 famílias, parentais e filhotes e o parentesco será verificado pela análise mendeliana e pela análise de máxima verossimilhança. Será confirmada ou não a ocorrência de comportamentos alternativos à monogamia (Fertilização Extra-par e Parasitismo de Ninho Intraespecífico). A análise filogenética será realizada utilizando duas abordagens: a não-paramétrica de Máxima de Parcimônia (MP) e a paramétrica de Máxima Verosimilhança ( MV) e a hipótese de co-evolução do parasita e hospedeiro será testada pelo teste da Incongruência da diferença do comprimento no programa PAUP. Os genótipos nos locos de microssatélites serão levantados em quatro populações africanas e em uma representativa do Brasil para averiguar o nível de diversidade genética dessas populações e se elas se diferenciam geneticamente. O método Approximate Bayesian Computation (ABC), o qual tem como base o cálculo de probabilidade usando estatísticas sumárias e simulações será aplicado aos dados de microssatélites e DNA mitocondrial nas populações africanas e brasileiras para verificar qual modelo melhor explica a entrada dessa ave no continente americano. Os dados dos SNPs serão usados nas mesmas amostras populacionais e será determinado o nível de diversidade e de estruturação genética entre elas. Os resultados das análises populacionais com os diversos tipos de marcadores moleculares ( mitocondrial, microssatélites e SNPs) serão comparados entre si e é esperado obter um grau muito mais alto de discriminação populacional com os SNPs. Os resultados populacionais permitirão inferir se o fluxo de entrada de aves no Brasil é contínuo ou se há um grau de diferenciação e isolamento entre os dois continentes, esclarecendo se o resultado obtido anteriormente é ou não um artefato devido à baixa variação dos locos usados.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Silvia Nassif Del Lama - Coordenador / Carolina Isabel Miño - Integrante / Talita Alvarenga Valdes - Integrante / Fagner Miguel Silva - Integrante. Membro: Silvia Nassif Del Lama. |
| 10. | 2016-2018. Isolamento, caracterizacao molecular e estudo da expressao genica em linhagens de Saccharomyces cerevisiae resistentes a altas temperaturas e altas concentracoes de etanol Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Anderson Ferreira da Cunha - Coordenador / MALAVAZI, I. - Integrante. Membro: Anderson Ferreira da Cunha. |
| 11. | 2016-Atual. The role of DBF4 in homologous recombination and genomic stability Descrição: O objetivo desse estudo é obter novos conhecimentos sobre a instabilidade genômica, o desenvolvimento de cânceres e a sobrevida celular. Em colaboração com o Dr. Roberto Pezza do Oklahoma Medical Research Foundation-Cell Cycle and Cancer Biology Research Program-USA, pretende-se estudar o papel da Dbf4 na recombinação homóloga, na manutenção da estabilidade genômica e no desenvolvimento de cânceres.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Maria Cristina da Silva Pranchevicius - Coordenador / Roberto Jose Pezza - Integrante / Michel Guiraldelli - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa. Membro: Maria Cristina da Silva Pranchevicius. |
| 1. | 2015-Atual. A genome wide view of the evolutionary processes shaping genetic variation in natural populations Descrição: Explaining the presence of genetic variation in fitness related traits is a fundamental problem in evolutíonary genetics because we expect selection to erode such variation. So why then do we see 50 much genetic varialíon? One particularly striking example is lhe high genetic variabilily we typically observe for success in social interactions, a trail that has clear fitness consequences. To understand the presence of genetic variation, in the context of social interactions, we propose to employ a uníquely powerful integration of computational, genomíc and experimental approaches using the social amoeba D. discoideum. Specifically, we will: 1) Identify molecular variation underlying natural variation in social and non-social traits using high throughput phenotyping and genome sequencing of natural isolates, providing unprecedented insights lnto genetic architecture in natural microbial populations. 2) Understand the importance of pleiotropy in shaping variation by examining different fitness related traits to determine the degree to which lraits presumed to be under selection are controlled y lhe same loci, providing insights into the genetic constralnts (trade-offs) Ihat shape pattems of varíatíon. 3) Validate the causal role of genes associated with natural trait varialion by generating gene knock-out and allelic replacement straíns to experimentally confirm lhe causal influence and pleiotropic effects of genes putatively underlying natural genetic diversity. 4) Examine signatures of selection on social and non-social genes to understand the processes shaping diversily in genes identified by association analyses as well as those predicted or previously confirmed to play a role in social and non-social traits by experimental approaches.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Reinaldo Otávio Alvarenga Alves de Brito - Coordenador / Jason Barry Wolf - Integrante / Hurst, Lawrence - Integrante / Christopher Thompson - Integrante / Joan E. Strassmann - Integrante / David Queller - Integrante. Financiador(es): Biotechnology and Biological Sciences Research Council - Auxílio financeiro / (FAPESP) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 1 Membro: Reinaldo Otavio Alvarenga Alves de Brito. |
| 2. | 2015-Atual. A via de sinalizacao Hippo e sua relacao com a nutricao e o envelhecimento em operarias adultas da abelha Apis mellifera Descrição: O envelhecimento é um processo complexo, tempo-dependente, mas não está necessariamente relacionada à idade, mas a uma falência progressiva de funções biológicas. A nutrição é fator ambiental que impacta diretamente o metabolismo e o tempo de vida. Abelhas são modelos biológicos interessantes para se investigar a relação nutrição-envelhecimento. Em particular, as operárias da espécie Apis mellifera apresentam divisão de trabalho (e, portanto, transições comportamentais) que se modifica ao longo da vida adulta. Operárias jovens se alimentam de uma dieta rica em proteínas, enquanto operárias se alimentam de uma dieta a base de carboidratos. Na transição comportamental, há uma remodelação tecidual morfologicamente observável, sugerindo a participação de genes da via de sinalização Hippo. A via Hippo é evolutivamente conservada entre invertebrados e vertebrados, e seus componentes regulam o crescimento de tecidos e tamanhos de órgãos. Neste projeto, buscamos investigar os perfis de expressão de genes da via Hippo (Yorkie, Hippo, Warts, Mats, Salvador, Expanded e Cyclin E1) em cérebro, corpo gorduroso e glândulas hipofaringeanas de operárias de 7 dias submetidas a diferentes dietas, e nos mesmos tecidos de operárias nutridoras (7 dias) e forrageiras (28 dias).. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) . Integrantes: Francis de Morais Franco Nunes - Coordenador / Marina Muniz Prado Uhle - Integrante / Fernanda Camila Sanches - Integrante. Membro: Francis de Morais Franco Nunes. |
| 3. | 2015-2018. Caracterizacao funcional do gene YpkA, o homologo the YPK1 de levedura no fungo patogeno oportunista humano Aspergillus fumigatus Descrição: Edital Universal CNPq 14/2014 Faixa A - Processo número 462383/2014-8. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Iran Malavazi - Coordenador / Anderson Ferreira da Cunha - Integrante / Edson Rodrigues Filho - Integrante / Taicia Pacheco Fill - Integrante. Membro: Iran Malavazi. |
| 4. | 2015-Atual. Caracterizacao Molecular da Resistencia ao Antibioticos e dos Fatores de Virulencia em Bacterias Isoladas de Pacientes em Unidades de Terapia Intensiva (UTIs) e em Infeccoes de Pes de Pacientes com Diabetes (DFI). Descrição: O surgimento e a disseminação da resistência antimicrobiana tornou-se um grande problema de saúde pública, na comunidade e no mundo. Os pacientes na Unidade de Terapia Intensiva (UTI) e as lesões em pés de pacientes diabéticos (Diabetes foot infections-DFI) são frequentemente colonizados/as por bactérias multidrogas resistentes (MDR). Portanto, o objetivo deste estudo é determinar os fatores de risco associados a estes tipos de infecções, caracterizar a nível molecular as bactérias encontradas nas UTIs e em DFI, e também entender a epidemiologia dessas cepas. Com isso, pretendemos auxiliar na tomada de decisões terapêuticas e no controle dessas infecções.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Maria Cristina da Silva Pranchevicius - Coordenador. Membro: Maria Cristina da Silva Pranchevicius. |
| 5. | 2015-2017. COMPARATIVE GENOMIC OF CAPTIVE AND WILD BLACK TAMARINS (Leontopithecus chrysopygus). Processo CNPq 234435/2014-3 Descrição: CNPq Número de Processo 234435/2014-3 Abstract: Leontopithecus chrysopygus, known as black lion tamarin, is endemic from the Atlantic rainforest of Sao Paulo State (Brazil) and, at the present time, is considered endangered by the International Union for Conservation of Nature (IUNC). Currently, it is estimated that there are just a thousand wild individuals, which are distributed in small fragments with low demographic density and that are under threat of local extinction. There are over 50 animals maintained in captivity in different institutions of Brazil and other countries, which reported difficulty in reproducing them. Considering this, efforts have been taken to produce a data set enable to support and foment policies for the conservation of L. chrysopygus. A National Plan for Conservation of Mammals from Central Atlantic rainforest, created by ICMBio-MMA (Instituto Chico Mendes de Conservação da Biodiversidade-Ministério do Meio Ambiente), claims the importance of ecological, behavioral and mainly genetic studies. According to One Plan strategy, recommended by Conservation Breeding Specialist Group of IUCN, an approach for in situ and ex situ conservation would be to integrate all data in a unique platform. This should consider the development of conservation and management actions based on wild and captive animal researches. Thus, this project proposal aims to characterize the genome of L. chrysopygus species by next generation sequencing and search genomic differences between wild and captive individuals. The existence of signs of selection could be associated with diverse adaptation mechanisms in these environments. Such data would be useful to help the implementation of scientific basis to establish a conservation-integrated program for black tamarin species. The long term goal of this project, therefore, is to promote protocols for maintenance and reproduction of captive animals and, also, reintroduce them into the wild.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . Integrantes: Patrícia Domingues de Freitas - Coordenador / Laurence Culou - Integrante / Carlos Daniel Bustamante - Integrante / Luis L Coutinho - Integrante / ANDRADE, SÓNIA C.S. - Integrante / Gabriela Rezende - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Membro: Patricia Domingues de Freitas. |
| 6. | 2015-2018. Cuidado Materno em camundongos LG/J e SM/J: aspectos transgeracionais e reprodutivos Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado profissional: (2) . Integrantes: Andréa Cristina Peripato - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Andrea Cristina Peripato. |
| 7. | 2015-2020. Diferenciacao Cariotipica e Cromossomos Sexuais em Erythrinidae e Triportheidae. Pintura Cromossomica e Mapeamento de DNAs Repetitivos. Descrição: A diversidade de mecanismos de determinação do sexo em peixes, somada à ausência de cromossomos sexuais heteromórficos em muitas espécies, faz deste grupo um modelo ímpar para compreender melhor os processos evolutivos dos cromossomos sexuais em vertebrados, considerando que os peixes ocupam a posição basal na filogenia deste grupo. Na família Erythrinidae ocorrem espécies com sistemas de cromossomos sexuais simples ou múltiplos, nascentes ou já bem diferenciados, ao lado de espécies desprovidas de cromossomos sexuais heteromórficos. Hoplias malabaricus representa um provável complexo de espécies dentre os Erythrinidae, com 02 grupos evolutivos distintos, ou seja, o Grupo I composto por 04 cariomorfos (A-D) e o Grupo II composto por 03 cariomorfos (E-G). O relacionamento evolutivo dos cromossomos sexuais nos cariomorfos do Grupo I já foi bem caracterizado em estudos prévios. No presente projeto, estão sendo enfocados cariomorfos do Grupo II, onde há indícios de um provável sistema XX/XY em estágio inicial de diferenciação no cariomorfo F, possivelmente relacionado com o sistema XX/XY1Y2 característico do cariomorfo G. Por outro lado, as espécies do grupo Hoplias lacerdae apresentam características evolutivas completamente divergentes de H. malabaricus, com conservação cromossômica numérica e estrutural e sem ocorrência de cromossomos sexuais diferenciados. Tal fato é particularmente de destaque, por se tratarem de grupos congenéricos, portanto estreitamente relacionados dentro da mesma família. Por sua vez, os peixes do gênero Triportheus, da família Characidae, são caracterizados por um notável sistema ZZ/ZW de cromossomos sexuais, presente em todas as espécies até então analisadas. Dados disponíveis têm apontado para a origem comum deste sistema nesse gênero, demonstrando uma estreita relação entre o processo de diferenciação do cromossomo W e o acúmulo de diferentes tipos de DNAs repetitivos. Assim sendo, excelentes cenários evolutivos são oferecidos pelos modelos presentes em H. malabaricus, H. lacerdae e Triportheus. No presente projeto serão utilizados procedimentos da moderna citogenética molecular, incluindo a microdissecção cromossômica e experimentos de pintura cromossômica pela técnica de FISH multicolor (m-FISH), assim como o mapeamento cromossômico de diferentes sequências repetitivas em espécies representativas desses grupos, buscando aprofundar e elucidar aspectos fundamentais da diferenciação dos cromossomos sexuais e cariotípica entre os peixes, constribuindo também com importantes subsídios para o entendimento da evolução dos cromossomos sexuais nos vertebrados como um todo.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . Integrantes: Luiz Antonio Carlos Bertollo - Coordenador / WAGNER FRANCO MOLINA - Integrante / Thomas Liehr - Integrante / Marcelo de Bello Cioffi - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Membro: Luiz Antonio Carlos Bertollo. |
| 8. | 2015-2017. Estudo da relacao da via da integridade da parede celular e de genes de resposta ao estresse termico no fungo patogenico humano Aspergillus fumigatus Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Iran Malavazi - Coordenador / Anderson Ferreira da Cunha - Integrante / Júlio Cesar Borges - Integrante / Lisandra Marques Gava Borges - Integrante. Membro: Iran Malavazi. |
| 9. | 2015-Atual. ESTUDOS DO COMPORTAMENTO REPRODUTIVO DE BUBULCUS IBIS Descrição: Essa proposta aplica duas novas abordagens, uma ecológica e outra genética ao estudo do comportamento reprodutivo de B. íbis para comprovar geneticamente se há ocorrência de fertilização extra-par (FEP) e parasitismo de ninho intraespecífico ( PNI) na espécie. Para obtenção de sangue de famílias completas de garça vaqueira (parentais e prole) será padronizado e aplicado o método de ?seringas vivas? que prevê a obtenção de sangue dos adultos, no período de incubação, com uso de ovos falsos contendo triatomídeos vivos e em jejum dentro.Ampliação do o painel dos microssatélites polimórficos está sendo proposto com o isolamento de novos locos, a partir dos dados gerados pelo sequenciamento de próxima geração que simplifica esse procedimento.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Silvia Nassif Del Lama - Coordenador / Carolina Isabel Miño - Integrante / Talita Alvarenga Valdes - Integrante / Elaine Dantas Souza - Integrante. Membro: Silvia Nassif Del Lama. |
| 10. | 2015-2017. Evolucao Cariotipica e de Cromossomos Sexuais em Peixes Neotropicais Descrição: Os peixes constituem um modelo para a análise e a compreensão de diversos processos evolutivos nos vertebrados, considerando a posição basal que ocupam neste grupo. Dentre os peixes da família Erythrinidae, Hoplias malabaricus representa um provável complexo de espécies, com 02 grandes grupos (I e II) diferenciáveis quanto à composição cariotípica. Pelo menos 04 cariomorfos (A-D) constituem o Grupo I e 03 cariomorfos (E-G) constituem o Grupo II. Uma diversidade de sistemas de cromossomos sexuais encontra-se presente nesta espécie nominal, incluindo cromossomos sexuais em estágios iniciais de diferenciação, cromossomos sexuais já bem diferenciados, bem como a ausência de cromossomos sexuais heteromórficos. Contrariamente, um padrão oposto de evolução cariotípica parece caracterizar o grupo Hoplias lacerdae, com evidências de conservação numérica e estrutural e ausência de cromossomos sexuais heteromórficos. Tal contraste evolutivo é particularmente notável, considerando tratar-se de grupos congenéricos. O relacionamento evolutivo dos cromossomos sexuais nos cariomorfos do Grupo I de H. malabaricus foi analisado e caracterizado em nossos estudos prévios (Processo FAPESP no. 2012/01778-2). O presente projeto objetiva a continuidade das abordagens evolutivas no gênero Hoplias, enfatizando agora cariomorfos do Grupo II de H. malabaricus e espécies componentes do grupo H. lacerdae. A emergência de um provável sistema XX/XY no cariomorfo F de H. malabaricus, assim como sua correlação com a diferenciação do sistema XX/XY1Y2, presente no cariomorfo G, será investigada sob o enfoque da moderna Citogenética Molecular. Por sua vez, espécies do grupo H. lacerdae serão investigadas quanto ao padrão de sua evolução cariotípica, à luz de diferentes marcadores cromossômicos e da recente revisão taxonômica realizada neste grupo. Paralelamente, os peixes do gênero Triportheus (Characidae) tem sido objeto de estudos em nosso grupo de pesquisa há vários anos. Suas espécies compartilham um notável sistema de cromossomos sexuais ZZ/ZW, provavelmente basal para o grupo, evidenciando a conservação do cromossomo Z e o acúmulo de diferentes classes de DNA repetitivo no cromossomo W. Além de expandir tais abordagens evolutivas a espécies ainda não estudadas deste gênero, o presente projeto também enfocará a diferenciação evolutiva do cromossomo sexo-específico (cromossomo W), pela prospecção de sua homologia entre diferentes espécies ao nível da pintura cromossômica. Assim sendo, excelentes cenários evolutivos são encontrados nos modelos presentes em H. malabaricus, H. lacerdae e Triportheus, os quais serão investigados por procedimentos da Citogenética Molecular, incluindo a microdissecção cromossômica, experimentos de pintura cromossômica por FISH multicolor (m-FISH) e o mapeamento cromossômico de diferentes sequências repetitivas de DNA. Os resultados esperados possibilitarão aprofundar o conhecimento da evolução cariotípica e da biodiversidade de nossa ictiofauna, particularmente no tocante à diferenciação dos cromossomos sexuais e à caracterização de complexos de espécies.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . Integrantes: Luiz Antonio Carlos Bertollo - Coordenador / ORLANDO MOREIRA FILHO - Integrante / WAGNER FRANCO MOLINA - Integrante / Thomas Liehr - Integrante / Marcelo de Bello Cioffi - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Luiz Antonio Carlos Bertollo. |
| 11. | 2015-Atual. Uma abordagem intercontinental para a investigacao da evolucao cromossomica na ordem Osteoglossiformes (Teleostei: Osteoglossomorpha) Descrição: Os peixes de água doce representam um modelo importante dos estudos biogeográficos, considerando que apresentam dispersão limitada e que cada continente pode, portanto, apresentar uma fauna particular. Os Osteoglossiformes representam um dos grupos mais primitivos de teleósteos e possuem pelo menos um representante em cada um dos continentes do hemisfério sul, com a exceção da Antártica, sendo um importante modelo para estudos biogeográficos. Tal distribuição pode ter contribuído para a diversidade presente neste grupo, provavelmente pela necessidade das espécies se adaptarem aos diferentes ambientes onde ocorrem. Trata-se, portanto, de um grupo de grande interesse científico, assim como econômico, considerando sua ampla utilização no consumo humano assim como no comércio aquarista, com espécies exóticas de grande valor comercial. Entretanto, os estudos citogenéticos nos Osteoglossiformes são ainda bastante escassos e, basicamente, restringem-se à descrição de números cromossômicos, com raras exceções, sendo necessária uma investigação cromossômica mais pormenorizada para que se possa melhor esclarecer e compreender o processo evolutivo ocorrido neste grupo. Neste sentindo, nossa proposta engloba a investigação cromossômica de espécies da ordem Osteoglossiformes, representativas de distintas regiões intercontinentais, contando com uma rede de colaboradores internacionais igualmente interessados nesta promissora abordagem. Numa primeira instância serão enfocadas espécies de 03 das 06 famílias integrantes da ordem Osteoglossiformes, pertencentes às famílias Pantodontidae, Notopteridae e Arapaimidae, por procedimentos de Citogenética Classica (coloração convencional e Bandamento C) e da Citogenética Molecular, incluindo o mapeamento cromossômico de diferentes sequências repetitivas de DNA como marcadores, com o intuito de investigar a diversificação cromossômica associada aos eventos evolutivos desse grupo, contribuindo também com importantes subsídios filogenéticos. Assim sendo, aliada a este projeto encontra-se uma equipe formada por pesquisadores de 04 países distintos, incluindo o Brasil, somando esforços para a investigação que está sendo proposta, viabilizando assim uma ampla abordagem da citogenética evolutiva na ordem Osteoglossiformes, retratando sua organização e diversificação genômica e sua biodiversidade.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (3) . Integrantes: Marcelo de Bello Cioffi - Coordenador / Orlando Moreira Filho - Integrante / Eliana Feldberg - Integrante / Luiz Antonio Carlos Bertollo - Integrante / Cassia Fernanda Yano - Integrante / Arunrat Chaveerach - Integrante / Alongklod Tanomtong - Integrante / Tariq Ezaz - Integrante / Petr Rab - Integrante / Ezequiel Aguiar de Oliveira - Integrante / Alexandr Sember - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Marcelo de Bello Cioffi. Descrição: Os peixes de água doce representam um modelo importante dos estudos biogeográficos, considerando que apresentam dispersão limitada e que cada continente pode, portanto, apresentar uma fauna particular. Os Osteoglossiformes representam um dos grupos mais primitivos de teleósteos e possuem pelo menos um representante em cada um dos continentes do hemisfério sul, com a exceção da Antártica, sendo um importante modelo para estudos biogeográficos. Tal distribuição pode ter contribuído para a diversidade presente neste grupo, provavelmente pela necessidade das espécies se adaptarem aos diferentes ambientes onde ocorrem. Trata-se, portanto, de um grupo de grande interesse científico, assim como econômico, considerando sua ampla utilização no consumo humano assim como no comércio aquarista, com espécies exóticas de grande valor comercial. Entretanto, os estudos citogenéticos nos Osteoglossiformes são ainda bastante escassos e, basicamente, restringem-se à descrição de números cromossômicos, com raras exceções, sendo necessária uma investigação cromossômica mais pormenorizada para que se possa melhor esclarecer e compreender o processo evolutivo ocorrido neste grupo. Neste sentindo, nossa proposta engloba a investigação cromossômica de espécies da ordem Osteoglossiformes, representativas de distintas regiões intercontinentais, contando com uma rede de colaboradores internacionais igualmente interessados nesta promissora abordagem. Numa primeira instância serão enfocadas espécies de 03 das 06 famílias integrantes da ordem Osteoglossiformes, pertencentes às famílias Pantodontidae, Notopteridae e Arapaimidae, por procedimentos de Citogenética Classica (coloração convencional e Bandamento C) e da Citogenética Molecular, incluindo o mapeamento cromossômico de diferentes sequências repetitivas de DNA como marcadores, com o intuito de investigar a diversificação cromossômica associada aos eventos evolutivos desse grupo, contribuindo também com importantes subsídios filogenéticos. Assim sendo, aliada a este projeto encontra-se uma equipe formada por pesquisadores de 04 países distintos, incluindo o Brasil, somando esforços para a investigação que está sendo proposta, viabilizando assim uma ampla abordagem da citogenética evolutiva na ordem Osteoglossiformes, retratando sua organização e diversificação genômica e sua biodiversidade.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (4) . Integrantes: Luiz Antonio Carlos Bertollo - Integrante / ELIANA FELDGERG - Integrante / ORLANDO MOREIRA FILHO - Integrante / Marcelo de Bello Cioffi - Coordenador / ARUNRAT CHAVEERACH - Integrante / ALONGKLOD TANOMTONG - Integrante / TARIK EZAZ - Integrante / PETR RAB - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Luiz Antonio Carlos Bertollo. |
| 1. | 2014-Atual. A Matriz Extracelular No Envelhecimento, No Exercicio E No Microambiente Tumoral Descrição: A matriz extracelular (MEC) é uma estrutura de suporte dos diferentes tecidos, constituída por uma complexa rede de macromoléculas tais como colágenos, glicosaminoglicanos e proteoglicanos. A MEC fornece o volume, tamanho e a força dos tecidos, além de ser a base de sustentação para o crescimento, divisão e a migração celular. No entanto, a função da MEC vai bem mais além de estrutural e de suporte mecânico. A MEC influencia ativamente o comportamento celular, a polaridade celular, migração, diferenciação, proliferação e sobrevivência das células, fornecendo sinais que são transmitidos ao citoesqueleto e determinando o destino das células. Estudos de larga escala e de interações moleculares evidenciaram o papel importante da MEC e de suas relações com as células em inúmeros processos fisiológicos e patológicos. O desenho de fármacos dirigidos para a interação das celulas com a MEC representa uma nova área na fronteira do conhecimento. Neste projeto reunimos um conjunto de pesquisadores com experiência comprovada em trabalhos com a MEC para contribuirmos associadamente ao conhecimento das funções da MEC nos processos do envelhecimento, do exercicio como forma de prevenção dos efeitos deletérios do envelhecimento, e no cancer, considerando-se a evidente importância destas duas temáticas (exercício e câncer) na longevidade dos seres humanos. Serão utilizados ensaios in vitro (cultura de células), in vivo (em humanos e modelos animais) e ex vivo (tecidos humanos e de animais) para análises de expressão gênica por diferentes técnicas em pequena e média escala.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (8) . Integrantes: Ricardo Carneiro Borra - Integrante / PRISCILA MARIA ANDRADE - Integrante / Heloísa Sobreiro Selistre de Araújo - Coordenador / Helena Bonciani Nader - Integrante / Keico Okino Nonaka - Integrante / Marcelo Andrade de Lima - Integrante / Márcia Regina Cominetti - Integrante / Sergio Eduardo De Andrade Perez - Integrante / Stela Márcia Mattiello - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Ricardo Carneiro Borra. |
| 2. | 2014-Atual. A nutricao influencia a longevidade de abelhas Apis mellifera? Descrição: Chamada MCTI/CNPq/Universal 14/2014 - Faixa A - R$ 30.000,00#10;Número do Processo: 461711/2014-1#10;Vigente desde 18/11/2014. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Francis de Morais Franco Nunes - Coordenador / Zilá Luz Paulino Simões - Integrante / Felipe Martelli - Integrante / Daniel Guariz Pinheiro - Integrante / Luciano Zane Filho - Integrante / Luana Bataglia - Integrante / Igor de Souza Santiago - Integrante / Fernanda Camila Sanches - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 16 / Número de orientações: 4 Membro: Francis de Morais Franco Nunes. |
| 3. | 2014-Atual. Aspectos Geneticos e Epigeneticos comportamentais Descrição: Temos desenvolvido pesquisas envolvendo aspectos genéticos e epigenéticos associados ao cuidado materno em camundongos e também a fatores reprodutivos em primatas.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado profissional: (2) . Integrantes: Andréa Cristina Peripato - Coordenador / Isabela Midori Watanabe - Integrante / Patrícia Hergert Bacher - Integrante / Beatriz Cabrera Santana - Integrante / Natália Marques Rosa - Integrante / Lara Boschesi Constantino - Integrante / Wilson Lau Junior - Integrante / Melissa Freitas da Silva - Integrante / Isabela dos Santos Begnami - Integrante. Membro: Andrea Cristina Peripato. |
| 4. | 2014-Atual. Capivaras, carrapatos e febre maculosa Descrição: A Febre Maculosa Brasileira (FMB), causada pela bactéria Rickettsia rickettsii, é a doença transmitida por carrapatos de maior importância médica na América Latina. No interior do estado de São Paulo, as áreas endêmicas para FMB estão associadas à presença de capivaras, hospedeiros primários para o carrapato Amblyomma cajennense, vetor de R. rickettsii nessas áreas. No entanto, há muitas outras áreas em que populações de A. cajennense são mantidas por capivaras, mas não há ocorrência de FMB. Há também áreas com A. cajennense e capivaras, em que por um determinado momento não havia endemicidade da doença; porém, com o passar dos anos, essas áreas passaram a ser endêmicas. Visando esclarecer essas lacunas da epidemiologia da doença, o presente projeto está composto por 9 subprojetos, que visam estabelecer as relações ecológicas da febre maculosa, o carrapato vetor e a capivara. Para tal, populações de capivaras, carrapatos e a fauna silvestre e doméstica associada serão estudados paralelamente por 4 anos consecutivos em 3 áreas endêmicas e 3 áreas não endêmicas para FMB no estado de São Paulo, e em duas áreas de alta diversidade no bioma Pantanal. Além disso, diversos estudos de infecção experimental de carrapatos e capivaras com o agente da FMB serão realizados para simular situações de campo. Os resultados obtidos deverão permitir um entendimento da dinâmica da infecção por R. rickettsii e ocorrência da FMB no estado. Por fim, será criado um modelo matemático sobre a circulação de R. rickettsii nas populações de carrapatos e capivaras, que deverá indicar a taxa mínima de reprodução das capivaras para que haja uma manutenção da infecção por R. rickettsii nas populações de carrapatos. Este modelo terá aplicação direta nos programas de manejo de controle de capivaras, como forma de prevenir novos casos de FMB nas áreas endêmicas, e ao mesmo tempo, impedir que áreas não endêmicas se tornem endêmicas com o passar dos anos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Pedro Manoel Galetti Junior - Integrante / Katia Maria Paschoaletto Micchi de Barros Ferraz - Integrante / Marcelo Bahia Labruna - Coordenador / Fernando Ferreira - Integrante / Adriano Pinter dos Santos - Integrante / Alexandre Reis Percequillo - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Pedro Manoel Galetti Junior. |
| 5. | 2014-2017. Desvendando estrutura e funcoes da proteina TRAP-1 humana Descrição: As chaperonas moleculares da família Hsp90 são consideradas indispensáveis no controle de qualidade do enovelamento e no enovelamento per se de proteínas em virtualmente todos os organismos (Taipale et a., 2010). Suas propriedades estrutura-função, regulação por ciclos sequenciais de hidrólise de ATP, e exigência de co-chaperonas para manter a estabilidade, a maturação e tráfego subcelular de proteínas-clientes têm sido objeto de intenso interesse. O reconhecimento de que o controle de qualidade exercido pelas chaperonas moleculares na proteostase muitas vezes é subvertido em doenças humanas, incluindo câncer (Whitesell et al., 2005), pode fornecer oportunidades terapêuticas importantes (Trepel et al., 2010). Outro aspecto que acrescenta mais complexidade a esta rede, é o papel da Hsp90 em organelas e microambientes subcelulares (Young et al., 2003). As Hsp90 especializadas residentes do retículo endoplasmático (ER) (Eletto et al., 2010) e mitocôndrias (Felts et al., 2000) estão sendo reconhecidas, não só como orquestradores subcelulares do controle de qualidade do enovelamento de proteínas, mas também como centros para alcance das vias de sinalização da homeostase celular. A proteína de choque térmico da família Hsp90 específica da mitocôndria TRAP-1 (Tumor Necrosis Factor Receptor-Associated Protein-1) está relacionada a circuitos de sinalização da integridade da organela e a homeostase celular. A TRAP-1 atua no enovelamento de proteínas compartimentadas. Este circuito operacional é amplamente explorado no câncer e em doenças neurodegenerativas. Entretanto, pouco ainda é conhecido sobre a relação estrutura-função da TRAP-1, de seus fatores regulatórios e, principalmente, poucos compostos inibidores específicos capazes de atuarem dentro da mitocôndria são conhecidos. Estas observações mostram que a TRAP-1 representa novas oportunidades para a intervenção terapêutica em seres humanos e para isto conhecer os seus detalhes de mecanismo e função se fazem necessários. Esse projeto visa caracterizar a TRAP-1 humana recombinante, relacionando informações estruturais a seu funcionamento na célula. Além disso, pretende-se caracterizar sua interação com proteínas parceiras e clientes, já identificadas, no intuito de compreender seus processos de regulação de sua função. MCTI/CNPQ/Universal 14/2014 . Processo: 460178/2014-8. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) . Integrantes: Lisandra Marques Gava Borges - Integrante / Lisandra Marques Gava - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Lisandra Marques Gava Borges. |
| 6. | 2014-2016. Efeito dos treinamentos aerobico, resistido e combinado na producao de citocinas inflamatorias, adipocinas, e danos teciduais em modelo experimental de diabetes mellitus tipo 2 Descrição: Projeto Regular FAPESP. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Iran Malavazi - Integrante / Ana Cláudia Garcia de Oliveira Duarte - Coordenador / Fernanda de Freitas Anibal - Integrante / Cynthia Aparecida de Castro - Integrante. Membro: Iran Malavazi. |
| 7. | 2014-Atual. Entendendo a evolucao atraves da genomica comparada: o caso dos carnivoros sul-americanos Descrição: O crescente avanço na genômica comparada nos tem permitido conhecer mais detalhadamente os padrões de variação entre as espécies de vertebrados e invertebrados. Estes esforços têm sido muito facilitado pelos custos rapidamente decrescentes da coleta de dados, pelas melhores ferramentas de análise e pelo número crescente de genomas de referência de qualidade. Podemos, por exemplo, aplicar essas ferramentas genômicas em abordagens comparativas entre espécies modelos para abordar algumas das questões que tem intrigado os geneticistas ao longo de décadas, tais como: quais genes estão envolvidos na adaptação e quais os tipos de variação genética são responsáveis pela criação de novas espécies? Além disso, medidas mais eficientes e diretas da expressão de genes permitem a análise de todo o genoma de organismos não-modelo, que podem ser explorados em um contexto natural, iniciando o campo da genômica ambiental. O poder da genômica comparada está fundamentado no contraste de dados de diferentes períodos do tempo evolutivo (períodos de divergências entre as espécies) e poderá ser facilitado quanto maior for a disponibilidade de sequências de referência de qualidade de linhagens ancestrais e de táxons irmãos, permitindo a interpretação de fenótipos novos e derivados, bem com dos padrões genéticos a eles associados. Nosso objetivo, no presente projeto, é sequenciar todo o genoma de sete espécies de carnívoros da América do Sul, puma (Puma concolor), jaguarundi (P. yagouaroundii), jaguatirica (Leopardus pardalis), gato-maracajá (Leopardus wiedii), cachorro-do-mato (Cerdocyon thous), cachorro vinagre (Speothos venaticus) e lobo-guará (Chrysocyon brachyurus) (o genoma destas duas últimas espécies já está em desenvolvimento por colaboradores deste projeto) e proceder a uma análise comparativa das sequências genômicas, incluindo as sequencias já existentes de outros carnívoros. O principal objetivo será comparar os padrões de variação genética entre as espécies, para compreender a diversificação e especiação padrões dos carnívoros sul-americanos. Nossa hipótese, relacionada a esse objetivo, é que os padrões de assinaturas de seleção irão variar entre as espécies, em genes específicos que refletem diferenças morfológicas, comportamentais e ecológicas, bem como nos mecanismos de isolamento comportamental e reprodutivo e na especiação. Outro objetivo importante de nosso trabalho está relacionada à obtenção de uma gama muito ampla de novos marcadores (microssatélites e SNPs), os quais serão fundamentais para estudos filogeográficos e genético-populacionais de alta resolução. Os resultados deste projeto irão fornecer novos elementos para futuras abordagens teóricas, particularmente sobre adaptação e especiação, bem como novas abordagens para o manejo e a conservação dessas importantes espécies. Processo CNPq 401401/2014-. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Pedro Manoel Galetti Junior - Coordenador / Eduardo Eizirik - Integrante / Jorge Luis Ramirez Malaver - Integrante / Bruno Henrique Saranholi - Integrante / Karen Giselle Rodriguez - Integrante / JOHNSON, WARREN E. - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Pedro Manoel Galetti Junior. |
| 8. | 2014-2016. Monitoramento e Diagnostico Laboratorial para Coqueluche nos Hospitais de Referencia do Estado do Tocantins Descrição: Pretende-se analisar os casos de coqueluche suspeitos e cofirmados, nos municípios do estado do Tocantins, através do isolamento da bactéria Bordetella pertussis e relacioná-los com a cobertura vacinal.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: / Mestrado profissional: (1) . Integrantes: Maria Cristina da Silva Pranchevicius - Coordenador / Roumayne Lopes Ferreira - Integrante. Membro: Maria Cristina da Silva Pranchevicius. |
| 9. | 2014-Atual. O comportamento de guarda do macho e garantia de paternidade da prole feminina? A Historia Natural, a morfologia da espermateca e a genetica familial e populacional de especies de Trypoxylon Latreille, 1796 (Hymenoptera: Crabronidae). Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Marco Antonio Del Lama - Coordenador / Lúcio Antonio de Oliveira Campos - Integrante / Antonio Carlos Bragato Bergamaschi - Integrante / Camila Pereira Sabadini - Integrante / Isabel Cristina de Godói - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Marco Antonio Del Lama. |
| 10. | 2014-Atual. Potencializacao da Atividade Antitumoral das Celulas BAK e NK Contra o carcinoma urotelial de bexiga Descrição: O câncer de bexiga representa a quarta causa de óbito nos idosos. A imunoterapia baseada no bacilo de Calmette-Guerin (BCG) tem sido usada desde 1976 como tratamento de escolha no câncer superficial de bexiga. A ação antitumoral do BCG é evidenciada por até 6 a 12 meses após a aplicação. A resposta imunológica celular é responsável pelo efeito prolongado e tardio da terapia intravesical. Os infiltrados granulomatosos suburoteliais, que aparecem após a instilação, exercem papel de órgãos linfóides secundários, ativando as células imunologicamente ativas contra as células tumorais e produzindo células memórias. Dentre as células de defesa parece que a destruição tumoral é mediada principalmente por linfócito CD8+CD56+ conhecido como BCG activated killer cells (BAK). A produção dessas células é dependente da secreção de interleucinas do tipo Th1. Neste contexto, esse projeto tem como objetivo estudar os mecanismos intrínsecos e extrínsecos que possam potencializar a atividade#10;antitumoral das células BAK e NK contra o carcinoma urotelial de bexiga.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Ricardo Carneiro Borra - Coordenador / Andrade, Priscila M - Integrante. Membro: Ricardo Carneiro Borra. |
| 11. | 2014-2014. Reparo de Freezer -80 oC Descrição: Projeto para custear o reparo de freezer -80 oC do laboratório de Imunologia Aplicada. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Ricardo Carneiro Borra - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Ricardo Carneiro Borra. |
| 12. | 2014-Atual. Sequenciamento e analise do genoma de Frieseomelitta varia: em busca de assinaturas moleculares da evolucao das abelhas e insercao do Brasil no i5K Descrição: O Consórcio Internacional i5K tem a meta de sequenciar o genoma de 5.000 espécies de insetos e outros artrópodes nos próximos 5 anos. Esse volume de dados e o conhecimento gerado nos ajudará a compreender melhor a história evolutiva das espécies e os níveis de complexidade biológica. As abelhas são, de longe, os mais importantes polinizadores em ecossistemas agrícolas e naturais. No entanto, o recente colapso das populações de abelhas, ameaça este equilíbrio. Uma estratégia promissora para contornar este risco é a criação em larga escala destes polinizadores. Contudo esta ferramenta é altamente dependente do profundo conhecimento dos sistemas biológicos em questão. Embora algumas abelhas tenham sido, por décadas, importantes organismos para estudos de plasticidade de comportamento, comunicação, aprendizado e memória, muitos aspectos da biologia destes importantes insetos são ainda desconhecidos. Nosso Grupo de Pesquisa tem por objetivo sequenciar e analisar o genoma de uma abelha nativa sem ferrão, Frieseomelitta varia. A espécie F. varia possui ampla distribuição, com ninhos abundantes em diferentes biomas no Brasil. Devido à sua fácil criação em ninhos racionais de meliponicultura, F. varia possui grande potencial polinizador tanto para agri- e horticulturas, como também para plantas nativas em áreas de proteção. Pelo sequenciamento dessa espécie também estaremos inseridos oficialmente na iniciativa i5K. Além de gerar informações genômicas para F. varia, que será uma das primeiras espécies de meliponídeos incluída em projetos genoma de abelhas, vamos comparar este genoma com o da abelha Apis mellifera em busca de semelhanças e diferenças que justifiquem as modificações na morfologia, fisiologia e comportamento destas abelhas. O amplo conhecimento da biologia das abelhas sem ferrão terá como consequência natural contribuições práticas e tecnológicas com repercussões econômicas e ecológicas.O estudo genômico de Frieseomelitta varia dará acesso a informações de caráter mais aplicado,especialmente relacionadas à capacidade de polinização. A médio e longo prazos, essas informaçõespoderão ser aplicadas para o desenvolvimento de programas de melhoramento genético, produção agrícola e conservação ambiental.Os dados de sequenciamento de Frieseomelitta varia nos permitirão identificar: (i) genes relacionados à origem e manutenção da socialidade, (ii) redes de interação gênica que conduzem a vias de desenvolvimento casta-específicas, (iii) a base genética da infertilidade em abelhas operárias, (iv) alvos moleculares relacionados à regulação de comportamentos, especialmente de polinização, e (v) substâncias de interesse econômico (mel, própolis), farmacológico e terapêutico. Além disto, análises de genômica comparativa com a abelha Apis mellifera permitirão identificar semelhanças e diferenças que justifiquem as modificações na morfologia, fisiologia e comportamento destas abelhas. Não menos importante, pretendemos avançar nas análises in silico de tal maneira que possamos contribuir efetivamente para o avanço no conhecimento destas espécies tão importantes para nosso ecossistema.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (5) / Doutorado: (9) . Integrantes: Francis de Morais Franco Nunes - Integrante / Márcia Maria Gentili Bitondi - Coordenador / Zilá Luz Paulino Simões - Integrante / Alexandre dos Santos Cristino - Integrante / Anete Pedro Lourenço - Integrante / Angel Roberto Barchuk - Integrante / Alexandre Rossi Paschoal - Integrante / Carlos Gustavo Nunes Silva - Integrante / Daniel Guariz Pinheiro - Integrante / Marco Antonio Del Lama - Integrante / Klaus Hartmann Hartfelder - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 1 Membro: Francis de Morais Franco Nunes. |
| 1. | 2013-2017. A funcao de genes que codificam fosfatases na virulencia e na patogenicidade de Aspergillus fumigatus Descrição: Projeto Temático FAPESP. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Iran Malavazi - Integrante / Goldman, G. H. - Coordenador / Taísa Magnani Dinamarco - Integrante. Membro: Iran Malavazi. |
| 2. | 2013-Atual. A via de sinalizacao Hippo e diferenciacao de castas em abelhas Apis mellifera Descrição: As larvas fêmeas de Apis mellifera se diferenciam em rainhas ou operárias dependendo da alimentação que recebem. As rainhas (consomem geleia real) crescem mais rápido e tornam-se adultas reprodutoras. Já as operárias (consomem mistura de pólen, geleia real e mel) crescem mais lentamente, tornam-se adultas facultativamente estéreis e apresentam polietismo etário. Estes eventos de diferenciação são regulados por cascatas de sinalização gênica e hormonal, e suspeitamos que a via Hippo participe. Trata-se de uma via evolutivamente conservada que controla o crescimento e o tamanho de tecidos e órgãos. O objetivo deste estudo é investigar a expressão de genes desta via (Yorkie, Hippo, Warts, Mats, Salvador, Expanded e Cyclin E1) ao longo do desenvolvimento e diferenciação das castas.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) . Integrantes: Francis de Morais Franco Nunes - Coordenador / Marina Muniz Prado Uhle - Integrante / Fernanda Camila Sanches - Integrante. Número de produções C, T A: 2 Membro: Francis de Morais Franco Nunes. |
| 3. | 2013-2017. Abordagens moleculares para estudo da biologia e busca de alvos para controle dos coleopteros Sphenophorus levis e Migdolus fryanus, duas pragas da cultura canavieira Descrição: Este projeto trata da busca de canas-de-açúcar mais resistentes ao ataque de pragas (em particular coleópteros), estudando genes e proteínas da cana-de-açúcar envolvidos em defesa (principalmente cistatinas), e desenvolvendo plantas transgênicas superexpressando estes genes. A partir de estudos transcriptômicos do coleóptero Sphenophorus levis geramos milhares de etiquetas de sequências expressas (ESTs), e cDNAs completos, que agora compõem um ótimo banco de dados em nosso laboratório. Estes estudos permitiram eleger alguns genes alvo para utilização da abordagem de silenciamento de RNA (RNAi), um dos temas deste projeto. Além disso, com o surgimento das técnicas de sequenciamento de nova geração, resolvemos aprofundar estes estudos para gerar resultados mais amplos. Por outro lado, iniciamos estudos com uma nova praga da cana-de-açúcar, o Migdolus fryanus, um outro coleóptero que tem causado prejuízo para a cultura canavieira. Desta forma, a presente proposta está dividida em dois sub-projetos, descritos separadamente. Este projeto trata da utilização da abordagem de RNAi em Sphenophorus levis, dando continuidade aos estudos iniciados há alguns anos no laboratório e incluem o desenvolvimento de plantas transgênicas produzindo RNA de interferência contra genes alvo de S.levis identificados na proposta anterior. Também realizaremos estudos transcriptômicos em Migdolus fryanus (via RNA-Seq), com objetivo de selecionar genes para silenciamento.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (4) / Doutorado: (3) . Integrantes: Flavio Henrique da Silva - Coordenador / Andrea SoaresCosta - Integrante / Danilo Evangelista - Integrante / HABRYLO, OLIVIER - Integrante / PELLOUX, JÉRÔME - Integrante. Membro: Flavio Henrique da Silva. |
| 4. | 2013-2016. ANOTACAO GENOMICA E VALIDACAO POPULACIONAL DE SSR-EST E SNP-EST PARA IDENTIFICACAO DE GENES CANDIDATOS NO CAMARAO MARINHO LITOPENAEUS VANNAMEI (PENAEIDAE, DECAPODA). Fapesp Processo N 12/17322-8 Descrição: Litopenaeus vannamei é conhecido como camarão branco do Pacífico, sendo a principal espécie de peneídeo comercializada no mundo. Apesar de seu excelente desempenho em cativeiro, há uma preocupação constante em manejar adequadamente os plantéis. Os endocruzamentos e a diminuição nos níveis de diversidade genética podem comprometer a adaptação dos animais frente a condições adversas. Neste contexto, marcadores moleculares contidos em regiões expressas do genoma (EST, Expressed Sequence Tags), como os microssatélites ou SSR (Simple Sequence Repeats) e os SNP (Single Nucleotide Polymorphisms), podem ser úteis para acessar a variabilidade genética dos plantéis, identificar locos relacionados a traços de interesse e auxiliar no estabelecimento de programas de monitoramento e melhoramento genético. O desenvolvimento do Projeto Genoma EST do camarão L. vannamei (ShEST) possibilitou a caracterização de milhares de SSR-EST e SNP-EST, sendo grande que parte desses marcadores ainda não foi avaliada populacionalmente nem tampouco possui o com seu produto gênico elucidado. Assim, este trabalho objetiva a descrição dos produtos protéicos e de suas possíveis vias metabólicas, além da validação de marcas SSRs e SNPs, obtidas de ESTs do BD de Projeto ShEST, em linhagens selecionadas para crescimento e resistência. Com base nos produtos descritos na anotação genômica, alguns locos que estiverem contidos em genes de interesse serão selecionados para verificação de uma possível associação fenótipo x genótipo. Todos os cruzamentos e mensurações das características de performance serão conduzidos pelas empresas de produção de pós-larva responsáveis pelos programas de cruzamento seletivo. Com este trabalho esperamos disponibilizar um conjunto de informações eficientes para auxiliar no manejo e monitoramento dos estoques desta espécie cultivada no Brasil, e que também possam ser utilizadas em estudos com outras espécies de camarão, as quais consistem em importante recurso sócio-econômico e ecológico.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Patrícia Domingues de Freitas - Coordenador / JOÃO ROCHA - Integrante / JORGE MANUEL DE OLIVEIRA FERNANDES - Integrante / PEDRO MANOEL GALETTI JUNIOR - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Patricia Domingues de Freitas. |
| 5. | 2013-2014. Analise genomica e transcriptomica de linhagens termotolerantes e etanol resistentes de Saccharomyces cerevisiae isoladas durante o processo de producao de etanol ? construcao de plataformas biologicas para uso industrial Descrição: Auxílio à Pesquisa - Parceria para Inovação Tecnológica - PITE/FAPESP. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Iran Malavazi - Integrante / Anderson Ferreira da Cunha - Coordenador. Membro: Iran Malavazi. |
| 6. | 2013-2015. Analises cromossomicas classicas e moleculares em peixes Parodontidae (Characiformes): enfase em DNAs repetitivos Descrição: Parodontidae é um grupo de peixes Neotropicais com taxonomia problemática devido à falta de caracteres morfológicos diagnósticos fortes para um correto agrupamento filogenético de seus representantes, sendo constituído por três gêneros: Parodon; Apareiodon e Saccodon. Esta família conta com 32 espécies válidas distribuídas na América do Sul e parte do Panamá, exceto nas bacias costeiras do Atlântico Sul, Patagônia e canal do rio Amazonas. O número diploide de 54 cromossomos tem sido conservado entre os Parodontidae. Entretanto, já foi observada a presença de cromossomos supranumerários, diversidade na fórmula cariotípica, variação no número e localização de sítios de rDNA 18S e 5S, diferenças no padrão de distribuição de heterocromatina e na localização e número de sítios do DNA satélite pPh2004, e presença/ausência de cromossomos sexuais morfologicamente diferenciados. Os estudos citogenéticos em Parodontidae têm permitido um melhor esclarecimento sobre questões taxonômicas, avanços no entendimento da estrutura cromossômica, melhor compreensão sobre os processos de evolução cromossômica, a identificação de espécies e sinonímias. Recentemente, uma análise cromossômica em nove taxa de Parodontidae permitiu inferências sobre a filogenia do grupo. Análises cromossômicas em Parodontidae são encontradas apenas para espécies das bacias dos rios Iguaçu, Paraguai, Paraná e São Francisco. As bacias hidrográficas do Tocantins-Araguaia (Centro-Oeste brasileiro) e do rio Uruguai (Sul do Brasil) apresentam um alto nível de endemismo de espécies de peixes. Contudo, estudos citogenéticos envolvendo espécies desta área ainda são restritos. Considerando o número de espécies pertencentes à família Parodontidae e a importância do endemismo da ictiofauna destas bacias, estudos cromossômicos nestas regiões, inexistentes até o presente momento, auxiliarão na resolução de problemas taxonômicos da família, além de contribuírem para o estabelecimento de um modelo de evolução cromossômica neste grupo. Nesta família de peixes, são conhecidos também eventos cromossômicos co-relacionados aos DNAs repetitivos, mas ainda pouco compreendidos, justificando um aprofundamento no tocante a esta classe de DNA, como: (1) o significado de extensivos domínios heterocromáticos em algumas espécies, (2) a função de DNAs repetitivos dispersos e in tandem nos cromossomos sexuais e, (3) a própria origem e a diversificação de sistemas de cromossomos sexuais no que diz respeito a composição dos DNA repetitivos. Diante deste aspecto, a caracterização de DNAs repetitivos será útil no entendimento da diversificação cariotípica de Parodontidae.#10;Além dos objetivos já mencionados, a atual proposta visa contribuir com a formação de recursos humanos nos Programas de Pós-Graudação em Genética e Evolução da Universidade Federal de São Carlos e Programa de Pós-Graduação em Biologia Evolutiva da Universidade Estadual de Ponta Grossa. Com isto espera-se implementar novas tecnologias e aumentar o impacto dos artigos publicados, assim como, atuar na formação/orientação de alunos de mestrado/doutorado. #10;#10;Palavras chave: citogenética, incertezas taxonômicas, FISH, DNAs satélites, evolução cromossômica. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (5) Doutorado: (8) . Integrantes: Orlando Moreira Filho - Coordenador / Elisangela Bellafornte - Integrante / Artoni, R.F. - Integrante / Bertollo, L A C - Integrante / Schemberger, Michelle Orane - Integrante / Cioffi, M. B. - Integrante / Vicari, M. R. - Integrante / Traldi, Josiane Baccarin - Integrante / PUCCI, MARCELA BAER - Integrante / Geovana Cassia Malimpensa - Integrante / Kaline Ziemniczak - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 1 / Número de orientações: 2 Membro: Orlando Moreira Filho. Descrição: Parodontidae é um grupo de peixes Neotropicais com taxonomia problemática devido à falta de caracteres morfológicos diagnósticos fortes para um correto agrupamento filogenético de seus representantes, sendo constituído por três gêneros: Parodon; Apareiodon e Saccodon. Esta família conta com 32 espécies válidas distribuídas na América do Sul e parte do Panamá, exceto nas bacias costeiras do Atlântico Sul, Patagônia e canal do rio Amazonas. O número diploide de 54 cromossomos tem sido conservado entre os Parodontidae. Entretanto, já foi observada a presença de cromossomos supranumerários, diversidade na fórmula cariotípica, variação no número e localização de sítios de rDNA 18S e 5S, diferenças no padrão de distribuição de heterocromatina e na localização e número de sítios do DNA satélite pPh2004, e presença/ausência de cromossomos sexuais morfologicamente diferenciados. Os estudos citogenéticos em Parodontidae têm permitido um melhor esclarecimento sobre questões taxonômicas, avanços no entendimento da estrutura cromossômica, melhor compreensão sobre os processos de evolução cromossômica, a identificação de espécies e sinonímias. Recentemente, uma análise cromossômica em nove taxa de Parodontidae permitiu inferências sobre a filogenia do grupo. Análises cromossômicas em Parodontidae são encontradas apenas para espécies das bacias dos rios Iguaçu, Paraguai, Paraná e São Francisco. As bacias hidrográficas do Tocantins-Araguaia (Centro-Oeste brasileiro) e do rio Uruguai (Sul do Brasil) apresentam um alto nível de endemismo de espécies de peixes. Contudo, estudos citogenéticos envolvendo espécies desta área ainda são restritos. Considerando o número de espécies pertencentes à família Parodontidae e a importância do endemismo da ictiofauna destas bacias, estudos cromossômicos nestas regiões, inexistentes até o presente momento, auxiliarão na resolução de problemas taxonômicos da família, além de contribuírem para o estabelecimento de um modelo de evolução cromossômica neste grupo. Nesta família de peixes, são conhecidos também eventos cromossômicos co-relacionados aos DNAs repetitivos, mas ainda pouco compreendidos, justificando um aprofundamento no tocante a esta classe de DNA, como: (1) o significado de extensivos domínios heterocromáticos em algumas espécies, (2) a função de DNAs repetitivos dispersos e in tandem nos cromossomos sexuais e, (3) a própria origem e a diversificação de sistemas de cromossomos sexuais no que diz respeito a composição dos DNA repetitivos. Diante deste aspecto, a caracterização de DNAs repetitivos será útil no entendimento da diversificação cariotípica de Parodontidae. Além dos objetivos já mencionados, a atual proposta visa contribuir com a formação de recursos humanos nos Programas de Pós-Graudação em Genética e Evolução da Universidade Federal de São Carlos e Programa de Pós-Graduação em Biologia Evolutiva da Universidade Estadual de Ponta Grossa. Com isto espera-se implementar novas tecnologias e aumentar o impacto dos artigos publicados, assim como, atuar na formação/orientação de alunos de mestrado/doutorado. Palavras chave: citogenética, incertezas taxonômicas, FISH, DNAs satélites, evolução cromossômica .. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (3) . Integrantes: Luiz Antonio Carlos Bertollo - Integrante / ORLANDO MOREIRA FILHO - Coordenador / ROBERTO FERREIRA ARTONI - Integrante / Marcelo Ricardo Vicari - Integrante / Elizângela Bellafronte da Silva - Integrante / Michelle Orane Schemberger - Integrante / Marcelo de Bello Cioffi - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Luiz Antonio Carlos Bertollo. |
| 7. | 2013-Atual. Desenvolvimento de cana-de-acucar transgenica resistente ao inseto Migdolus fryanus Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Andrea Soares da Costa Fuentes - Coordenador / Flavio Henrique-Silva - Integrante / Helaine Carrer - Integrante. Membro: Andrea Soares da Costa Fuentes. |
| 8. | 2013-Atual. Efeitos da deltametrina na acetilcolinesterase muscular de Brycon amazonicus Descrição: Nos últimos anos tem-se tentado utilizar inseticidas menos tóxicos para mamíferos e menos persistentes no ambiente, dessa forma os piretroides estão sendo amplamente utilizados. Contudo, alguns estudos indicam que estes inseticidas apresentam um efeito extremamente forte em organismos não alvos como os aquáticos. A deltametrina, piretroide tipo II, é altamente tóxica para crustáceos e peixes mesmo em pequenas concentrações. Ela age inibindo os receptores nicotínicos da acetilcolina, nos canais Ca+2 voltagem-dependente e nos canais de Na+2 voltagem-dependente das membranas neuronais. Os peixes são muito sensíveis a vários xenobióticos, e dessa forma podem ser utilizados como forma de monitorar a poluição ambiental gerada pelos resíduos tóxicos. Para tal monitoramento são utilizados os biomarcadores, que podem indicar as respostas biológicas causadas por xenobióticos em um organismo. Dentre eles a enzima acetilcolinesterase, responsável por hidrolisar o neurotransmissor acetilcolina em colina e acetato, é um biomarcador utilizado para verificar os efeitos neurotóxicos de um xenobiótico. O objetivo deste trabalho é avaliar os efeitos da deltametrina na atividade da acetilcolinesterase muscular, após 4, 24 e 48 horas de exposição à deltametrina em Brycon amazonicus, matrinxã. Os peixes serão expostos à 0,26µg/L de deltametrina (10% da CL;50) em sistemas de tanques "in door" e após o período de exposição, os animais serão anestesiados e sacrificados para a retirada de músculo branco, onde serão feitas as analises da atividade enzimática da acetilcolinesterase.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Gilberto Moraes - Coordenador / Camila Soares Pigão - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa. Membro: Gilberto Moraes. |
| 9. | 2013-Atual. ESTIMATIVAS DE TAMANHO POPULACIONAL EFETIVO E CENSO POPULACIONAL EM COLONIAS REPRODUTIVAS DE AVES AQUATICAS Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Silvia Nassif Del Lama - Coordenador / Carolina Isabel Miño - Integrante / Fagner Miguel Silva - Integrante. Membro: Silvia Nassif Del Lama. |
| 10. | 2013-Atual. Estudo integrado de corpos de agua doce na Amazonia como visao analoga de rochas geradoras lacustres: (I) Determinacao por metagenoma da diversidade microbiana aquatica Descrição: Projeto em parceria com a Petrobrás para realização de estudos metagenômicos em rios e lagos da região amazônica. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Flavio Henrique da Silva - Coordenador / Fernando Pellon de Miranda - Integrante / Danyelle Toyama - Integrante / Andrea Soares da Costa Fuentes - Integrante / Luciano Kishi - Integrante. Membro: Flavio Henrique da Silva. |
| 11. | 2013-Atual. Estudos transcriptomicos de Migdolus fryanus e busca de genes alvo para o controle do inseto na cultura da cana-de-acucar Descrição: Projeto PITE-FAPESP, em parceria com a empresa ETH-Bioenergia, para seleção da alvos para combate ao inseto Migdolus fryanus a partir de dados transcriptômicos e utilização de RNAi.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . Integrantes: Flavio Henrique da Silva - Coordenador / Fernando P. P. Fonseca - Integrante / Adelita Carolina Santiago - Integrante / Andrea Soares da Costa Fuentes - Integrante / Luciano Kishi - Integrante / Rafael Pedezzi - Integrante. Membro: Flavio Henrique da Silva. |
| 12. | 2013-Atual. Identificacao e caracterizacao de cisteino peptidases do inseto Diaphorina citri, vetor da doenca Huanglongbing e estudos de interacao entre as cisteino peptidases e cistatinas de citros Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Andrea Soares da Costa Fuentes - Coordenador / Flavio Henrique-Silva - Integrante / José Belasque Junior - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Andrea Soares da Costa Fuentes. |
| 13. | 2013-Atual. Mapeamento da rede de interacao molecular de Trap-1 Descrição: A homeostase mitocondrial e celular é altamente regulada via interações de complexos proteicos e multi-moleculares, quaisquer desequilíbrios na homeostase mitocondrial e/ou perturbação da integridade organelar, são potencialmente catastróficos, podendo levar a consequências patofisiológicas severas inclusive ao aparecimento e progressão de doenças. A mitocôndria utiliza uma rede de chaperonas moleculares, no intuito de atenuar ? continuamente ? o estresse proteotóxico, assim como manter a proteostase flexível as mudanças de ambiente na organela. Dentro da classe das chaperonas moleculares, sobretudo membros da família das Hsp90, desempenham um papel efetivo na proteostase mitocondrial seja em condições normais ou de estresse. A TRAP-1 (uma homóloga mitocondrial da Hsp90) tem um papel crucial como regulador da integridade mitocondrial, onde atua no controle da apoptose, em especial no contexto do estresse oxidativo. Além disso, a atividade anormal da TRAP-1 foi observada no câncer e em desordens neurodegenerativas, com possíveis implicações na progressão das doenças e intervenção terapêutica, assim a TRAP-1 pode ser definida não apenas como uma orquestradora subcelular do controle de qualidade do enovelamento de proteínas, mas também como um hub ou nó das vias de sinalização da homeostase celular. Duas décadas após sua identificação, o conhecimento científico alcançado nesse período revela a TRAP-1 como uma proteína de importância fundamental em inúmeros processos essenciais para a viabilidade celular. Contudo, ainda que exerça reconhecidamente um papel central na biologia e medicina, a complexidade intrínseca das vias moleculares coordenadas pela TRAP-1 faz com que vários aspectos da função, estrutura e regulação dessa proteína e suas redes moleculares ainda permaneçam desconhecidos. Assim, a investigação por meio da caracterização da TRAP-1 e suas proteínas parceiras: PINK-1, CypD, Hsp60e Hsp90α, bem como o estudo e detalhamento da interação dessa rede molecular certamente irá contribuir para a descoberta e identificação dos mecanismos moleculares de ação e modulação de TRAP-1. O mapeamento dessa rede de interações, incluindo a ação de inibidores e mecanismos envolvidos no processo, por meio de técnicas bioquímicas e biofísicas, poderá revelar informações peculiares de importância médica/biotecnológica ao fornecer dados específicos de atuação dessas proteínas, desvendando o funcionamento dessas vias moleculares.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Lisandra Marques Gava Borges - Integrante / Lisandra Marques Gava - Coordenador / Borges, Júlio C. - Integrante / Ramos, C. H. I. - Integrante. Membro: Lisandra Marques Gava Borges. |
| 14. | 2013-2014. Programa Professor Visitante do Exterior - PVE/CAPES Descrição: Vinda da Dra. Deborah Penque, do Laboratório de Proteômica do Instituto Nacional de Saúde Dr. Ricardo Jorge de Lisboa, Portugal, em outubro-novembro de 2013 para visita/científica etrabalhos de colaboração em Proteômica.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Maria Teresa Marques Novo Mansur - Coordenador / Deborah Penque - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa. Membro: Maria Teresa Marques Novo Mansur. |
| 1. | 2012-2014. Analise funcional da proteina quinase A (pkcA) envolvida na via da integridade da parede celular no patogeno oportunista humano Aspergillus fumigatus Descrição: Edital universal 14/2011 Faixa A (Processo 485478/2011-0). Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Iran Malavazi - Coordenador / Anderson Ferreira da Cunha - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Iran Malavazi. |
| 2. | 2012-2015. ANALISE GENOMICA E TRANSCRIPTOMICA DE LINHAGENS TERMOTOLERANTES E ETANOL RESISTENTES DE SACCHAROMYCES CEREVISIAE ISOLADAS DURANTE O PROCESSO DE PRODUCAO DE ETANOL CONSTRUCAO DE PLATAFORMAS BIOLOGICAS PARA USO INDUSTRIAL Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Anderson Ferreira da Cunha - Coordenador / Iran Malavazi - Integrante / Maria Augusta Sabadine - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Anderson Ferreira da Cunha. |
| 3. | 2012-2016. AVALIACAO DO PAPEL BIOLOGICO DE PEROXIRREDOXINAS NA DIFERENCIACAO CELULAR ERITROIDE E EM DOENCAS GENETICAS ERITROCITARIAS. Descrição: Financiamento FAPESP Jovem Pesquisador Processo nº 2011/50358-3. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (3) . Integrantes: Anderson Ferreira da Cunha - Coordenador / Marcos Antonio de Oliveira - Integrante / Fernando Ferreira Costa - Integrante / Iran Malavazi - Integrante / Betânia L. D. Hatzlhofer - Integrante / Marcos A.C. Bezerra - Integrante / Aderson Araújo - Integrante / Luis Eduardo Soares Netto - Integrante. Membro: Anderson Ferreira da Cunha. |
| 4. | 2012-Atual. EFEITOS DOS PIRETROIDES SOBRE AS ENZIMAS DIGESTIVAS DE MATRINXA, Brycon amazonicus Descrição: Os inseticidas piretroides, tais como a deltametrina, cipermetrina, lambda-cialotrina, são considerados produtos ideais de baixa toxicidade para aves e mamíferos. Apesar disso, diversos estudos relatam os efeitos tóxicos dos piretroides sobre organismos não-alvo, tais como os peixes. Nesses animais, a toxicidade é revelada por alterações hematológicas e metabólicas, por danos hepáticos e neurológicos, indução de estresse oxidativo e genotoxicidade. Devido à ampla utilização dos piretroides e aos seus efeitos tóxicos, e sabendo-se também, que a saúde do peixe pode ser avaliada através da habilidade em digerir o alimento, justifica-se a necessidade de estudos também acerca dos efeitos sobre a atividade de enzimas digestivas dos peixes expostos a essa classe de produtos. Sabe-se que tal habilidade depende tanto da presença quanto da quantidade apropriada de enzimas digestivas Os peixes são considerados bons modelos em estudos de ecotoxicologia e o monitoramento da sua saúde permite a compreensão das alterações do ambiente aquático. O matrinxã, Brycon amazonicus, é um peixe da bacia amazônica que vem se destacando na piscicultura nacional por apresentar bom crescimento, ótima aceitação de dieta artificial e carne muito apreciada pelo sabor. Desse modo, os objetivos deste projeto são: analisar os efeitos dos piretroides (deltametrina, cipermetrina e lambda-cialotrina), após 96 horas de exposição, de 1/10 da CL50/96 horas sobre a atividades das enzimas digestivas do intestino. Os peixes serão expostos aos xenobióticos em sistemas de tanques "in door" e, após o período de exposição, os animais serão anestesiados e eutanasiados para a amostragem do trato gastrintestinal. Serão avaliadas as atividades das enzimas digestivas do intestino total (protease inespecífica ,quimiotripsina, tripsina, lipase e amilase).. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Gilberto Moraes - Coordenador / Ive Marchioni Avilez - Integrante / Camila Soares Pigão - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa. Membro: Gilberto Moraes. |
| 5. | 2012-Atual. Efeitos pleiotropicos da vitelogenina sobre a expressao de microRNAs em abelhas Apis mellifera Descrição: A vitelogenina é uma fosfoglicolipoproteína produzida no corpo gorduroso servindo como reserva energética dos ovos de insetos. No entanto, em abelhas Apis mellifera, a vitelogenina é encontrada em operárias não-reprodutoras, sugerindo a aquisição de funções não-ovogênicas. Sabe-se hoje que a vitelogenina desempenha diversas funções no controle da organização social por meio de efeitos pleiotrópicos na divisão de trabalho (em especial a transição de tarefas intra-nidais para atividades de forrageamento) e longevidade de operárias. Assim, uma vez alterada a expressão de vitelogenina nas operárias, perturba-se indiretamente a organização social. As informações acima indicam que a vitelogenina é um elemento chave em redes gênicas reguladoras do polietismo etário, devendo interagir com uma série de elementos genéticos, codificadores e não-codificadores. Os níveis de expressão gênica e proteica de vitelogenina em operárias adultas podem ser alterados por silenciamento induzido via RNAi, por anestesia de operárias recém-nascidas em condição de orfandade com doses de dióxido de carbono (narcose), e por dietas artificiais sem a adição de fonte proteica (pólen). Neste projeto propomos estudar as mudanças de expressão de microRNAs (RNAs não-codificadores) em resposta à diminuição dos níveis de vitelogenina induzidos por silenciamento, narcose e dieta.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Francis de Morais Franco Nunes - Coordenador / Zilá Luz Paulino Simões - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Número de produções C, T A: 1 Membro: Francis de Morais Franco Nunes. |
| 6. | 2012-2014. Moleculas reguladoras do crescimento larval e da metamorfose em abelhas operarias Apis mellifera Descrição: A metamorfose de insetos holometábolos ocorre pela sucessão de ciclos de crescimento e mudas, influenciada principalmente pela ação balanceada de hormônios ecdisteróides (20E) e juvenil (HJ). O HJ promove o crescimento, mas mantém o organismo na fase larval e, assim, impede que a muda metamórfica ocorra. Com a queda nos níveis de HJ, ocorrem processos de transformação que culminam na transição larva-pupa. Nessa transição, ocorre intensa morte celular programada dos tecidos larvais, proliferação e diferenciação dos discos imaginais e consequente formação dos órgãos do adulto. De maneira tempo- e espaço-específica, cascatas de sinalização desencadeadas por hormônios ativam ou reprimem a expressão de inúmeros elementos genéticos ao longo do desenvolvimento e metamorfose dos insetos. No entanto, a regulação do crescimento e metamorfose em modelos sociais, como é o caso da abelha Apis mellifera, ainda é pouco conhecida. Neste trabalho será investigado a expressão transcricional do microRNA let-7 e dos genes codificadores de Cal (calponin) GCE (germ-cell expressed) e IDGF4 (imaginal disc growth factor 4) no corpo gorduroso e tegumento de Apis mellifera, durante as mudas larvais e metamórfica, em condições naturais e após tratamento com 20E e HJ.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Francis de Morais Franco Nunes - Coordenador / Zilá Luz Paulino Simões - Integrante / Natália Helena Hernandes - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.Número de orientações: 1 Membro: Francis de Morais Franco Nunes. |
| 7. | 2012-2014. Origem e Evolucao dos Cromossomos Sexuais em Peixes Neotropicais Descrição: Os processos que atuam na diferenciação dos cromossomos sexuais ainda não estão completamente esclarecidos. No entanto, o acúmulo de seqüências repetitivas de DNA representa um dos primeiros passos nos estágios iniciais de diferenciação dos cromossomos sexuais, além da ausência de recombinação favorecer, por si só, o acúmulo de seqüências repetitivas nesses cromossomos. A diversidade de mecanismos de determinação do sexo em peixes, somada à ausência de cromossomos sexuais heteromórficos em muitas espécies, faz deste grupo um modelo ímpar para compreender melhor os processos evolutivos dos cromossomos sexuais em vertebrados, considerando que os peixes ocupam a posição basal na filogenia deste grupo. Assim sendo, o presente projeto objetiva explorar a diferenciação de sistemas de cromossomos sexuais simples e múltiplos, utilizando excelentes modelos encontrados na ictiofauna Neotropical, empregando os avanços da citogenética molecular, como o mapeamento de seqüências repetitivas de DNA e os procedimentos de microdissecção e pintura cromossômica, permitindo uma exploração mais resolutiva dos eventos associados a tais processos. Parte dos estudos ora propostos fazem parte de Projeto de Pós-Doutorado e Bolsa de Estágio de Pesquisa no Exterior (Marcelo de Bello Cioffi), recentemente aprovados pela FAPESP, relacionados com diferentes sistemas sexuais em representantes da família Erythrinidae. Tais estudos serão complementados pela exploração de excelentes modelos adicionais, encontrados em outros grupos de peixes Neotropicais. Os dados possibilitarão elucidar aspectos fundamentais da evolução dos cromossomos sexuais entre os peixes, constituindo também importantes subsídios para o entendimento da evolução desses cromossomos nos vertebrados como um todo.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Luiz Antonio Carlos Bertollo - Coordenador / ORLANDO MOREIRA FILHO - Integrante / WAGNER FRANCO MOLINA - Integrante / Marcelo de Bello Cioffi - Integrante / LIEHR, T. (Thomaz Liehr) - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Luiz Antonio Carlos Bertollo. |
| 8. | 2012-Atual. Respostas metabolicas e de crescimento de pintado (Pseudoplatystoma corruscans) submetido ao exercicio sustentado. Descrição: Peixes que se exercitam em velocidade ideal de nado apresentam uma série de respostas diferenciadas, tais como: melhor utilização de fontes energéticas não-protéicas, maior redirecionamento de proteínas para o crescimento, diminuição do comportamento agressivo, melhor orientação na corrente de água, melhora do convívio social e diminuição do estresse. Este trabalho será realizado no Laboratório de Bioquímica Adaptativa de Peixes de Água Doce do Departamento de Genética e Evolução da UFSCar e visa dar continuidade aos estudos do metabolismo adaptativo de pintado (Pseudoplatystoma corruscans) frente a diferentes situações de confinamento. O objetivo do estudo é a determinação da velocidade ideal de nado, para a espécie em pauta, nas condições de cultivo. Serão utilizados 64 juvenis de pintado distribuídos em um sistema termo-regulado e fechado, adaptado para a realização de exercício. O período experimental será de 50 dias, os animais serão alimentados com dieta composta por 40 % de proteína bruta, 25% de carboidrato e 8% de lipídio com 4.000 kcal/kg de energia bruta. Os juvenis de pintado serão submetidos a quatro situações: 1CC/seg (comprimentos corporais), 2CC/seg e 3CC/seg). Serão avaliados o desempenho produtivo, o metabolismo intermediário, capacidade digestiva proteolítica e rotas metabólicas que indiquem a possibilidade de utilização das diferentes frações nutritivas da dieta. Através dos resultados obtidos, poderá se aferir qual é a melhor velocidade de exercício para o pintado e otimizar futuros experimentos, que poderão ser direcionados para a elaboração de dietas diferenciadas, com menores níveis de proteína dietária, além de fornecer novos dados para a piscicultura brasileira no tocante a melhores condições de criação da espécie.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Gilberto Moraes - Coordenador / Araceli Hackbart - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa. Membro: Gilberto Moraes. |
| 1. | 2011-Atual. Efeitos da deltametrina sobre a biotransformacao, a neurotoxicidade e o metabolismo intermediario de matrinxa, Brycon amazonicus Descrição: A aqüicultura, hoje em franco desenvolvimento no país, apresenta como desfio a continuidade do crescimento associado tanto à qualidade do pescado quanto à preservação do meio ambiente. A utilização de inseticidas é cada vez maior, não só para fins agrícolas, mas também para o combate a insetos de relevância à saúde pública. Nos últimos anos, no entanto, observa-se uma substituição dos tipos de pesticidas utilizados, diferindo quanto à toxicidade. Os inseticidas piretroides, tais como a deltametrina, são considerados produtos ideais devido à sua baixa toxicidade para aves e mamíferos, ao seu amplo espectro de ação e a não se acumularem ao longo da cadeia trófica. Apesar disso, diversos estudos relatam os efeitos tóxicos da deltametrina sobre organismos não-alvo, tais como os peixes. Nesses animais, a toxicidade é revelada por alterações hematológicas, alterações do metabolismo intermediário, por danos hepáticos e neurológicos, além da indução de estresse oxidativo. Os peixes são considerados bons modelos em estudos de ecotoxicologia por pertencerem ao maior grupo dentre os vertebrados, e por seu monitoramento permitir a compreensão das alterações do ambiente aquático. O Brasil apresenta uma das maiores faunas de peixes de água doce do mundo. Suas espécies são muito apreciadas para o consumo humano, razão pela qual nas últimas décadas a piscicultura brasileira tem despontado como forma alternativa de produção de alimento, e priorizado algumas espécies de interesse econômico diminuindo assim a pesca predatória. Devido à ampla utilização da deltametrina e aos seus efeitos tóxicos, justifica-se a necessidade de estudos acerca dos danos neurotóxicos causados pela exposição a esse produto; a verificação da capacidade específica de sua biotransformação; e as adaptações bioquímicas causadas no metabolismo intermediário de organismos não-alvo. Os objetivos deste projeto são: 1) analisar os efeitos da deltametrina (1/10 da CL50/96 horas) sobre as reações do metabolismo de xeno. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Gilberto Moraes - Coordenador / Ive Marchioni Avilez - Integrante / Camila Soares Pigão - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Membro: Gilberto Moraes. |
| 2. | 2011-2014. Efeitos do Biosilicato associado ao laser de baixa intensidade no reparo osseo em ratos Descrição: Auxílio à Pesquisa - Regular FAPESP. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Iran Malavazi - Integrante / Ana Claudia Muniz Renno - Integrante / Oscar Peitl Filho - Integrante / Nivaldo Antonio Parizotto - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Iran Malavazi. |
| 3. | 2011-2014. ESPONJAS DE CUBA E BRASIL (PROJETO ESCUBRA): CAPACITACAO EM TAXONOMIA, BIOGEOGRAFIA E EMPREGO COMO BIOINDICADORES DE CONTAMINACAO MARINHA. CNPq, FAPESB. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Patrícia Domingues de Freitas - Integrante / CARLA MENEGOLA - Coordenador. Membro: Patricia Domingues de Freitas. |
| 4. | 2011-2013. Estudo da Estrutura Genetico-Populacional de Pseudoplatystoma corruscans, Salminus brasiliensis e Salminus hilarii, da Bacia do Rio Grande Descrição: Descrição: Análises da variabilidade genética de populações de peixes, utilizando metodologias moleculares têm auxiliado questões relativas à identificação de espécies e diferenciação entre populações, possibilitando o estudo genético de espécies ameaçadas de extinção e o estabelecimento de medidas de conservação mais efetivas. Neste cenário destaca-se o estudo de três importantes espécies de peixes migradores, consideradas topo de cadeia alimentar. São elas: Pseudoplatystoma corruscans, Salminus brasiliensis e Salminus hilarii, conhecidas, respectivamente, como pintado, dourado e tabarana. Dado a diversidade genética é um dos três níveis da biodiversidade que merece ser conservado e que a presença de represas na bacia do rio Grande pode restringir o fluxo gênico e propiciar a diferenciação nas populações de P. corruscans, S. hilarii e S. brasiliensis e tendo em vista a importância econômica e ecológica dessas espécies e a forte pressão antrópica sobre seus habitats, bem como seus respectivos status de conservação é de fundamental relevância para planos de manejo de conservação dessas espécies a caracterização genética de suas populações, bem como a análise da viabilidade de manutenção de suas populações em seus habitats.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . Integrantes: Pedro Manoel Galetti Junior - Integrante / Patrícia Domingues de Freitas - Coordenador / Aline Galindo Nunes - Integrante / Alline Braga Silva - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Pedro Manoel Galetti Junior. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (4) . Integrantes: Patrícia Domingues de Freitas - Coordenador / Aline Galindo Nunes - Integrante / Aline Braga Silva - Integrante / Josiane Ribolli - Integrante / Carolina Barros Machado - Integrante / PEDRO MANOEL GALETTI JUNIOR - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Patricia Domingues de Freitas. |
| 5. | 2011-2014. Filogenia molecular dos Anostomidae e filogeografia das especies com cromossomos sexuais ZZ/ZW do genero Leporinus Descrição: A família Anostomidae possui uma ampla distribuição neotropical e possui 138 espécies descritas distribuídas em 12 gêneros. Os Anostomídeos ocupam as grandes bacias da América do Sul. Esta família parece ser monofilética, mas diversas tentativas de delimitar as subfamílias não tem tido muito sucesso. Espécies dos gêneros Leporinus e Schizodon são exploradas comercialmente como uma importante fonte de alimento, além disso, espécies coloridas de menor porte são utilizadas nos aquários. Dentro da família Anostomidae o gênero Leporinus é o mais especioso (87 espécies válidas). Todas as espécies do gênero que foram citogeneticamente estudadas possuem a mesma fórmula cromossômica, mas existe um sistema de cromossomos sexuais ZZ/ZW descrito para sete espécies, que conformariam um grupo natural. Outro sistema de cromossomos sexuais ZW foi descrito unicamente para Leporinus geminis. As espécies de Leporinus com cromossomos ZW apresentam uma interessante distribuição, estando representadas praticamente em todas as grandes bacias hidrográficas do Brasil. A família Anostomidae e em especial o gênero Leporinus são elementos conspícuos da ictiofauna brasileira, as relações filogenéticas entre e dentro desses grupos ainda são desconhecidos, apesar dos esforços já realizados. Uma rápida e correta classificação é necessária especialmente nas espécies com valor comercial. A realização dos códigos de barras de DNA poderá nos auxiliar na rápida e correta identificação das espécies. Elucidar os mecanismos que levam a especiação requer um detalhado conhecimento sobre as relações filogenéticas e filogeográficas das espécies dentro de sua área de distribuição. O caso das espécies de Leporinus que apresentam cromossomos sexuais oferece uma importante fonte de informação sobre esses processos. O nosso primeiro objetivo é reconstruir as relações filogenéticas entre os distintos gêneros da família Anostomidae e entre as distintas espécies do gênero Leporinus. Avaliar a monofilia do grupo de. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Pedro Manoel Galetti Junior - Coordenador / Jorge Luis Ramirez Malaver - Integrante. Membro: Pedro Manoel Galetti Junior. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Patrícia Domingues de Freitas - Integrante / PEDRO MANOEL GALETTI JUNIOR - Coordenador / JORGE LUIZ RAMIREZ - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Patricia Domingues de Freitas. |
| 6. | 2011-2014. Identificacao de leveduras fermentadoras de xilose isoladas a partir do trato intestinal de insetos que parasitam a cana-de-acucar Descrição: Auxílio à Pesquisa - Parceria para Inovação Tecnológica - PITE/FAPESP. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Iran Malavazi - Integrante / Goldman, G. H. - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Vale/SA - Auxílio financeiro. Membro: Iran Malavazi. |
| 7. | 2011-2011. IN SEARCH DNA BARCODE FOR SHRIMP PENAEID OF BRAZILIAN COAST. FAPESP Processo 2011/21384-6 Descrição: FAPESP 2011213846 R$ 3.794,35 U$ 2.350.,00. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Patrícia Domingues de Freitas - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de SP - Auxílio financeiro. Membro: Patricia Domingues de Freitas. |
| 8. | 2011-Atual. INCT - Ciencias do Mar - Oceanografia Integrada e Usos Multiplos da Plataforma Continental e Oceano Adjacente-Centro de Oceanografia Integrada (COI) Descrição: O Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia do Mar (INCT ? Mar) ?Centro de Oceanografia Integrada? (COI), INCT-Mar COI, está sediado no Instituto de Oceanografia da Universidade Federal do Rio Grande (IO-FURG). O INCT-Mar COI está formado por quase uma centena de pesquisadores distribuídos por 9 (nove) estados brasileiros (RS, SC, PR, SP, RJ, ES, BA, PE e AL), muito deles já agrupados em suas respectivas áreas do conhecimento, representando grupos de pesquisas brasileiros, que englobam 15 (quatorze) instituições de ensino superior, 2 (dois) institutos de pesquisa e 1 (um) instituto federal de educação tecnológica.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (2) . Integrantes: Pedro Manoel Galetti Junior - Integrante / Luis Felipe Hax Niencheski - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Pedro Manoel Galetti Junior. |
| 9. | 2011-Atual. OCEANOGRAFIA INTEGRADA E USOS MULTIPLOS DA PLATAFORMA CONTINENTAL E OCEANO ADJACENTE, INCT, CENTRO DE OCEANOGRAFIA INTEGRADA (INCT MAR COI) EDITAL MCT/CNPQ/FNDCT/FAP No 71/2010 - Institutos Nacionais de Ciencia e Tecnologia Descrição: Edital MCT/CNPq/FNDCT/FAP nº 71/2010 Coordenado por Luis Felipe Hax Niencheski R$ 7.000.000,00. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Patrícia Domingues de Freitas - Coordenador. Membro: Patricia Domingues de Freitas. |
| 10. | 2011-2015. PREDADORES DE TOPO DE CADEIA ALIMENTAR. PESQUISAS EM REDES TEMATICAS PARA AMPLIACAO DO CONHECIMENTO SOBRE A BIOTA, O PAPEL FUNCIONAL, USO E CONSERVACAO DA BIODIVERSIDADE BRASILEIRA. EDITAL CNPQ 47/2010-CHAMADA 2. FAPESP/ PROCESSO No. 10/52315-7 Descrição: Biota Fapesp 10/52315-7 CNPq 10 - 1.800,00 Sub Projeto 120.000,00. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Patrícia Domingues de Freitas - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Patricia Domingues de Freitas. |
| 11. | 2011-Atual. Prevalencia e identificacao de linhagens de hemoparasitas em populacoes americanas e africanas de Bubulcus ibis (Ardeidae, Pelecaniiformes, Aves) Descrição: A garça-vaqueira (Bubulcus ibis) nativa da África invadiu o continente americano no final do século XIX e espalhou-se por toda sua área. Essa ave é considerada invasora e, principalmente em ilhas oceânicas, compete com aves marinhas nativas por áreas de reprodução. Em testes preliminares verificamos que a população brasileira apresenta hemoparasitas. Essa condição permite testar a validade da Hipótese de Liberação do Inimigo (ERH) que postula que populações de aves exóticas apresentam menor nível de prevalência e menor número de linhagens de parasitas nas áreas introduzidas do que nas nativas. Amostras de sangue e lâminas serão obtidas de cinco populações brasileiras de ninhegos de B. ibis, localizadas mais próximas da provável área de entrada na América do Sul, de cinco populações norte americanas do sudeste dos EUA e de cinco populações africanas da costa oeste, totalizando cerca 450 indivíduos. Para o diagnóstico molecular fragmentos da região do DNAmit que codificam o citocromo B e uma região não-codificadora do Plasmodium spp, do Haemoproteus spp e do Leucocytozoon spp serão amplificados. Esses resultados serão comparados com os obtidos pelo diagnóstico por microscopia. Níveis de prevalência serão comparados entre as regiões dos dois continentes, confirmando ou não a hipótese ERH. Os indivíduos infectados serão submetidos a uma reação de sequenciamento para região do citocromo B para identificação do gênero do hemoparasita e do repertório das linhagens presentes nessas regiões. Pela comparação entre as linhagens encontradas nas áreas (nativa e invadida) poderemos inferir indiretamente a extensão do gargalo populacional das populações brasileiras e norte americanas de B. ibis no seu estabelecimento no continente americano. A origem da população fundadora poderá ainda ser determinada, caso entre as populações africanas amostradas esteja a população africana fonte-fundadora.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . Integrantes: Silvia Nassif Del Lama - Coordenador / Emmanuel Moralez da Silva - Integrante / Erika Braga - Integrante / Cynthia Villar - Integrante / Carlos Congrains Castillo - Integrante. Membro: Silvia Nassif Del Lama. |
| 12. | 2011-2016. Programa Nacional de Pos- Doutorado - PNPD Institucional 2011, Analise funcional de genes potencialmente envolvidos na fitopatogenicidade de Xanthomonas citri Descrição: O presente projeto de pesquisa em princípio visa o estudo funcional dos genes de superoxido-dismutase e fosfoglicomutase e seus produtos. Eventualmente outros encontrados pela análise proteômica em curso em nosso laboratório estão sendo acessados. Tal estudo será realizado por meio da clonagem para obtenção de mutantes de Xanthomonas citri subsp. citri com knockout de tal gene e para a produção heteróloga de seu produto. A linhagem mutante obtida será testada quanto à sua capacidade de infecção in vivo e caracterizada quanto ao perfil proteômico diferencial em comparação com o da linhagem selvagem. Sistemas de expressão heteróloga obtidos serão testados para a obtenção de proteína recombinante. O produto de expressão recombinante será utilizado em testes de atividade para validar sua atividade biológica. Os resultados deste projeto poderão auxiliar na compreensão dos mecanismos de infecção de Xanthomonas citri, bem como identificar possíveis alvos moleculares de interesse no combate à doença. (Financiamento pela CAPES: bolsa de Pós-Doc e custeio anual). Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Maria Teresa Marques Novo Mansur - Coordenador / Leandro Seiji Goto - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa. Número de produções C, T A: 3 / Número de orientações: 7 Membro: Maria Teresa Marques Novo Mansur. |
| 13. | 2011-2012. Projeto Cooperacao Brasil-Portugal: Biologia de Sistemas e Engenharia de Bioprocessos e Sistemas: Capacitacao de Pessoal nas Fronteiras da Biotecnologia Industrial Descrição: A proposta principal deste projeto é promover a interação entre pesquisadores e alunos de Pós-Graduação da universidade lusitana com os Departamentos de Engenharia Química (DEQ) e de Genética e Evolução (DGE) da UFSCar, que atuam em diferentes linhas de pesquisa, mas que apresentam grande sinergia. Também participam das atividades os Programas de Pós-Graduação em Biotecnologia (PPGBiotec), de Engenharia Química (PPGEQ) e de Genética e Evolução (PPGGEv) da UFSCar. Das oito linhas de pesquisa desenvolvidas no LaDABio da UFSCar, três foram selecionadas para integrar os estudos conjuntos entre pesquisadores do Brasil e de Portugal. Com este projeto as pesquisas em quot;Inteligência Computacional em Bioprocessosquot;, quot;Produção de Vacinas Humanas e Animaisquot;, e quot;Engenharia de Bioprocessos e Sistemas (EBS) aplicada à Produção de Bioetanol a partir de Bagaço de Cana-de-Açúcarquot; passam a contar com a parceria do Grupo de Engenharia de Sistemas de Bioprocessos (BioPSEg) do Centro de Engenharia Biológica da Universidade do Minho. Os pesquisadores portugueses dedicam-se à investigação nas áreas da modelação, monitorização e otimização de bioprocessos e à biologia de sistemas e engenharia metabólica.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (5) . Integrantes: Maria Teresa Marques Novo Mansur - Integrante / Tereza Cristina Zangirolami - Integrante / Roberto de Campos Giordano - Coordenador / Eugenio Manuel de Faria Campos Ferreira - Integrante / Isabel Cristina A. P. Rocha - Integrante / Raquel de L. C. Giordano - Integrante / Antonio J.G. Cruz - Integrante / Rosineide Gomes da Silva Cruz - Integrante / Ruy de Souza Jr. - Integrante / Caliane Bastos Borba Bastos - Integrante / Zita I.T.A. Soons - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 11 / Número de orientações: 1 Membro: Maria Teresa Marques Novo Mansur. |
| 14. | 2011-Atual. Rede de DNA barcoding da ictiofauna do Brasil Descrição: Nos últimos anos vem sendo conduzida por sistematas e geneticistas uma abordagem que tem como objetivo caracterizar as espécies de organismos do mundo por meio da padronização do seqüenciamento de segmentos específicos do DNA genômico, a fim de determinar ?um código de barras genético? ou ?DNA barcoding? para cada espécie. A ictiofauna brasileira é constituida por aproximadamente 1220 espécies marinhas e 2700 de água doce. Dentro deste contexto, esta proposta tem como objetivo utilizar a técnica de DNA barcode como ferramenta auxiliar na discriminação de espécies de cerca de 50% desta ictiofauna, ou seja, 2100 espécies de peixes do Brasil (marinhos e de água doce). Para tanto está sendo proposta uma rede de pesquisa inter-regional com capacidade instalada para a realização de pesquisa colaborativa e produção conjunta tendo como pressupostos o uso otimizado de recursos e o compartilhamento de infraestrutura para a identificação molecular da ictiofauna brasileira. Pretendemos acessar amostras de tecido previamente coletadas e provenientes do Oceano Atlântico e das bacias de água doce da Amazônia, Tocantins-Araguaia, Paraná-Paraguai, Uruguai, São Francisco e de drenagens da costa atlântica. A rede está constituída por uma centena de pesquisadores e estudantes de pós-graduação provenientes de 27 instituições de ensino e pesquisa representativas das regiões Norte, Nordeste, Centro-Oeste, Sudeste e Sul. Esta rede, que engloba coleções ictiológicas e laboratórios de biologia molecular do Brasil, pretende integrar-se às iniciativas internacionais de identificação molecular da biodiversidade, particularmente a Iniciativa em Peixes do Código de Barras da Vida (FISH-BOL - Fish Barcode of Life Initiative).. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (2) . Integrantes: Pedro Manoel Galetti Junior - Integrante / Jorge Ivan Rebelo Porto - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Pedro Manoel Galetti Junior. |
| 15. | 2011-2015. TAXONOMIA DE PEIXES DE AGUA DOCE DA BAHIA, BRASIL, COM ENFASE NAS DRENAGENS COSTEIRAS DO ESTADO. MCT/CNPq/MEC/CAPES/PROTAX no 52/2010 - Programa de Capacitacao em Taxonomia Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Patrícia Domingues de Freitas - Integrante / ANGELA ZANATA - Coordenador. Membro: Patricia Domingues de Freitas. |
| 1. | 2010-2013. Analise da expressao genica global do fungo patogenico humano Aspergillus fumigatus na resposta a droga antifungica da classe equinocandina e a caracterizacao funcional de genes envolvidos na resposta a esta classe de antifungicos Descrição: Projeto Regular FAPESP. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Iran Malavazi - Integrante / Gustavo Henrique Goldman - Integrante / Márcia Eliana da Silva Ferreira - Integrante / Ana Carolina Gratieri Maciel - Integrante / Marcia Regina Von Zeska Kress - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Iran Malavazi. |
| 2. | 2010-2013. Biologia e ecologia da nidificacao e variabilidade genetica de Centris (Centris) flavifrons Fabricius (Hymenoptera: Apidae, Centridini) em areas urbanas da cidade de Joao Pessoa, Paraiba Descrição: O presente projeto tem por objetivo o conhecimento da biologia, da ecologia da nidificação, da variação e estrutura genéticas de populações, e da estrutura sociogenética em ninhos de Centris (Centris) flavifrons (Hymenoptera: Apidae, Centridini) de áreas urbanas da cidade de João Pessoa, Paraíba. Edital Universal CNPq 14/2010 - Valor: R$ 43.700,00. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Marco Antonio Del Lama - Integrante / Celso Feitosa Martins - Coordenador / Marcella Pereira Peixoto - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Marco Antonio Del Lama. |
| 3. | 2010-2015. Caracterizacao molecular da via de sinalizacao mediada pela proteina quinase C no fungo patogenico humano Aspergillus fumigatus Descrição: Projeto Jovem Pesquisador em Centros Emergentes - FAPESP. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Iran Malavazi - Coordenador / Márcia Eliana da Silva Ferreira - Integrante / Anderson Ferreira da Cunha - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Iran Malavazi. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Anderson Ferreira da Cunha - Integrante / Iran Malavazi - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Anderson Ferreira da Cunha. |
| 4. | 2010-2015. Citogenetica e evolucao cariotipica de peixes de agua doce. VIII. Descrição: A diversidade de mecanismos sexo determinantes em peixes, associada à ausência de cromossomos sexuais diferenciados na maioria das espécies, propicia condições adequadas para a caracterização de estágios iniciais de diferenciação de cromossomos sexuais, o que geralmente não é possível nos vertebrados superiores, em virturde da relativa estabilidade dos sistemas de determinação do sexo. Por sua vez, a utilização de metodologias modernas de citogenética molecular, particularmente no tocante ao estudo de seqüências repetitivas do genoma e de elementos transponíveis, associada à hibridação in situ fluorescente (FISH) e à microdisseção cromossômica, tem possibilitado avanços significativos na citogenética como um todo, bem como no estudo dos cromossomos sexuais. A família Erythrinidae se destaca entre os peixes Neotropicais como um modelo excelente para estudos de biodiversidade, evolução cariotípica, diferenciação de sistemas de cromossomos sexuais e citotaxonomia. Aspectos particulares importantes, como a origem e a evolução de distintos sistemas de cromossomos sexuais presentes em alguns cariomorfos, merecem ser mais bem trabalhados à luz de modernas metodologias de estudo, o que certamente propiciará novas informações e avanços no entendimento dos processos evolutivos geradores da biodiversidade genética presente nesse grupo. Assim sendo, serão investigadas a evolução e as inter-relações dos sistemas de cromossomos sexuais XX/XY, X1X1X2X2 / X1X2Y e XX /XY1Y2 em cariomorfos de Hoplias malabaricus, do sistema X1X1X2X2 / X1X2Y em cariomorfos de Erythrinus erythrinus, bem como as relações evolutivas entre os cariomórfos de Hoplerythrinus unitaeniatus. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Luiz Antonio Carlos Bertollo - Coordenador / Marcelo de Bello Cioffi - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa. Membro: Luiz Antonio Carlos Bertollo. |
| 5. | 2010-2011. Demografia, biologia, ecologia e conservacao de grandes carnivoros na Estacao Ecologica de Jatai, Sao Paulo, com base em analise nao invasiva de DNA Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . Integrantes: Pedro Manoel Galetti Junior - Coordenador / Renata Alonso Miotto - Integrante / Niara Martins - Integrante / Fernanda do Passo Ramalho - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Pedro Manoel Galetti Junior. |
| 6. | 2010-2012. FILOGENIA DAS ESPECIES RECENTES DA FAMILIA CASSIDULIDAE E BIOGEOGRAFIA DO GENERO Cassidulus (ECHINODERMATA: ECHINOIDEA). Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Patrícia Domingues de Freitas - Integrante / UESLEI CONCEIÇÃO LOPES - Integrante / CARLA MENEGOLA - Coordenador. Membro: Patricia Domingues de Freitas. |
| 7. | 2010-Atual. Historia natural, comportamento de guarda do macho e estrutura sociogenetica em ninhos de Trypoxylon (Trypargilum) Latreille, 1796 (Hymenoptera: Crabronidae) Descrição: Descrição: Vespas do gênero Trypoxylon caracterizam-se pelo modo de vida solitário e por nidificarem em cavidades pré-existentes ou construírem ninhos de barro, aprovisionando as células de cria com aranhas paralisadas de forma massal. Este projeto tem por objetivo testar a hipótese de que o comportamento de guarda exibido pelo macho em espécies de Trypoxylon (Trypargilum) lhe garante a paternidade da prole gerada pela fêmea com a qual interage. A proposta pretende averiguar o possível significado evolutivo do comportamento e, neste sentido, o projeto discute a questão mais geral do altruísmo e dos mecanismos de evolução do comportamento social. Edital Universal CNPq 14/2010 - Valor: R$ 19.700,00. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . Integrantes: Marco Antonio Del Lama - Coordenador / Terumi Hatanaka - Integrante / Maria Luisa Tunes Buschini - Integrante / Juliano Costa de Almeida - Integrante / Antonio Carlos Bragato Bergamaschi - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Marco Antonio Del Lama. |
| 8. | 2010-Atual. Novos parceiros para a agricultura nacional: abelhas solitarias e suas atividades polinizadoras Descrição: A redução de áreas naturais é uma das grandes ameaças à diminuição da biodiversiade e a principal responsável pela diminuição de sítios de nidificação e fontes de alimentos utilizados pelas abelhas, principais polinizadores de diversas frutíferas e, dentre elas, a acerola. A aceroleira (Malpighia emarginata) é amplamente cultivada no Brasil, com os maiores centros de produção no Nordeste, seguida pelo estado de São Paulo. Dentre alguns fatores que podem afetar a produtividade da aceroleira, destaca-se a falta de polinizadores efetivos nas áreas cultivadas. A atração e manutenção de polinizadores eficientes nos cultivos é uma estratégia para o aumento da produtividade em agroecossistemas. Abelhas do gênero Centris são consideradas as principais polinizadoras da acerola no Brasil. Centris analis é uma espécie que nidifica em cavidades preexistentes e pode ser usada e manejada nas áreas cultivadas de acerola visando o aumento da produtividade. Os estudos serão conduzidos em: 1) uma área em campo de produção orgânica de acerola e amebientes naturais adjacentes a ela, no Síto Granja Bela Vista, Indaiatuba, SP; 2) uma área no Campus da USP, em Ribeirão Preto, SP; 3) uma área de cultura em sistema de agricultura familiar no semi-árido baiano e na caatinga, município de Feira de Santana, BA; 4) uma área de cultivo experimental no Vale do São Francisco, no polo de fruticultura de Juazeiro-Petrolina (Bahia/Pernanbuco). Com o desenvolvimento deste projeto, pretende-se: a) determinar a abundância de C. analis nos cultivos das áreas a serem estudadas e avaliar sua contribuição para a polinização e produtividade dessa frutífera: b) determinar a composição florística e fenologia de floração de plantas potencialmente utilizadas por C. analis nas áreas naturais e no entorno de cultivos em São Paulo e Bahia e verificar a distribuição espacial e temporal dos recursos florais disponibilizados por essas plantas no campús da USP-Ribeirão Preto e em área de entorno de pomares de Feira de. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Especialização: (4) / Mestrado acadêmico: (4) Doutorado: (3) . Integrantes: Marco Antonio Del Lama - Integrante / Carlos Alberto Garófalo - Coordenador / Cândida Maria Lima Aguiar - Integrante / Cláudia Inês da Silva - Integrante / Eddy José Francisco de Oliveira - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Marco Antonio Del Lama. |
| 9. | 2010-2012. O papel dos DNAs repetitivos na evolucao cariotipica de especies de Loricariideos (Siluriformes) com enfoque nas subfamilias Loricariinae e Hypostominae. Descrição: Descrição: Dentre os Siluriformes, a família Loricariidae é a mais numerosa, com 716 espécies distribuídas entre 96 gêneros, sendo subdividida em seis subfamílias: Lithogeninae, Neoplecostominae, Hypoptopomatinae, Loricariinae, Delturinae e Hypostominae. Dentre estas, Hypostominae e Loricariinae são as mais representativas para o território brasileiro. Entretanto, muitas das espécies que integram essas sub-famílias não apresentam uma identificação taxonômica precisa, acarretando assim dificuldades nas interpretações de trabalhos que abordam os processos de evolução cromossômica destes grupos. Algumas poucas espécies nas quais análises citogenéticas convencionais já foram realizadas se destacam por apresentarem uma macroestrutura cariotípica muito conservada. Dados de citogenética molecular ainda são muito escassos neste grupo de peixes, restringindo-se apenas à localização e caracterização de poucas classes de sequências repetitivas no genoma de algumas espécies. DNAs satélites (satDNA) são sequências altamente repetitivas do genoma organizadas dentro de arranjos longos ininterruptos em tandem de unidades mais ou menos bem definidas. Estas sequências apresentam uma grande dinâmica evolutiva representando bons marcadores para detecção de eventos evolutivos recentes. Estudos dessas frações repetitivas do genoma podem contribuir para o conhecimento da organização do DNA no núcleo celular, além de serem ótimos marcadores cromossômicos em estudos evolutivos, identificação de um tipo particular de cromossomo, de rearranjos cromossômicos e de cromossomos sexuais. Através da utilização destes marcadores cromossômicos poderão ser esclarecidas varias questões ainda não resolvidas sobre o processo da diversificação cromossômica. Considerando a grande variabilidade cromossômica intra e interespecífica encontrada entre os Loricariidae, este grupo de peixes é um excelente modelo a ser explorado no tocante à nossa biodiversidade ictiológica.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (4) . Integrantes: Orlando Moreira Filho - Coordenador / Luiz Antônio Carlos Bertollo - Integrante / Daniel Rodrigues Blanco - Integrante / Marcelo B. Cioffi - Integrante / Roberto Laridondo Lui - Integrante / Juliana de Fátima Martinez - Integrante / Josiane Baccarin Traldi - Integrante / Marceléia Rubert - Integrante / Camila Gaioto Honda - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Orlando Moreira Filho. Descrição: Dentre os Siluriformes, a família Loricariidae é a mais numerosa, com 716 espécies distribuídas entre 96 gêneros, sendo subdividida em seis subfamílias: Lithogeninae, Neoplecostominae, Hypoptopomatinae, Loricariinae, Delturinae e Hypostominae. Dentre estas, Hypostominae e Loricariinae são as mais representativas para o território brasileiro. Entretanto, muitas das espécies que integram essas sub-famílias não apresentam uma identificação taxonômica precisa, acarretando assim dificuldades nas interpretações de trabalhos que abordam os processos de evolução cromossômica destes grupos. Algumas poucas espécies nas quais análises citogenéticas convencionais já foram realizadas se destacam por apresentarem uma macroestrutura cariotípica muito conservada. Dados de citogenética molecular ainda são muito escassos neste grupo de peixes, restringindo-se apenas à localização e caracterização de poucas classes de sequências repetitivas no genoma de algumas espécies. DNAs satélites (satDNA) são sequências altamente repetitivas do genoma organizadas dentro de arranjos longos ininterruptos em tandem de unidades mais ou menos bem definidas. Estas sequências apresentam uma grande dinâmica evolutiva representando bons marcadores para detecção de eventos evolutivos recentes. Estudos dessas frações repetitivas do genoma podem contribuir para o conhecimento da organização do DNA no núcleo celular, além de serem ótimos marcadores cromossômicos em estudos evolutivos, identificação de um tipo particular de cromossomo, de rearranjos cromossômicos e de cromossomos sexuais. Através da utilização destes marcadores cromossômicos poderão ser esclarecidas varias questões ainda não resolvidas sobre o processo da diversificação cromossômica. Considerando a grande variabilidade cromossômica intra e interespecífica encontrada entre os Loricariidae, este grupo de peixes é um excelente modelo a ser explorado no tocante à nossa biodiversidade ictiológica. Neste contexto, serão utilizados os avanços metod. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (4) . Integrantes: Luiz Antonio Carlos Bertollo - Integrante / ORLANDO MOREIRA FILHO - Coordenador / Marcelo de Bello Cioffi - Integrante / Daniel Rodrigues Blanco - Integrante / Roberto Laridondo Lui - Integrante / Marceléia Rubert - Integrante / JOSIANE BACCARIN TRALDI - Integrante / Juliana de Fátima Martinez - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Luiz Antonio Carlos Bertollo. |
| 10. | 2010-2011. Plano de aplicacao da Reserva Tecnica Institucional da FAPESP para pesquisa junto ao CCBS/UFSCar/Exercicio 2010 Descrição: Reserva Técnica Institucional de Projetos FAPESP. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Maria Teresa Marques Novo Mansur - Coordenador / Marisa Narciso Fernandes - Integrante / Clovis Wesley Oliveira de Souza - Integrante / Eloisa Tudella - Integrante / Rosely Morales de Figueiredo - Integrante / Helenice Jane Cote Gil Coury - Integrante / Marco Antonio Portugal Luttembarck Batalha - Integrante / Nelci Adriana Cicuto Ferreira Rocha - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Maria Teresa Marques Novo Mansur. |
| 11. | 2010-2011. Prospeccao, Biologia de Sistemas, Domesticacao e Desenvolvimento de Cepas de Leveduras para a Fermentacao Industrial no Brasil. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Anderson Ferreira da Cunha - Integrante / Juan Lucas Argueso - Integrante / Gonçalo A. G. Pereira - Coordenador / Goldman, G. H. - Integrante / Luiz Carlos Basso - Integrante / Sérgio Laguna Echeverrigaray - Integrante. Financiador(es): Centro de Tecnologia do Bioetanol LNLS - Cooperação / ETH Bioenergia S/A - Cooperação / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / CTC - Centro de Tecnologia Canavieira - Cooperação. Membro: Anderson Ferreira da Cunha. |
| 12. | 2010-2015. REDE BRASILEIRA DE DNA BARCODING DE ORGANISMOS MARINHOS. IDENTIFICACAO MOLECULAR DA BIODIVERSIDADE. EDITAL MCT/CNPQ/FNDCT-50/2010 Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Patrícia Domingues de Freitas - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Patricia Domingues de Freitas. |
| 13. | 2010-2015. REDE DE DNA BARCODING DA ICTIOFAUNA DO BRASIL. IDENTIFICACAO MOLECULAR DA BIODIVERSIDADE. EDITAL MCT/CNPQ/FNDCT-50/2010 Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Patrícia Domingues de Freitas - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Patricia Domingues de Freitas. |
| 14. | 2010-2014. REDE SISBIOTA - Predadores de Topo de Cadeia Alimentar Descrição: Essa rede engloba projetos em diferentes grupos taxonômicos (peixes, aves, felinos e canídeos) em diferentes habitats e biomas (aquáticos e terrestres), articulados de maneira a possibilitar a ampliação do conhecimento sobre essa importante parcela da biodiversidade brasileira, integrando resultados de estudos de diversidade morfológica e os padrões e processos relacionados e ela, relação entre esses componentes e o funcionamento de ecossistemas, a sua diversidade genética intra e interpopulacional e o mapeamento das paisagens e suas alterações, orientando todo o conhecimento produzido com base nos dados biológicos, ecológicos, genéticos e de paisagens para uma avaliação do impacto que a eventual extinção dos predadores de topo de cadeia alimentar promoveria nos diferentes biomas, contribuindo para a definição de um plano estratégico de valorização da biodiversidade.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Pedro Manoel Galetti Junior - Coordenador / Mercival Roberto Francisco - Integrante / Patrícia Domingues de Freitas - Integrante / Mauro Galetti - Integrante / Renata Alonso Miotto - Integrante / Luis Fernando Carvalho Costa - Integrante / Silvia Nassif Del Lama - Integrante / Evoy Zaniboni Filho - Integrante / Haydée Torres de Oliveira - Integrante / Marcos Rodrigues - Integrante / Katia Maria Paschoaletto Micchi de Barros Ferraz - Integrante / Lisandro Juno Soares Vieira - Integrante / Marcus Vinicius Cianciaruso - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Pedro Manoel Galetti Junior. |
| 15. | 2010-Atual. Respostas adaptativas do teleosteo matrinxa (Brycon amazonicus) exposto ao piretroide lambda-cialotrina: metabolismo antioxidante, parametros histologicos e hematologicos Descrição: Atualmente, o uso de defensivos agrícolas é cada vez maior. Com a ampla utilização de implementos agrícolas, incluindo os agrotóxicos que podem causar danos ao meio ambiente, observa-se um aumento na utilização de produtos considerados menos tóxicos em substituição aos pesticidas altamente tóxicos e persistentes. Os piretróides sintéticos são uma alternativa ao uso de inseticidas persistentes no meio ambiente por apresentarem benefícios tais como: grande eficácia no controle de artrópodes em baixas dosagens, amplo espectro de ação, baixa toxicidade para aves e mamíferos, e não-acúmulo na cadeia trófica. Além de seu uso agrícola, os piretróides são importantes na saúde pública, visto que são utilizados no controle de pragas que podem atuar como vetores de doenças. A lambda-cialotrina é um inseticida piretróide sintético utilizado para controlar um amplo espectro de pragas em plantações e criações, bem como dentro e ao redor de construções e estruturas, e é classificado como um piretróide de classe toxicológica III (medianamente tóxico). No Brasil, este inseticida é registrado para uso em diversas culturas, além de ser utilizado no controle de vetores de doenças. Atualmente, a vasta utilização de piretróides na área agrícola e no controle de pragas urbanas, bem como seu uso doméstico, leva à contaminação do ambiente aquático por esses xenobióticos. Os relatos presentes na literatura referentes aos efeitos tóxicos de inseticidas piretróides em peixes neotropicais são escassos e o conhecimento das respostas metabólicas e morfológicas de organismos aquáticos frente aos estressores ambientais pode subsidiar propostas e programas de monitoramento ambiental. Assim sendo, são necessários estudos referentes à toxicidade do piretróide lambda-cialotrina, aos seus efeitos sobre o metabolismo antioxidante e às alterações morfológicas e hematológicas de matrinxã (Brycon amazonicus). Esta espécie neotropical originária da Bacia Amazônica é cada vez mais cultivada no estado de São P. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Gilberto Moraes - Coordenador / Ive Marchioni Avilez - Integrante / Camila Soares Pigão - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Membro: Gilberto Moraes. |
| 16. | 2010-2012. RESPOSTAS DIGESTIVAS, METABOLICAS E DE CRESCIMENTO DE JUVENIS DE TAMBAQUI Colossoma macropomum (Cuvier, 1818) SUBMETIDOS AO EXERCICIO AEROBICO Descrição: Este projeto foi desenvolvido no Laboratório de Bioquímica Adaptativa do Departamento de Genética e Evolução da UFSCar e visa dar continuidade aos estudos do metabolismo adaptativo de tambaqui (Colossoma macropomum) frente à diferentes situações. A espécie proposta é de amplo interesse comercial devido à excelente qualidade de sua carne e a seu grande potencial para a aqüicultura. O objetivo desse estudo foi a determinação da velocidade ideal de nado para a espécie dentro das condições de cultivo. Para a concretização destes objetivos avaliamos e comparamos o aproveitamento de proteína da dieta em relação à fração energética, quando o peixe é submetido a diferentes velocidades de nado, buscando uma velocidade que proporcione o melhor "efeito poupador de proteínas". Esta avaliação enveu o estudo do desempenho produtivo, da capacidade digestiva proteolítica e das rotas metabólicas que indicam a possibilidade de utilização das diferentes frações nutritivas da dieta pela espécie. Foram utilizados 64 juvenis de tambaqui distribuídos em um sistema termo-regulado, de circulação fechada. O período experimental será de 50 dias, quando os animais receberam até à saciedade uma dieta experimental extrudada, três vezes ao dia. A dieta foi composta por 26,5 % de proteína bruta, 40,5% de carboidrato e 9,1% de lipídio com 3989.50 kcal/kg de energia bruta. Os juvenis de tambaqui foram submetidos a quatro situações (sem exercício; 0,5 CC (comprimentos corporais) /seg.; 1,0 CC/seg. e 2CC/seg.).. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Gilberto Moraes - Coordenador / Luciana Cristina de Almeida - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa. Membro: Gilberto Moraes. |
| 1. | 2009-Atual. Avaliacao das respostas bioquimicas de adaptacao ao estresse oxidativo em matrinxa (Brycon amazonicus) exposto a uma formulacao comercial do piretroide cipermetrina Descrição: Segundo a Agência Nacional de Vigilância Sanitária (ANVISA), o Brasil é um dos maiores consumidores de agrotóxicos do mundo, sendo que o estado de São Paulo é o principal consumidor, com consumo estimado em 54 916 toneladas de ingrediente ativo por ano, representando cerca 26% do total do consumo brasileiro (IBGE, 2010). Sabe-se que os agrotóxicos podem ser persistentes, móveis e tóxicos no solo, na água e no ar. Podem ainda acumularem-se no solo e na biota, e seus resíduos podem atingir às águas superficiais por escoamento e às subterrâneas por lixiviação (IBGE, 2004). Dessa forma, o uso intensivo de agrotóxicos está associado a prejuízos à população, tanto aos consumidores de alimentos, como aos trabalhadores que lidam diretamente com os produtos, à contaminação de alimentos e à degradação do meio ambiente (IBGE, 2004). Visando à substituição dos inseticidas persistentes no ambiente e de alta toxicidade, novas moléculas de rápida degradação e baixa toxicidade têm sido elaboradas. Os piretróides são considerados uma alternativa aos organoclorados, que são muito persistentes no ambiente, e aos organofosforados e carbamatos, que são muito tóxicos, principalmente ao sistema nervoso central (Santos et al., 2007). No Brasil, a utilização e comercialização de piretróides estão em ascensão. Este fato deve-se à ação inseticida dos piretróides contra um amplo espectro de insetos, à necessidade da utilização de pequenas quantidades e à baixa toxicidade para mamíferos, quando comparado aos outros inseticidas vigentes (Santos et al., 2007). Entretanto, a baixa toxicidade encontrada para mamíferos não é refletida aos outros organismos não alvos. Ao contrário do encontrado para os mamíferos, os piretróides são altamente tóxicos para os peixes (Coats, 2008), como já verificado para truta arco-íris, sheepshead minnow, truta marrom, bluegill sunfish, fathead minnow e matrinxã (Jones, 1995; US EPA, 2008; Cortella, 2010). Devido à toxicidade dos piretróides aos organismos aquáticos,. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Gilberto Moraes - Coordenador / Francine Perri Venturini - Integrante / Fernanda Dias de Moraes - Integrante / Priscila Adriana Rossi - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Gilberto Moraes. |
| 2. | 2009-2014. Colonizacao do continente americano pelas populacoes africanas de garca-vaqueira (Bubulcus ibis): a genetica da bioinvasao Descrição: A garça-vaqueira (Bubulcus ibis), nativa das regiões tropicais da África, invadiu o continente americano no final do século XIX. A hipótese mais aceita supõe que as aves atravessaram voando o oceano Atlântico, se estabeleceram inicialmente na região norte-nordeste da América do Sul e de lá se dispersaram para todo o continente há aproximadamente 50-60 anos. Atualmente, a espécie é uma das mais numerosas do continente e apesar de sua expansão ter sido bem documentada demograficamente, a genética de sua introdução permanece não esclarecida. O objetivo desse estudo é utilizar ferramentas genéticas para esclarecer a história da invasão, localizando a região-fonte africana de onde as garças fundadoras partiram para colonizar o continente americano, estimar se houveram poucas ou muitas entradas e o período em que o processo começou a ocorrer. Serão amostradas 15 populações brasileiras de B.íbis posicionadas desde as regiões mais próximas à sua suposta entrada, localizada no extremo norte do país (Amapá) até o extremo sul do país. Oito amostras de países da costa oeste (Senegal, Guiné Bissau, Gana e Angola), localizados na provável região-fonte da população fundadora, serão também coletadas. Dois tipos de marcadores serão utilizados nas análises das populações invasoras e nativas africanas: DNAmit (região controladora e citocromo b) e microssatélites (oito locos polimórficos a serem prospectados na espécie). A comparação entre os níveis de diversidade genética e sua distribuição nas áreas nativas e introduzidas poderá confirmar ou não hipótese de poucas ou muitas entradas. Níveis menores de diferenciação genética e maiores índices de alocação são esperados entre as populações mais antigas brasileiras, posicionadas no norte-nordeste, e a região-fonte africana. Análise filogeográfica baseada nos haplótipos de DNAmit poderá confirmar a identificação da região-fonte e a extensão das entradas de garças fundadoras. Paralelamente, identificaremos as linhagens de Plasmodium e Haem. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Silvia Nassif Del Lama - Coordenador / Lawrence Bryan Jr - Integrante / Terumi Hatanaka - Integrante / Alexandra Sanches - Integrante / Emmanuel Moralez da Silva - Integrante / Emeline B. Campanini - Integrante / Erika Braga - Integrante / Cynthia Villar - Integrante / Carlos Congrains Castillo - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.Número de orientações: 2 Membro: Silvia Nassif Del Lama. |
| 3. | 2009-2013. Functional analysis of the transcription factor XlnR involved in regulation of transcription of cellulases - and hemicellulases-enconding genes in Aspergillus niger Descrição: BIOEN/FAPESP. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Iran Malavazi - Integrante / Gustavo Henrique Goldman - Coordenador / Márcia Eliana da Silva Ferreira - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Iran Malavazi. |
| 4. | 2009-2010. Isolamento de linhagens mutantes e caracterizacao parcial do gene que codifica uma proteina quinase C (PkcA) no fungo patogenico humano Aspergillus fumigatus Descrição: Programa de Apoio ao Docente Recém-Doutor (PADRD) - UFSCar - Edital 2009. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Iran Malavazi - Coordenador. Financiador(es): Universidade Federal de São Carlos - Auxílio financeiro. Membro: Iran Malavazi. |
| 5. | 2009-2012. Prevalencia de malaria em aves aquaticas Descrição: As características migratórias e o habitat de água doce e estuarino ocupados pelas colônias reprodutivas da espécie de aves aquáticas no Brasil são fatores que favorecem a ocorrência de malária. É esperado que as colônias posicionadas na região subtropical apresentem menor índice de infecção do que as posicionadas na região tropical. A incidência da malária é influenciada também pela idade dos hospedeiros. Diversas fontes da literatura fazem alusão ao fato da patologia não ter sido detectada em ninhegos- e esse achado é explicado porque tais indivíduos não foram expostos ainda ao vetor ou porque a infestação está ainda em processo de incubação. Nesse estudo, a técnica de PCR e o estudo morfológico serão utilizados para detecção de malária aviária em amostras de sangue de ninhegos de aves aquáticas. As hipotese levantadas poderão ser ou não confirmadas.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Silvia Nassif Del Lama - Coordenador / Lawrence Bryan Jr - Integrante / Erika Braga - Integrante / Cynthia Villar - Integrante / Pamela Carla Pereira de Assis - Integrante. Número de orientações: 1 Membro: Silvia Nassif Del Lama. |
| 6. | 2009-2017. Projeto Jovem Pesquisador: ANALISE PROTEOMICA DIFERENCIAL EM XANTHOMONAS AXONOPODIS: PROTEINAS E GENES DE INTERESSE BIOTECNOLOGICO Descrição: Análise proteômica de frações celulares de estirpes de Xanthomonas citri e Xanthomonas fuscans que diferem na virulência e nos tipos de citros-hospedeiros. Com Projeto de Expansão em Biologia Molecular (2012): quot;Análise funcional de genes potencialmente envolvidos na fitopatogenicidade de Xanthomonas citriquot; (bolsa Pós-Doc pelo PNPD/CAPES). Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (10) / Mestrado acadêmico: (4) . Integrantes: Maria Teresa Marques Novo Mansur - Coordenador / Jesus Aparecido Ferro - Integrante / Maria Celia Bertolini - Integrante / Juliana Artier - Integrante / José Belasque Júnior - Integrante / Carolina Moretto Carnielli - Integrante / Júlio César Franco de Oliveira - Integrante / Leandro Seiji Goto - Integrante / Andre Vessoni Alexandrino - Integrante / Flavia da Silva Zandonadi - Integrante / Silvia Isabel Palma Ferreira - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 32 / Número de orientações: 21 Membro: Maria Teresa Marques Novo Mansur. |
| 1. | 2008-2011. Caracterizacao genetica de populacoes de dourado (Salminus) e implicacoes para a conservacao desse importante grupo de peixes de nossos rios Descrição: Estudar a variação genética intra e interespecífica no gupo dos dourados e inferir sobre a evolução das espécies e das populações e subsidiar sua conservação com dados genéticos.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Pedro Manoel Galetti Junior - Coordenador / Patrícia Domingues de Freitas - Integrante / Bruno César Rossini - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Pedro Manoel Galetti Junior. |
| 2. | 2008-2010. Citogenetica e Genetica de peixes em regioes imapactadas, com enfase em cabeceiras de rios. O mdelo Alto Sao Francisco-MG Descrição: Descrição: Estudos em desenvolvimento no Laboratório de Citogenética e Biodiversidade da UFSCar têm mostrado que a Citogenética é um instrumento adicional valioso para a Taxonomia, notadamente na identificação de espécies problemáticas presentes na bacia do São Francisco. O presente projeto enfoca estudos citogenéticos/genéticos em peixes de regiões de cabeceira e de transposição de rios (como a do rio Piumhi, originalmente da bacia do rio Grande, para a bacia do rio São Francisco). As principais metas a serem atingidas são: 1) a caracterização da ictiofauna residente no Alto São Francisco e lagoas marginais, com ênfase na bacia do rio Samburá, hoje reconhecido como sua real nascente geográfica, utilizando marcadores cromossômicos e de DNA mitocondrial, em espécies de Characiformes e Siluriformes. 2) a continuidade dos estudos citogenéticos e genéticos (em andamento), englobando espécies de peixes na área da transposição do rio Piumhi. Os dados obtidos serão importantes não só para a caracterização da biodiversidade ictiológica da bacia do São Francisco, como também de possíveis grupos endêmicos, invasores e/ou crípticos na região. Dados preliminares já vêm evidenciando a ocorrência de algumas espécies invasoras da bacia do rio Grande para a bacia do São Francisco, na região da transposição do rio Piumhi. Assim, além da caracterização citogenética/genética das espécies regionais e sua biodiversidade, poderão ser inferidos os efeitos da ação antrópica no Alto São Francisco, notadamente quanto à presença de espécies invasoras associadas com a transposição e desvio de rios e alterações de lagoas marginais. Poucos estudos foram realizados em relação ao rio Samburá e afluentes, principais rotas migratórias dos peixes durante a piracema e os mais importantes para a reposição dos cardumes no Alto São Francisco, reforçando a importância dos estudos ora propostos.. #10;Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . Integrantes: Orlando Moreira Filho - Coordenador / Elisangela Bellafronte da Silva - Integrante / Luiz Antônio Carlos Bertllo - Integrante / Vladimir Pavan Margarido - Integrante / Daniel Rodrigues Blanco - Integrante / Paulo Andreas Buckup - Integrante / Roberto Laridondo Lui - Integrante / Josiane Baccarin Traldi - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 8 / Número de orientações: 1 Membro: Orlando Moreira Filho. Descrição: Estudos em desenvolvimento no Laboratório de Citogenética e Biodiversidade da UFSCar têm mostrado que a Citogenética é um instrumento adicional valioso para a Taxonomia, notadamente na identificação de espécies problemáticas presentes na bacia do São Francisco. O presente projeto enfoca estudos citogenéticos/genéticos em peixes de regiões de cabeceira e de transposição de rios (como a do rio Piumhi, originalmente da bacia do rio Grande, para a bacia do rio São Francisco). As principais metas a serem atingidas são: 1) a caracterização da ictiofauna residente no Alto São Francisco e lagoas marginais, com ênfase na bacia do rio Samburá, hoje reconhecido como sua real nascente geográfica, utilizando marcadores cromossômicos e de DNA mitocondrial, em espécies de Characiformes e Siluriformes. 2) a continuidade dos estudos citogenéticos e genéticos (em andamento), englobando espécies de peixes na área da transposição do rio Piumhi. Os dados obtidos serão importantes não só para a caracterização da biodiversidade ictiológica da bacia do São Francisco, como também de possíveis grupos endêmicos, invasores e/ou crípticos na região. Dados preliminares já vêm evidenciando a ocorrência de algumas espécies invasoras da bacia do rio Grande para a bacia do São Francisco, na região da transposição do rio Piumhi. Assim, além da caracterização citogenética/genética das espécies regionais e sua biodiversidade, poderão ser inferidos os efeitos da ação antrópica no Alto São Francisco, notadamente quanto à presença de espécies invasoras associadas com a transposição e desvio de rios e alterações de lagoas marginais. Poucos estudos foram realizados em relação ao rio Samburá e afluentes, principais rotas migratórias dos peixes durante a piracema e os mais importantes para a reposição dos cardumes no Alto São Francisco, reforçando a importância dos estudos ora propostos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (4) . Integrantes: Luiz Antonio Carlos Bertollo - Integrante / ORLANDO MOREIRA FILHO - Coordenador / VLADIMIR PAVAN MARGARIDO - Integrante / Paulo Andreas Buckup - Integrante / Leonardo F. S. Ingenito - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Luiz Antonio Carlos Bertollo. |
| 3. | 2008-2009. EFEITOS DA NATACAO SUSTENTAVEL SOBRE O CRESCIMENTO, O PERFIL ENZIMATICO DIGESTIVO E A DIGESTIBILIDADE DE DIETAS EM JUVENIS DE MATRINXA, Brycon amazonicus Descrição: O objetivo central do presente projeto é estudar o efeito da natação sustentada na digestibilidade de dietas contendo diferentes níveis de proteína, no crescimento e no perfil enzimático digestivo de juvenis de matrinxã, B. amazonicus. Especificamente propomos: ? Determinar os coeficientes de digestibilidade aparente da proteína e energia das dietas experimentais em função da natação sustentada; ? Avaliar a influência da natação sustentada na atividade das enzimas digestivas (proteases ácidas e alcalinas) envolvidas na digestão da proteína da dieta; ? Verificar a influencia simultânea da natação sustentada e dos níveis de proteína nas enzimas envolvidas no catabolismo de aminoácidos e na excreção de intermediários nitrogenados do fígado, músculo branco e músculo vermelho; ? Determinar a eficiência da utilização de nutrientes e energia em função das mudanças da composição corporal; ? Identificar a magnitude da relação entre a atividade física e a variação nos níveis de proteína da dieta no desempenho de crescimento nos juvenis de matrinxã.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Gilberto Moraes - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.Número de orientações: 1 Membro: Gilberto Moraes. |
| 4. | 2008-2010. Efeitos metabolicos do triclorfon em pacu (Piaractus mesopotamicus) Descrição: Os objetivos desse projeto são: 1- Determinar a concentração letal CL 50-96h do triclorfon para o pacu (Piaractus mesopotamicusi); 2- Determinar e avaliar as respostas metabólicas de P. mesopotamicus submetidos à exposição crônica e sub-letal do triclorfon (10% da CL 50-96h ); 3- Determinar e avaliar as respostas metabólicas de P. mesopotamicus após recuperação de 14 dias.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Gilberto Moraes - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 1 Membro: Gilberto Moraes. |
| 5. | 2008-2009. Estresse oxidativo em matrinxa, Brycon cephalus, exposto a deltametrina ambiental Descrição: Nossa proposta neste projeto é avaliar os efeitos tóxicos da deltametrina ambiental no metabolismo de Brycon cephalus. Para tanto enfatizaremos o sistema de defesa antioxidativa desta espécie, seguindo os procedimentos na ordem abaixo: 1. Determinação da concentração letal CL50-96h de deltametrina para juvenis de B. cephalus . 2. Exposição crônica de juvenis de B. cephalus a 10% da CL50-96h de deltametrina por 96 horas e avaliação dos seus efeitos no metabolismo antioxidativo. 3. Determinação da capacidade de recuperação dos juvenis de B. cephalus após um período de 10 e 20 dias de pós-exposição à deltametrina, através da avaliação do metabolismo antioxidativo.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Gilberto Moraes - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.Número de orientações: 1 Membro: Gilberto Moraes. |
| 6. | 2008-Atual. Producao de vacinas recombinantes contra erisipela suina Descrição: A perspectiva geral da linha de pesquisa inclui a clonagem deseqüências nucleotídicas que codificam para antígenos de Erysipelothrix rhusiopathiae em Salmonella typhimurium atenuada, fusionados ao sistema de secreção de #945;-hemolisina de E. coli. Esta estratégia permite utilizar o microorganismo recombinante atenuado em vacinas ministradas via nasal, com uma série de vantagens sobre as vacinas convencionais (que utilizam E. rhusiopathiae atenuada ou inativada) e sobre as vacinas com subunidades antigênicas. Simultaneamente, serão estudadas em profundidade estratégias para otimização do cultivo das bactérias recombinantes (E. coli e S. typhimurium) em biorreator de bancada automatizado, visando à futura implantação industrial do processo. O levantamento das cinéticas de crescimento para definição de perfis ótimos de vazão de meio suplementar é ponto crucial no desenvolvimento desse processo biotecnológico, e também faz parte do escopo deste projeto.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Maria Teresa Marques Novo Mansur - Integrante / Teresa Cristina Zangirolami - Integrante / Roberto de Campos Giordano - Coordenador / Antonio Jose Gonçalves da Cruz - Integrante / Maria do Carmo Nicoletti - Integrante / Raquel de Lima Camargo Giordano - Integrante / Monica Iemma - Integrante / Charles Dayan Farias de Jesus - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Maria Teresa Marques Novo Mansur. |
| 7. | 2008-2010. Rede de Coperacao em Genetica de Peixes para a Diversidade, Conservacao e Biologia Evolutiva Descrição: Descrição: Trata-se de um projeto estratégico/temático que visa a verticalização dos Programas de Pós-Graduação em Genética e Evolução da Universidade Federal de São Carlos (SP) e do Programade Biologia Evolutiva da Universidade Estadual de Ponta Grossa (PR). Constituem os principais objetivos do projeto: (a) consolidar o programa de Pós-Graduação em Biologia Evolutiva, da Universidade Estadual de Ponta Grossa, recém implantado, especialmente pelo intercâmbio e mobilidade docente e discente e aproveitamento da infra-estrutura disponível em cada um dos programas participantes: (b) maximizar a cooperação entre os dois grupos de pesquisa envolvidos, com o estímulo à interação científico-acadêmica; (c) promover o desenvolvimento regional equilibrado, na formação de recursos humanos especializados e na descentralização da produção científica-tecnológica; (d) promover inovações através da implantação de novas metodologias de pesquisa; (c) ampliar a formação de mestres e doutores, assim como incentivar jovens talentos para a pesquisa, por intermédio da iniciação científica.. #10;Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. #10;Coordenadores : ORLANDO MOREIRA FILHO - / ROBERTO FERREIRA ARTONI - #10;Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro... Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (6) . Integrantes: Orlando Moreira Filho - Coordenador / Roberto Ferreira Artoni - Integrante / Elisangela Bellafronte da Silva - Integrante / Luiz Antônio Carlos Bertllo - Integrante / Marcelo Ricardo Vicari - Integrante / Sandra Mariotto - Integrante / Roberto Laridondo Lui - Integrante / Josiane Baccarin Traldi - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 20 Membro: Orlando Moreira Filho. |
| 8. | 2008-2011. Respostas metabolicas de juvenis de matrinxa (Brycon amazonicus) submetidos ao exercicio intermitente Descrição: A piscicultura é uma atividade comercial com grande potencial de crescimento, já que há uma grande variedade de espécies que podem ser cultivadas e boas condições climáticas, porém, o potencial para a expansão dessa atividade é pouco aproveitado. O exercício pode resultar em melhores taxas de crescimento, de conversão alimentar e de eficiência de utilização dos nutrientes ofertados. Sabe-se que o exercício moderado de longa duração melhora o crescimento, as taxas de conversão alimentar, a habilidade de nado, modifica as respostas fisiológicas e bioquímicas, aumenta as taxas de sobrevivência e diminui o comportamento agressivo de diversas espécies. No exercício de longa duração a contribuição dos lipídeos e dos carboidratos torna-se maior, o que resulta em maior crescimento dos peixes e favorece o efeito poupador de proteína. Provavelmente o exercício aeróbico permite tanto maior mobilização de TGL e AGL através do plasma para os tecidos requisitados como o aumento da sua oxidação nas mitocôndrias das células musculares. Em estudos realizados com matrinxãs (Brycon amazonicus) exercitados a 1cc/seg, observou-se melhores taxas de crescimento e conversão alimentar, maior oxidação de lipídios e carboidratos (40% e 15%) e maior síntese de proteína muscular (30%). Também se observou que juvenis de matrinxãs exercitados entre 1,0 e 1,5 cc/s, apresentam melhores taxa de crescimento devido à maior de síntese de proteína muscular. Entretanto, não há trabalhos que comparem as respostas de crescimento de peixes submetidos a exercício contínuo com aqueles que realizam a atividade de forma intermitente. O presente projeto visa avaliar as respostas metabólicas e de crescimento do matrinxã (Brycon amazonicus) em decorrência da realização de exercício aeróbico intermitente. Para isso deveremos avaliar: 1) o tempo ideal para a realização de exercício intermitente; 2) o perfil metabólico de músculo branco; 3) o perfil metabólico de músculo vermelho; 4) o perfil metabólico de fígado; 5). Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . Integrantes: Gilberto Moraes - Coordenador / Araceli Hackbart - Integrante / Gustavo Alberto Arbeláez-Rojas - Integrante / FABRIZZI, F. (Fernando Fabrizzi) - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Membro: Gilberto Moraes. |
| 9. | 2008-2010. Respostas metabolicas de juvenis de matrinxa (Brycon amazonicus) submetidos ao exercicio intermitente Descrição: O presente projeto visa avaliar as respostas metabólicas e de crescimento do matrinxã (Brycon amazonicus) em decorrência da realização de exercício aeróbico intermitente através das determinações de: ? O tempo ideal para a realização de exercício intermitente; ? O perfil metabólico de músculo branco; ? O perfil metabólico de músculo vermelho; ? O perfil metabólico de fígado; ? O perfil das respostas hematológicas; ? O desempenho zootécnico da espécie.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Gilberto Moraes - Coordenador. Número de orientações: 1 Membro: Gilberto Moraes. |
| 10. | 2008-2012. Trophic cascades in a defaunated landscape: the Atlantic rainforest perspective Descrição: Estudar o efeito da defaunação, em especial da megafauna, na estrutura das comunidades vegetais da Mata Atlântica.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (5) / Doutorado: (2) . Integrantes: Pedro Manoel Galetti Junior - Integrante / Alexandra Sanches - Integrante / Mauro Galetti - Coordenador / Rodolfo Dirzo - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Pedro Manoel Galetti Junior. |
| 1. | 2007-2010. Aislamiento y caracterizacion de loci microsatelites en la especie migratoria Pimelodus grosskopsfii en la cuenca del alto Magdalena Descrição: Isolar e caracterizar sequencias microssatélites numa espécie de bagre de importancia economica na bacia do rio Magdalena, Colombia, para estudos genético-populacionais visando o manejo e a conservação desses peixes.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Pedro Manoel Galetti Junior - Integrante / Mauricio Carrillo Avila - Integrante / Henry Ostos Alfonso - Coordenador / Carlos Andres Hernandez Escobar - Integrante / Ruben Dario Valbuena - Integrante. Financiador(es): Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación - Auxílio financeiro. Membro: Pedro Manoel Galetti Junior. |
| 2. | 2007-2010. Analise proteomica diferencial entre estirpes de Xanthomonas axonopodis que diferem na virulencia e hospedeiro: analise preliminar da fracao proteica periplasmatica Descrição: Estirpes de Xanthomonas axonopodis que diferem no grau de virulencia dos sintomas do cancro cítrico, terão seus perfis de proteínas comparados por SDS-PAGE após crescimento in vitro em meio indutor e em meio nao indutor de patogenicidade. As proteínas diferenciais serão analisadas por sequenciamento N-terminal. Eventualmente, os perfis serao comparados por 2D-PAGE.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Maria Teresa Marques Novo Mansur - Coordenador / Maria Célia Bertolini - Integrante / Ana Paula Felicio - Integrante / Heloisa Sobreiro Selistre de Araujo - Integrante / Juliana Artier - Integrante / Flavia Zandonadi - Integrante / José Belasque Júnior - Integrante / Rafaela Fernandes - Integrante. Financiador(es): Fundo de Defesa da Citricultura - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 12 / Número de orientações: 5 Membro: Maria Teresa Marques Novo Mansur. |
| 3. | 2007-2010. CITOGENETICA E EVOLUCAO CARIOTIPICA DE PEIXES DE AGUA DOCE. VII. Descrição: 1. Sistema ZZ /ZW no gênero Triportheus#10;Caracterização do cariótipo de novas espécies/populações de Triportheus para fins comparativos com espécies co-genéricas já estudadas, enfatizando o sistema de cromossomos sexuais ZZ/ZW presente nesse grupo, utilizando metodologias convencionais de estudo, bandamentos cromossômicos e localização dos sítios de rDNA 18S e 5S. Identificação de segmentos de DNA compartilhados pelos cromossomos Z e W de Triportheus, através de obtenção de sondas específicas do cromossomo Z e posterior hibridação fluorescente in situ (FISH) no complemento cariotípico, visando a identificação de regiões de homologia remanescentes entre os cromossomos Z e W de diferentes espécies, seu posicionamento e extensão nos cromossomos W, complementando a análise da diferenciação desse sistema sexual nesse grupo de peixes.#10;#10;2. Sistema X1X1X2X2 / X1X2Y em Hoplias malabaricus e Erythrinus erythrinus#10;Aprofundar o conhecimento da estrutura cariotípica dos citótipos D de Hoplias malabaricus e de Erythrinus erythrinus, assim como do sistema de cromossomos sexuais múltiplos (X1X1X2X2 / X1X2Y), presente nesses grupos.#10;#10;3. Análise do sistema de NORs múltiplas e dos sítios de rDNA 5S em Serrasalminae da Amazônia Central#10;Mapeamento cromossômico dos sítios de rDNAr 18S e 5S no cariótipo de piranhas da Amazônia Central, empregando a metodologia de hibridação fluorescente in situ (FISH), com a comparação entre os resultados obtidos com FISH e os dados relativos às regiões organizadoras de nucléolos evidenciadas pelo nitrato de prata (Ag-NORs), detectando a ocorrência de sítios adicionais de NORs no cariótipo das espécies.#10;Análise do comportamento evolutivo dos sítios de rDNA 18S e 5S entre diferentes espécies de Serrasalminae e sua possível participação nos eventos de evolução cariotípica desse grupo.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Luiz Antonio Carlos Bertollo - Coordenador / Marcelo Ricardo Vicari - Integrante / Celeste Mutuko Nakayama - Integrante / Debora Diniz Bezerra - Integrante / Marcelo de Bello Cioffi - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Membro: Luiz Antonio Carlos Bertollo. |
| 4. | 2007-2011. Comparacao dos efeitos de dietas com diferentes niveis de carboidrato na atividade das enzimas digestivas e no metabolismo de matrinxa, Brycon amazonicus, e pintado, Pseudoplatystoma corruscans. Descrição: Devido à importância comercial crescente que essa espécie apresenta e a possibilidade do estudo da secreção de enzimas digestivas em peixes pode tornar mais claros alguns aspectos da fisiologia nutritiva e também auxiliar a resolver alguns problemas nutricionais (HIDALGO et al., 1999), o conhecimento das respostas metabólicas em diferentes condições alimentares pode possibilitar o ajuste do uso de nutrientes para otimização do crescimento e para o preparo de dietas mais econômicas. Dito isto, este trabalho terá como objetivo estudar o papel do amido na expressão da secreção de enzimas digestivas de B. amazonicus e P. corruscans e as diferenças entre essas duas espécies em relação à digestão carboidratos e ao metabolismo de carboidratos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Gilberto Moraes - Coordenador. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.Número de orientações: 1 Membro: Gilberto Moraes. |
| 5. | 2007-2010. EFEITOS DA EXTRUSAO EM DIETAS COM BAIXO E ALTO NIVEIS DE CARBOIDRATOS E LIPIDEOS SOBRE O DESEMPENHO DE JUVENIS DE PACU (Piaractus mesopotamicus) Descrição: Avaliação da adaptação de juvenis de P. mesopotamicus alimentado com dietas peletizadas e extrusadas de baixo e alto nível de carboidratos e lipídeos para saber: 1. Se o processamento da dieta exerce influência na disponibilidade dos nutrientes 2. Se o processamento altera a digestibilidade das dietas 3. Se há algum reflexo das dietas processadas no metabolismo da espécie. Espera-se desta forma avaliar o processo digestivo e suas correlações metabólicas através da quantificação da atividade de enzimas chaves do metabolismo intermediário. A presente proposta é parte de um projeto maior que compreende nutrição, metabolismo intermediário e processos digestivos em teleósteos Neotropicais de interesse para a aqüicultura .. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Gilberto Moraes - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa. Membro: Gilberto Moraes. |
| 6. | 2007-Atual. Estado de conservacao de Partamona seridoensis Pedro e Camargo, 2003 (Hymenoptera: Apidae) em areas de Caatinga com diferentes niveis de degradacao ambiental: densidade de ninhos, relacao com cupins, variabilidade genetica e recursos florais Descrição: O objetivo principal deste projeto de pesquisa é descrever, analisar e ententer o estado atual de conservação das populações de Partamona seridoensis na Caatinga do Carri da Paraíba. Com o propósito de alcançar o objetivo geral deste estudo serão realizados estudos em populações de Partamona seridoensis do Cariri paraibano, comparando a densidade de ninhos em áreas com diferentes estados de conservação da flora, verificando a relação dessas abelhas com as espécies de cupins cujos termiteiros são utilizados para nidificação pelas abelhas, as espécies vegetais utilizadas como recursos, e a variabilidade genética e sua relação com mecanismos de dispersão e colonização do ambiente pelas abelhas sem ferrão. Edital Universal CNPq 15/2007 - Valor: R$ 40.963,76. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Marco Antonio Del Lama - Integrante / Celso Feitosa Martins - Coordenador / Carlo Rivero Moura Fernandes - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 1 Membro: Marco Antonio Del Lama. |
| 7. | 2007-2009. Estrutura populacional do camarao-rosa Farfantepenaeus paulensis no litoral das regioes sudeste e sul do Brasil Descrição: Estudar a estrutura pulacional do camarão-rosa por meio de marcadores moleculares e dados morfológicos. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Pedro Manoel Galetti Junior - Coordenador / Artur de Lima Preto - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Pedro Manoel Galetti Junior. |
| 8. | 2007-2011. Estudo da influencia de fontes lipidicas dietarias no desempenho de producao e nas respostas metabolicas de juvenis de pacu (Piaractus mesopotamicus) expostos ao estresse termico Descrição: Neste projeto pretende-se avaliar o efeito das diferentes fontes lipídicas nas dietas sobre o estresse térmico em juvenis de pacu (Piaractus mesopotamicus). Especificamente está proposta: Avaliação da eficiência das diferentes fontes lipídicas em dietas semi-purificadas, no desempenho de produção, composição corporal e eficiência de retenção de nutrientes. Avaliação do perfil de ácidos graxos do músculo de juvenis de pacu submetidos a diferentes fontes lipídicas nas dietas; Verificação das alterações plasmáticas de íons envolvidos no equilíbrio iônico; Determinação das respostas metabólicas através da quantificação dos intermediários metabólicos chave.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Gilberto Moraes - Coordenador. Número de orientações: 1 Membro: Gilberto Moraes. |
| 9. | 2007-Atual. Genomica comparada de especies de moscas-das-frutas do grupo fraterculus Descrição: Este projeto pretende utilizar-se da identificação de marcadores genéticos pela análise de ESTs (Expressed Sequenced Tags) obtidos da expressão de genes individuais, que permitirão o isolamento de SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) que serão genotipados em cruzamentos entre linhagens de Anastrepha fraterculus e A. obliqua são das maiores ameaças à fruticultura nacional. Mapas de ligação derivados da segregação destes SNPs serão utilizados na genômica comparada entre estas espécies buscando a identificação de regiões envolvidas na diferenciação das mesmas e também em estudos de genômica evolutiva. Com este projeto, buscamos subsídios para a determinação de genes envolvidos na especiação e diferenciação de tais espécies, o que será importante para o melhor entendimento de processos envolvidos em especiação, mas principalmente porque tais conhecimentos poderão permitir o estabelecimento de melhores condições para o controle destas grandes pragas agrícolas.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (4) . Integrantes: Reinaldo Otávio Alvarenga Alves de Brito - Coordenador / Iderval da Silva Junior Sobrinho - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 21 / Número de orientações: 13 Membro: Reinaldo Otavio Alvarenga Alves de Brito. |
| 10. | 2007-2011. Perfil metabolico, digestivo e desempenho de tilapias vermelhas (Oreochromis niloticus x Oreochromis mossambicus) submetidas a dietas com diferentes porcentagens de carboidratos Descrição: Os objetivos desse trabalho consistem em verificar os efeitos do carboidrato da dieta nas atividades das enzimas digestivas, metabólicas e no desempenho das tilápias juvenis. Especificamente serão avaliados: - as atividades enzimáticas de protreases, amilases e lípases em tilápias juvenis submetidas às dietas com 35, 40, 45 e 55% de carboidrato. - a influência do carboidrato da dieta nas atividades metabólicas das tilápias juvenis, submetidas às dietas com 35, 40, 45 e 55% de carboidrato. - o desempenho das tilápias submetidas a esses tratamentos. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Gilberto Moraes - Coordenador. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa. Membro: Gilberto Moraes. |
| 11. | 2007-2011. RELACAO CARBOIDRATO LIPIDEO NA ALIMENTACAO DE JUVENIS DE TAMBAQUI (Colossoma macropomum) Descrição: O presente projeto pretende investigar os efeitos das diferentes relações entre o carboidrato e o lipídeo como poupadores de proteína para juvenis de tambaqui. Especificamente é proposta a: 1) Avaliação da eficiência da relação carboidrato lipídeo no desempenho de produção e eficiência de retenção de nutrientes. 2) Determinação dos coeficientes de digestibilidade aparente dos nutrientes e da energia nas dietas com diferentes relações carboidrato lipídeo. 3) Determinação da influência das diferentes relações entre carboidrato e lipídeo, sobre as atividades das enzimas digestivas. 4) Determinação da influência de dietas com diferentes relações carboidrato e lipídeo no perfil metabólico tissular 5) Determinação da influência das dietas com diferentes relações carboidrato e lipídeo, sobre a atividade de enzimas chaves do metabolismo intermediário.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Gilberto Moraes - Coordenador. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.Número de orientações: 1 Membro: Gilberto Moraes. |
| 12. | 2007-2010. Relacoes de parentesco em populacoes naturais de Ciconiiformes ( Aves) : Descrição: Esse estudo utiliza marcadores moleculares para a determinação do sistema de acasalamento dessa espécies de aves aquáticas. Os dados levantados no presente projeto contribuirão para o entendimento da biologia das espécies e serão úteis como ferramenta na elaboração de estratégias de conservação e manejo das espécies que se encontram ameaçadas em algumas áreas da sua distribuição. Os objetivos específicos são: determinar do nível de variabilidade e diferenciação genética das três populações de Tuiuiús existentes no continente americano; fazer inferências sobre os eventos históricos que acometeram as subpopulação através da utilização da metodologia de NCA; produzir dados para dar suporte a políticas de preservação do Pantanal utilizando o Tuiuiú como ?espécie bandeira? e o Pantanal como importante área para conservação dos recursos genéticos da espécie.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Silvia Nassif Del Lama - Coordenador / Iara Freitas Lopes - Integrante / Susan Haig - Integrante / Carolina Mino - Integrante / Michael Russello - Integrante / Priscila Mussi Fernandes Gonçalves - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.Número de orientações: 1 Membro: Silvia Nassif Del Lama. |
| 13. | 2007-2009. Respostas metabolicas de catfish americano submetido a concentracoes sub-letais de fenol Descrição: Quando um tóxico entra no organismo de animais aquáticos, muitas respostas bioquímicas e fisiológicas ocorrem, podendo ser adaptativas ou indicadoras de toxicidade. Respostas bioquímicas têm sido freqüentemente utilizadas como ferramenta de monitoramento de poluentes, pois processos bioquímicos apresentam respostas sensíveis e rápidas em situações adversas. Com elas, pode-se compreender os mecanismos de ação do poluente e delinear possíveis formas para minimizar os efeitos danosos aos animais (Begum, 2004). A espécie escolhida é nativa e com valor comercial, porém pouco conhecida cientificamente (Carneiro Mikos, 2005), inclusive do ponto de vista toxicológico. Sendo assim, é importante estudar os efeitos do fenol, que é um poluente comumente encontrado em rios e oceanos, em um peixe comercial e pouco explorado em termos toxicológicos. Dessa forma, o presente estudo tem como objetivos: 1. Determinar a DL50 para fenol em Rhamdia quelen; 2. Determinar e avaliar as respostas metabólicas de Rhamdia quelen submetidas à exposição crônica e sub-letal de fenol (10% da DL50); 3. Determinar e avaliar as respostas metabólicas de Rhamdia quelen durante o período de recuperação.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Gilberto Moraes - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 1 Membro: Gilberto Moraes. |
| 1. | 2006-2009. Estrutura genetica de populacoes de peixes migradores de agua doce e seu valor para programas de conservacao Descrição: Visa isolar e caracterizar microssatélites de diferentes espécies de peixes migradores visando disponibilizar marcadores potencialmente úteis aos estudos relacionados ao manejo da pesca, piscicultura e conservação deste grupo; analisar a variação genética através desses microssatélites e inferir sobre a estrutura populacional dessas importantes espécies e sobre os possíveis impactos na variação genética causados por ações antrópicas em seus hábitats e analisar a diversidade haplotípica do DNAmit de diferentes espécies ocorrentes em importantes bacias hidrográficas e inferir sobre os padrões filogeográficos dos grupos analisados.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (4) . Integrantes: Pedro Manoel Galetti Junior - Coordenador / Alexandra Sanches - Integrante / Luis Fernando Carvalho Costa - Integrante / Mauricio Carrillo Avila - Integrante / Nivaldo Piorski - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Pedro Manoel Galetti Junior. |
| 2. | 2006-2008. ESTUDO DAS ALTERACOES METABOLICAS EM PACU(Piaractus mesopotamicus) CAUSADAS PELA EXPOSICAO AO FENOL. Descrição: Esse projeto tem por objetivo estudar as alterações metabólicas em P. mesopotamicus e as lesões tissulares de fígado e músculo branco, através de indicadores bioquímicos, causadas pela exposição ao fenol. As estratégias para se atingir esses objetivos serão: 1. Determinar a CL50 de 96 horas para o fenol em juvenis de P. mesopotamicus. 2. Determinar as variações bioquímico-metabólicas em juvenis de pacu expostos a 1/10 da CL50 por 96 horas. 3. Relacionar as determinações bioquímicas às alterações metabólicas e lesões tissulares esperadas.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Gilberto Moraes - Coordenador. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.Número de orientações: 1 Membro: Gilberto Moraes. |
| 3. | 2006-2008. ESTUDO DOS PROCESSOS DIGESTIVOS PROTEOLITICOS EM PACU (Piaractus mesopotamicus) ALIMENTADO COM TEORES CRESCENTES DE PROTEINA Descrição: Os objetivos deste projeto são: 1. Determinar o nível de proteína, no arraçoamento iso-energético de pacu, capaz de maximizar a indução de proteases no trato digestório. 2. Determinar na luz do trato digestório de pacu as atividades proteolíticas durante o processo digestivo, na situação alimentar de indução máxima e mínima de proteases. 3. Comparar as atividades proteolíticas da luz do trato digestório com as atividades da parede, nas situações alimentares de indução máxima e mínima de proteases.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Gilberto Moraes - Coordenador. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.Número de orientações: 1 Membro: Gilberto Moraes. |
| 4. | 2006-2008. Estudos citogeneticos de peixes em regiao de transposicao de rios. O caso do rio Piumhi Descrição: Descrição: Toda gama de conhecimento acumulado nos últimos 30 anos pela citogenética de peixes possibilitou interações entre diferentes áreas do conhecimento, colaborando com a taxonomia, a sistemática, a piscicultura e a Ecologia, entre outras áreas. A citogenética tem sido uma ferramenta eficaz na resolução de alguns problemas de identificação de espécies de difícil caracterização, como os quot;complexos de espéciesquot;, mostrando diferenças cromossômicas que permitiram caracterizar espécies distintas, como no caso dos complexos Astyanax, Hoplias, Eigenmannia, entre outros. Contrariamente, também auxiliou na confirmação de espécies em situação de sinonímia, como no caso de Parodon nasus. O objetivo principal deste projeto será o estudo cromossômico de espécies das famílias Parodontidae, Prochilodontidae, Characidae, Pimelodidade e Erythrinidae, encontradas na região onde ocorreu a transposição do rio Piumhi, utilizando dados de citogenética clássica e molecular, obtidos a partir de coloração Giemsa convencional, bandamento C, análise das RONs (regiões organizadoras de nucléolos) e FISH (hibridação fluorescente in situ). A situação encontrada na região da transposição do rio Piumhi, da bacia do rio Grande para a bacia do rio São Francisco, por ocasião da construção da Represa de Furnas é muito peculiar, pois a quebra da barreira geográfica pela ação do homem, há 43 anos atrás, deve ter colocado representantes de um mesmo táxon de diferentes bacias, com histórias evolutivas distintas, em condição de simpatria. Assim, além da possível detecção de distintas formas cariotípicas simpátricas para esses taxa, e de seu comportamento sob esta condição, como a manutenção ou não de um isolamento reprodutivo, objetiva-se também o reconhecimento de formas invasoras e sua dispersão pelas cabeceiras do rio São Francisco, subsidiando estudos sobre a distribuição biogeográfica dos peixes na região e a melhor compreensão da biodiversidade presente nessa bacia. www.transpiumhi.ufscar.br #10;S. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (3) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (2) . Integrantes: Orlando Moreira Filho - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Número de produções C, T A: 3 Membro: Orlando Moreira Filho. |
| 5. | 2006-2008. Estudos citogeneticos em peixes em area de conexao entre bacias hidrograficas. www.transpiumhi.ufscar.br Descrição: Estudos citogenéticos em peixes em área de conexão entre bacias hidrográficas. #10;Nos últimos 30 anos a citogenética de peixes vem contribuindo significativamente para diversas áreas do conhecimento biológico, com estudos cariotípicos em diferentes ordens e famílias de peixes de água doce e marinhos, com a descoberta de distintos sistemas de cromossomos sexuais e de polimorfismos cromossômicos, ressaltando os cromossomos supranumerários. Toda esta gama de conhecimento acumulado possibilitou interações entre diferentes áreas do conhecimento, colaborando com a taxonomia e a sistemática, com a piscicultura no acompanhamento de cruzamentos de linhagens distintas de peixes, na detecção de formas híbridas induzidas pelo homem, como nos casos dos ?tambacus e paquis?, na Ecologia, no mapeamento e distribuição geográfico de espécies e na detecção de híbridos naturais. A citogenética tem sido uma ferramenta eficaz na resolução de alguns problemas de identificação de espécies de difícil caracterização pelos métodos clássicos da taxonomia, como os ?complexos de espécies?, mostrando diferenças cromossômicas que permitiram caracterizar espécies distintas, como no caso dos complexos Astyanax, Hoplias, Eigenmannia, entre outros. Contrariamente, também auxiliou na confirmação de espécies em situação de sinonímia, como no caso de Parodon nasus. O objetivo principal deste projeto será o estudo cromossômico de espécies das famílias Parodontidae, Prochilodontidae, Characidae, Pimelodidade e Erythrinidae, encontradas na região onde ocorreu a transposição do rio Piumhi, utilizando dados de citogenética clássica e molecular, obtidos a partir de coloração Giemsa convencional, bandamento C, análise das RONs (regiões organizadoras de nucléolos) e FISH (hibridação fluorescente in situ). A situação encontrada na região da transposição do rio Piumhi, da bacia do rio Grande para a bacia do rio São Francisco, por ocasião da construção. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (3) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (4) . Integrantes: Orlando Moreira Filho - Coordenador / Luiz Antônio Carlos Bertollo - Integrante / Wellington Adriano Peres - Integrante / Vladimir Pavan Margarido - Integrante / Daniel Luis Zanella Kantek - Integrante / Daniel Rodrigues Blanco - Integrante / Paulo Andreas Buckup - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 1 Membro: Orlando Moreira Filho. Descrição: Toda gama de conhecimento acumulado nos últimos 30 anos pela citogenética de peixes possibilitou interações entre diferentes áreas do conhecimento, colaborando com a taxonomia, a sistemática, a piscicultura e a Ecologia, entre outras áreas. A citogenética tem sido uma ferramenta eficaz na resolução de alguns problemas de identificação de espécies de difícil caracterização, como os quot;complexos de espéciesquot;, mostrando diferenças cromossômicas que permitiram caracterizar espécies distintas, como no caso dos complexos Astyanax, Hoplias, Eigenmannia, entre outros. Contrariamente, também auxiliou na confirmação de espécies em situação de sinonímia, como no caso de Parodon nasus. O objetivo principal deste projeto será o estudo cromossômico de espécies das famílias Parodontidae, Prochilodontidae, Characidae, Pimelodidade e Erythrinidae, encontradas na região onde ocorreu a transposição do rio Piumhi, utilizando dados de citogenética clássica e molecular, obtidos a partir de coloração Giemsa convencional, bandamento C, análise das RONs (regiões organizadoras de nucléolos) e FISH (hibridação fluorescente in situ). A situação encontrada na região da transposição do rio Piumhi, da bacia do rio Grande para a bacia do rio São Francisco, por ocasião da construção da Represa de Furnas é muito peculiar, pois a quebra da barreira geográfica pela ação do homem, há 43 anos atrás, deve ter colocado representantes de um mesmo táxon de diferentes bacias, com histórias evolutivas distintas, em condição de simpatria. Assim, além da possível detecção de distintas formas cariotípicas simpátricas para esses taxa, e de seu comportamento sob esta condição, como a manutenção ou não de um isolamento reprodutivo, objetiva-se também o reconhecimento de formas invasoras e sua dispersão pelas cabeceiras do rio São Francisco, subsidiando estudos sobre a distribuição biogeográfica dos peixes na região e a melhor compreensão da biodiversidade presente nessa bacia.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (5) . Integrantes: Luiz Antonio Carlos Bertollo - Integrante / ORLANDO MOREIRA FILHO - Coordenador / VLADIMIR PAVAN MARGARIDO - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Luiz Antonio Carlos Bertollo. |
| 6. | 2006-2009. Genetica da conservacao de populacoes do mico-leao-da-cara-preta (Leontopithecus caissara) da Ilha de Superagui e do continente, Parana. Descrição: O projeto objetiva o conhecimento da estrutura genética do mico-leão-de-cara-preta, buscando subsidiar medidas de manejo e conservação dessa espécie ameaçada de extinção.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Pedro Manoel Galetti Junior - Coordenador / Milene Moura Martins - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Fundação Biodiversitas - Auxílio financeiro. Membro: Pedro Manoel Galetti Junior. |
| 7. | 2006-2011. Genetica de populacoes de Ciconiiformes ( Aves) em areas umidas brasileiras Descrição: O objetivo geral do projeto será verificar se as populações de Mycteria americana, Jabiru mycteria, Platalea ajaja e Ardea alba estão estruturadas genéticamente e esclarecer como estavam distribuídas desde a última glaciação. Duas estratégias serão utilizadas: a) estudar populações de espécies diferentes dentro de uma mesma região e habitat para se determinar o grau de estruturação e diversidade intra-específica b) estudar populações de uma mesma espécie em regiões diferentes para se determinar o grau de isolamento entre elas e sua distribuição desde um passado recente. Populações do manguezal ao norte do país, do Pantanal e dos banhados do RS serão estudadas. Sequências da região controladora do DNA mitocondrial e frequências em locos microssatélites embasarão os cálculos de Fst e a análise filogeográfica (NCA). Serão feitas inferências sobre o efeito do histórico populacional e o efeito geográfico na estrutura atual das populações . Espera-se produzir dados que dêem suporte às políticas de preservação da avifauna aquática do Pantanal e de outras áreas úmidas brasileiras.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Mestrado acadêmico: (4) / Doutorado: (1) . Integrantes: Silvia Nassif Del Lama - Coordenador / Iara Freitas Lopes - Integrante / Carolina Mino - Integrante / Juliana Rossi Souza - Integrante / Luiza Helena Silva Avelar - Integrante / Andiara Silos - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 1 Membro: Silvia Nassif Del Lama. |
| 1. | 2005-Atual. Estudo de marcadores geneticos em especies nativas brasileiras Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Reinaldo Otávio Alvarenga Alves de Brito - Coordenador / Fátima Becker Guedes - Integrante / Fernando Pacheco Rodrigues - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 4 / Número de orientações: 1 Membro: Reinaldo Otavio Alvarenga Alves de Brito. |
| 2. | 2005-2007. Estudo dos efeitos metabolicos resultante do estresse causado pela exposicao ambiental ao fenol no teleosteo de agua doce matrinxa (Brycon cephalus Descrição: A poluição é hoje um problema que afeta todos os ambiente inclusive o de água doce, e conseqüentemente, os organismos que vivem nele. Os peixes formam um grupo de grande importância sob a perspectiva ecotoxicológica, pois são o maior grupo dentre os vertebrados. Segundo o relatório de 2001 sobre a qualidade das águas interiores do Estado de São Paulo, o fenol é uma das substâncias químicas exógenas que está em concentração acima da permitida por lei. Este xenobiótico é um composto orgânico e lipofílico. Sua presença nos corpos de água se deve principalmente aos despejos de origem industrial. O fenol é um composto tóxico aos organismos aquáticos em concentrações relativamente baixas, tendo ação genotóxica, carcinogênica, imunotóxica, estando ainda, relacionado à produção de radicais livres. O matrinxã é um teleósteo de água doce, originário da bacia Amazônica, vem sendo amplamente introduzido no Estado de São Paulo através da piscicultura. Esta espécie tem apresentado alta adaptabilidade às condições de cativeiro, aceitando bem a alimentação artificial, e apresentando excelentes índices de crescimento. Os objetivos deste projeto são analisar os efeitos do fenol na indução do metabolismo antioxidativo eritrocitário e sua biotransformação hepática (fase I e fase II), além da verificação das alterações no metabolismo intermediário e possíveis danos histopatológicos. Para tal, serão realizados cinco experimentos. O primeiro será a determinação da CL50 de 96 horas. A partir deste, três experimento para determinar os efeitos bioquímicos e histopatológicos da exposição ao fenol por 96 horas (1/10 da CL50 de 96 horas) utilizando-se 10 peixes teste e 10 controle. Em seqüência, será realizado um experimento de recuperação de 4 e 15 dias a esta exposição. Nestes experimentos, o sangue será coletado, e então os animais serão sacrificados para a amostragem do fígado e músculo branco. No sangue serão determinados os parâmetros hematológicos e enzimas do metabolismo antioxidativo e. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Gilberto Moraes - Coordenador / Lucia Helena Aguiar - Integrante / Tiago S F Hori - Integrante / Ive Marchioni Avilez - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Gilberto Moraes. |
| 3. | 2005-2007. Estudo dos mecanismos adaptativos e ajustes metabolicos de pintado (Pseudoplatystoma corruscans) arracoados com diferentes relacoes proteina/carboidrato: utilizacao de enzimas como indicadoras nutricionais e determinantes de estados limitantes Descrição: Esse projeto visa dar continuidade aos estudos do metabolismo adaptativo de pintado (Pseudoplatystoma corruscans) frente às variações nutricionais da dieta. A espécie proposta é de amplo interesse comercial devido à excelente qualidade de sua carne, esportividade na pesca e potencial para a aqüicultura. Entretanto, sua tecnologia de produção ainda não está perfeitamente estabelecida. O objetivo deste trabalho é estabelecer índices bioquímicos como indicadores da condição nutricional. Para a concretização destes objetivos avaliaremos e compararemos o aproveitamento de carboidratos da dieta em relação à fração protéica, buscando um balanceamento que atinja o ?efeito poupador de proteínas?. Esta avaliação envolverá o estudo de rotas metabólicas que indiquem a possibilidade de utilização das diferentes frações nutritivas da dieta pela espécie. Serão empregadas técnicas bioquímicas tais como a determinação e quantificação da atividade de enzimas chaves do metabolismo intermediário relacionadas à fisiologia nutricional, e a determinação da concentração de metabólitos, para estabelecimento das variações do perfil bioquímico da espécie.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Gilberto Moraes - Coordenador / Lícia Maria Lundstedt - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Gilberto Moraes. |
| 4. | 2005-2007. O impacto da transposicao de rios na biodiversidade, um estudo de caso. A transposicao do rio Piumhi para o rio Sao Francisco. Descrição: 13-Auxílio à Pesquisa CNPq (2005). O impacto da transposição de rios na biodiversidade, um estudo de caso: A transposição do rio Piumhi para o rio São Francisco. #10;A estratégia da transposição de águas já foi utilizada em diversos países e contimentes. No Brasil, um projeto antigo é o da transposição de águas do rio São Francisco para bacias do Nordeste, visando a perenização de rios temporários e a diminuição da escassez de água na região semi-árida, em alguns estados nordestinos. O assunto é altamente controverso, pois há ainda uma grande carência de estudos de forneçam informações sobre os impactos decorrentes da transposição de rios entre bacias. No sudeste brasileiro, a transposição de águas de um rio da bacia do Alto Paraná para a bacia do rio São Franscisco, há cerca de 40 anos, oferece uma oportunidade ímpar para um estudo sobre o impacto da transposiçào de rios sobre a biodiversidade. O presente estudo propõe uma avaliação da biodiversidade em comunidades planctônicas, bentônicas e nectônicas do rio Piumhi, antigo afluente do rio Grande (bacia do rio Paraná), o qual teve suas águas transpostas para o rio São Francisco. O objetivo principal é, após 40 anos, verificar as consequências do impacto da transposição sobre a biodiversidade das comunidades aquáticas e as principais alterações ambientais nas bacias hidrográficas. Serão testadas diversas hipóteses relacionadas à mistura das faunas e floras, existência de perda ou de aumento da diversidade após a mistura das biotas e as possíveis alterações na qualidade das águas. O estudo consistirá de uma caracterização liminológica completa, do inventário de espécies da flora e fauna aquáticas e de estudos genéticos de peixes em trechos do rio São Francisco, à montante e à jusante do canal de transposição do rio Piumhi, e comparação deste com tributários não impactados, em ambas as bacias: do rio Grande e do rio São Francisco.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Orlando Moreira Filho - Integrante / Odete Rocha - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Orlando Moreira Filho. |
| 5. | 2005-2008. TRANSIMPACT / O Impacto da Transposicao de Rios na Biodiversidade, um Estudo de Caso: a Transposicao do Rio Piumhi para o Rio Sao Francisco. Descrição: A estratégia da transposição de águas já foi utilizada em diversos países e contimentes. No Brasil, um projeto antigo é o da transposição de águas do rio São Francisco para bacias do Nordeste, visando a perenização de rios temporários e a diminuição da escassez de água na região semi-árida, em alguns estados nordestinos. O assunto é altamente controverso, pois há ainda uma grande carência de estudos de forneçam informações sobre os impactos decorrentes da transposição de rios entre bacias. No sudeste brasileiro, a transposição de águas de um rio da bacia do Alto Paraná para a bacia do rio São Franscisco, há cerca de 40 anos, oferece uma oportunidade ímpar para um estudo sobre o impacto da transposiçào de rios sobre a biodiversidade. O presente estudo propõe uma avaliação da biodiversidade em comunidades planctônicas, bentônicas e nectônicas do rio Piumhi, antigo afluente do rio Grande (bacia do rio Paraná), o qual teve suas águas transpostas para o rio São Francisco. O objetivo principal é, após 40 anos, verificar as consequências do impacto da transposição sobre a biodiversidade das comunidades aquáticas e as principais alterações ambientais nas bacias hidrográficas. Serão testadas diversas hipóteses relacionadas à mistura das faunas e floras, existência de perda ou de aumento da diversidade após a mistura das biotas e as possíveis alterações na qualidade das águas. O estudo consistirá de uma caracterização liminológica completa, do inventário de espécies da flora e fauna aquáticas e de estudos genéticos de peixes em trechos do rio São Francisco, à montante e à jusante do canal de transposição do rio Piumhi, e comparação deste com tributários não impactados, em ambas as bacias: do rio Grande e do rio São Francisco.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (2) . Integrantes: Luiz Antonio Carlos Bertollo - Integrante / ORLANDO MOREIRA FILHO - Integrante / José Salatiel Rodrigues Pires - Integrante / José Roberto Verani - Integrante / Nelsy Fenerich Verani - Integrante / Odete Rocha - Coordenador / Marcelo Vicari - Integrante / Alberto Carvalho Peret - Integrante / Yoshimi Sato - Integrante / Outros pesquisadores alunos e técnicos - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Membro: Luiz Antonio Carlos Bertollo. |
| 1. | 2004-2005. ESTUDO DA RESPOSTA GLICEMICA NO TELEOSTEO DE AGUA DOCE PACU (Piaractus mesopotamicus) Descrição: No ambiente natural, os peixes têm acesso limitado a fontes de carboidratos e não são bem adaptados à digestão e metabolização de dietas com altos níveis de carboidratos. Estudos recentes também vêm indicando que esses animais têm uma habilidade limitada de metabolizar glicose, isto é, retirá-la do compartimento plasmático, resultando assim, numa hiperglicemia que permanece por muitas horas (BERGOT, 1979; KAUSHIK OLIVA-TELES, 1985; BRAUGE et al., 1994). Testes de tolerância à glicose (GTT) têm sido feitos em muitas espécies de peixes para estudar a utilização metabólica da glicose (FURUICHI YONE, 1981; HARMON et al., 1991; GARCIA-RIERA HEMRE, 1996). Não surpreendentemente, os testes de GTT, resultaram numa prolongada hiperglicemia, porém com padrões diferentes entre espécies: os peixes carnívoros apresentaram uma menor tolerância que os onívoros. Mas, mesmo as espécies mais tolerantes exibem níveis de glicose plasmática relativamente alto com retorno aos níveis basais mais lentamente que os mamíferos onívoros. (COWEY, 1989). Segundo testes prévios, a espécie onívora Piaractus mesopotamicus (pacu), apresenta uma resposta impar à administração de glicose pois é verificada uma tendência rápida de sua remoção do compartimento plasmático, e a hiperglicemia permanece por poucas horas, semelhante, portanto, a resultados obtidos em humanos. Dessa forma, tornam-se importantes estudos de resposta glicêmica em Piaractus mesopotamicus, para o entendimento de parte do mecanismo de regulação da glicemia neste peixe, que apresenta uma dinâmica totalmente diferente das já estudadas. Para compreender os padrões metabólicos, o objetivo do presente trabalho será o de realizar o GTT com glicemiação através de sonda intragástrica, analisando, a partir do conhecimento de sua resposta glicêmica, a dinâmica de incorporação metabólica da glicose. Para isso, estaremos avaliando as reservas calóricas incorporadas (glicogênio) e os padrões glicêmico e aminoacídico. Deveremos ainda padron. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Gilberto Moraes - Coordenador / Cassia Maria Toledo Saccon - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Membro: Gilberto Moraes. |
| 2. | 2004-Atual. Evolucao da Arquitetura Genetica de Caracteres Complexos Descrição: The genetic architecture of a phenotype plays a critical role in determining phenotypic evolution through its effects on patterns of genetic variation. Genetic architecture is often considered constant in evolutionary quantitative genetic models. However, genetic architecture may be variable and itself evolve when there are dominance and epistatic interactions among alleles at the same and different loci, respectively. In this project, we aim to investigate the evolution of genetic architecture by investigating the presence of additive, dominance and epistatic variation affecting many complex traits in mouse.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Reinaldo Otávio Alvarenga Alves de Brito - Coordenador / Andrea Cristina Peripato - Integrante / Fernando Pacheco Rodrigues - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Washington University In Saint Louis - Cooperação. Número de produções C, T A: 7 Membro: Reinaldo Otavio Alvarenga Alves de Brito. |
| 3. | 2004-Atual. Identificacao de genes de especiacao em Anastrepha Descrição: As moscas das frutas Anastrepha fraterculus, A. sororcula e A. obliqua são das maiores ameaças à fruticultura nacional. O efetivo controle destas pragas requer grande conhecimento da biologia e filogenia das populações destas espécies. Este projeto pretende utilizar-se de duas estratégias diferentes, de genes candidatos e de marcadores dispersos pelo genoma, para tentar elucidar os genes envolvidos na especiação e diferenciação do grupo fraterculus. Este entendimento permitirá o estabelecimento de marcadores genéticos especificos para as diversas espécies crípticas deste complexo. Portanto, o estudo de genes de especiação em moscas-das-frutas do grupo fraterculus será importante não só por seu aspecto prático, ao permitir o estabelecimento de melhores condições para o controle de uma grande praga agrícola, mas também por sua contribuição teórica para o melhor entendimento de processos envolvidos em especiação.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Doutorado: (1) . Integrantes: Reinaldo Otávio Alvarenga Alves de Brito - Coordenador / Iderval da Silva Junior Sobrinho - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Reinaldo Otavio Alvarenga Alves de Brito. |
| 1. | 2003-2007. Citogenetica e Evolucao Cariotipica em Peixes de Agua Doce (VI) Descrição: Este projeto enquadra-se na linha de pesquisa quot;Citogenética Básica, Molecular e Evolu'tiva de Peixes Neotropicaisquot;, que vem sendo desenvolvida pelo grupo de Citogenética de Peixes da UFSCar já há alguns anos, e a partir da qual foram gerados diversos trabalhos científicos e a formação de vários pesquisadores nessa área, hoje alocados em diferentes instituições de pesquisa no país e mesmo no exterior. O objetivo básico do projeto é a continuidade dos estudos sobre a estrutura cariotípica de nossas espécies de peixes de água doce, considerando a riquesa de nossa ictiofauna. Três grupos terão um enfoque particular:#10;a) Família Erythrinidae (gênero Hoplias) - esse grupo já vem sendo objeto de nossos estudos há vários anos, destacando sua diversidade cromossômica e distribuição geográfica de um provável complexo de espécies, diferenciação de sistemas de cromossomos sexuais e citotaxonomia.#10;b) Astyanax fasciatus (Characidae) - espécie que também tem se caracterizado por uma diversificação cariotípica, com evidências de distintos citótipos, encontrados em alopatria, simpatria e sintopia, o que será objeto de um estudo mais pormenorizado.#10;c) Subfamília Serrasalminae (piranhas, da região Amazônica) - enfoque sobre a possível participação das Ag-RONs, rDNA 18S e rDNA 5S nos processos evolutivos do grupo.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (4) . Integrantes: Luiz Antonio Carlos Bertollo - Coordenador / Marcelo Ricardo Vicari - Integrante / Rubens Pazza - Integrante / Celeste Mutuko Nakayama - Integrante / Marcelo de Bello Cioffi - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.Número de orientações: 2 Membro: Luiz Antonio Carlos Bertollo. |
| 2. | 2003-2005. Estudo das respostas Adaptativas em teleosteos de agua doce Descrição: Este estudo engloba sub-projetos que compõem a maior parte da linha de pesquisas do Laboratório de Biologia Adaptativa do Departamento de Genética e Evolução da UFSCar. Estes sub-projetos são desenvolvidos por alunos de Pós-graduação em nível de mestrado e doutorado além de alunos de iniciação científica. De maneira geral, esses envolvem o estudo das respostas bioquímicas à variação de fatores externos desde o teor de nutrientes até a ação de fatores estressantes como o transporte e o efeitos de xenobióticos. Estes sub-projetos são parcialmente subsidiados pela FAPESP, CNPq e CAPES, contando ainda com a colaboração do Centro Nacional de Pesquisa de Peixes Tropicais de Pirassununga-SP. (CEPTA-IBAMA). Os professores Dr. Bernardo Baldisseroto e Dra. Vânia Lúcia Pimentel Vieira da Universidade Federal de Santa Maria-RS, e o Dr. Luiz Orlando B. Afonso do National Research Council - Halifax Canadá serão nossos consultores em áreas distintas de atuação. Nossos modelos experimentais são, em sua maioria, realizados em laboratório sob condições controladas, procurando simular situações naturais ou situações usualmente impostas pelo manejo. Nosso objetivo, desde que iniciamos em 1994 esta linha de pesquisa, é conhecer parte das respostas bioquímicas primárias de nossas espécies de peixes de água doce frente às variações externas enunciadas. Um enfoque especial é dado às alterações do metabolismo, particularmente o metabolismo intermediário, em resposta adaptativa a alterações de parâmetros nutricionais, de qualidade de água, da presença de compostos xenobióticos, além de outros fatores fontes de estresse durante o cultivo e manuseio de peixes. Estes trabalhos são elaborados com alguns propósitos, entre os quais, o de levar ao campo uma proposta, com bases cintíficas, de atuação no manejo das espécies promissoras para o cultivo. Pouco se sabe sobre os mecanismos moleculares responsáveis pela adaptação de nossas espécies às variações do meio e sua potencialidade para responder e. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (3) . Integrantes: Gilberto Moraes - Coordenador / Lícia Maria Lundstedt - Integrante / Alexandre Eneas Altran - Integrante / Luis Antonio Kioshi Aoki Inoue - Integrante / Cristina Ferro Correa - Integrante / Vania P Vieira - Integrante / Ive Marchioni Avilez - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Gilberto Moraes. |
| 3. | 2003-2005. Estudos citogeneticos em comunidades de peixes de regioes limitrofes entre 3 bacias hidrograficas adjacentes. Descrição: Estudos citogenéticos em comunidades de peixes de regiões limítrofes entre 3 bacias hidrográficas adjacentes. CNPq 473313/2003.#10;O presente projeto visa estudar as inter-relações citogenética-evolutivas das comunidades ictiofaunísticas de três bacias hidrográficas distintas, mas adjacentes, representadas pelos rios São Francisco, Paraíba do Sul e Alto Paraná. Estudos citogenéticos em comunidades de peixes representa uma linha de pesquisa mais recente, onde há possibilidades de interações de diferentes áreas do conhecimento, como biogeografia, geologia, taxonomia, ecologia e genética molecular, buscando-se um conhecimento mais concreto dos processos evolutivos que levaram à grande diversidade de nossas espécies. Assim, as regiões limítrofes entre bacias hidrográficas adjacentes tornam-se locais importantes para estudos dessa natureza, podendo possibilitar uma melhor compreensão da origem e das inter-relações das comunidades ictiofaunísticas. Coordenador Orlando Moreira Filho. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Orlando Moreira Filho - Coordenador / Liano Centofante - Integrante / Caroline Garcia - Integrante / Wellington Adriano Peres - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 4 / Número de orientações: 2 Membro: Orlando Moreira Filho. Descrição: O presente projeto teve por finalidade estudar as inter-relações citogenética-evolutivas das comunidades ictiofaunísticas de três bacias hidrográficas distintas, mas adjacentes, representadas pelos rios São Francisco, Paraíba do Sul e Alto Paraná. Estudos citogenéticos em comunidades de peixes representa uma linha de pesquisa mais recente, onde há possibilidades de interações de diferentes áreas do conhecimento, como biogeografia, geologia, taxonomia, ecologia e genética molecular, buscando-se um conhecimento mais concreto dos processos evolutivos que levaram à grande diversidade de nossas espécies. Assim, as regiões limítrofes entre bacias hidrográficas adjacentes tornam-se locais importantes para estudos dessa natureza, podendo possibilitar uma melhor compreensão da origem e das inter-relações das comunidades ictiofaunísticas.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (3) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . Integrantes: Luiz Antonio Carlos Bertollo - Integrante / ORLANDO MOREIRA FILHO - Coordenador / Débora Diniz Bezerra - Integrante / LIANO CENTOFANTE - Integrante / Caroline Garcia - Integrante / Wellington Adriano Moreira Peres - Integrante / Elizângela Bellafronte da Silva - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Luiz Antonio Carlos Bertollo. |
| 4. | 2003-2005. Estudos sobre a estruturacao genetica de populacoes de Passeriformes da Mata Atlantica. Descrição: O projeto visa acessar a variação genética de algumas espécies de passeriformes da Mata Atlântica, verificar a ocorrência de estruturação de populações e inferir sobre o o efeito da fragmentação e o papel dos contínuos de mata sobre a diversidade genética dessas aves.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . Integrantes: Pedro Manoel Galetti Junior - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Pedro Manoel Galetti Junior. |
| 5. | 2003-2006. Genoma EST do camarao Litopenaeus vannamei Descrição: O projeto está estruturado numa rede nacional de laboratórios que visa sequenciar milhares EST do camarão marinho Litopenaeus vannamei, a mais importante espécie de cultivo no Brasil na atualidade.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Pedro Manoel Galetti Junior - Coordenador / Cesar Martins - Integrante / Flávio Henrique da Silva - Integrante / André Carlos P L F Carvalho - Integrante / Mauro Biajiz - Integrante / Edmundo C Grisard - Integrante / Emydia Rosa R B P L Mesquita - Integrante / Julio Cascardo - Integrante / Maria Raquel Moura Coimbra - Integrante / Mauricio Bacci Junior - Integrante / Sandro L Bonatto - Integrante / Silvia Regina Batistuzzo de Medeiros - Integrante / Gonçalo A Guimarães Pereira - Integrante / Thales Grangeiro - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Associação Brasileira de Criadores de Camarão - Auxílio financeiro. Membro: Pedro Manoel Galetti Junior. |
| 1. | 2002-2004. Isolamento e caracterizacao de microssatelites de Prochilodus marggravii (Characiformes, Prochilodontidae) para estudos de sua diversidade genetica no rio Sao Francisco. Descrição: O projeto visa o isolamento e a caracterização de microssatélites numa importante espécie de peixe do rio São Francisco, buscando fornecer uma boa ferramenta genética para estudos da estrutura populacional desses peixes.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . Integrantes: Pedro Manoel Galetti Junior - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Pedro Manoel Galetti Junior. |
| 2. | 2002-2004. Respostas metabolicas e de crescimento em matrinxa (Brycon cephalus Gunter, 1869) submetidos a exercicio sustentado Descrição: O objetivo deste projetp foi avaliar as respostas metabólicas e de crescimento de Brycon cephalus submetidos ao exercício contínuo de longa duração pelo período de 37 e 72 dias, a velocidade constante de natação de 42cm/seg. Para tal, realizou-se a análise: -da série sanguínea e respostas iônicas plasmáticas; - das respostas metabólicas de fígado, músculo branco e músculo vermelho, através da quantificação dos intermediários metabólicos; - da preferência metabólica dos matrinxãs através da quantificação da atividade de determinadas enzimas; - dos índices de crescimento, tanto bioquímicos como zootécnicos.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Gilberto Moraes - Coordenador. Número de produções C, T A: 1 / Número de orientações: 1 Membro: Gilberto Moraes. |
| 1. | 2001-2003. Analise da Biodiversidade de riachos, citogenetica comparativa e taxonomia de ictiofaunas isoladas por divisor de aguas. Descrição: Auxílio à Pesquisa FAPESP, proc. número: 01/00713-0. Título: Análise da diversidade de Riachos, Citogenética comparativa e taxonomia de ictiofauna isoladas por um divisor de águas:. O projeto desenvolvido teve como objetivo básico a análise da biodiversidade da fauna ictiológica de riachos, separados por um divisor de águas (Serra da Mantiqueira), na região de Campos do Jordão, SP, integrando estudos de Citogenética e Taxonomia. Duas grandes instituições foram envolvidas neste projeto, ou seja, a Universidade Federal de São Carlos (UFSCar) e o Museu Nacional do Rio de Janeiro (MNRJ), representadas pelos seus pesquisadores participantes. Além dos professores doutores (responsáveis e colaboradores), também fizeram parte do projeto alunos pós-graduandos (Doutorandos e Mestrandos) e de iniciação científica. A integração de duas áreas em torno de um tema central comum, além da proposta de centralização das coletas em uma única região, proporcionou um custo/benefício mais rentável e racional para o projeto, ou seja, a resolução conjunta de problemas inerentes à nossa biodiversidade ictiológica, que eram carente de conhecimentos básicos.Durante a realização do projeto foi possível concluir 8 trabalhos: 2 já publicados , 1 no prelo e 5 enviados e submetidos à publicação, todos em revistas estrangeiras indexadas. Com intuito de divulgar e discutir os resultados obtidos, foram apresentados 11 resumos em Simpósios e Congressos Científicos Nacionais. Na formação de recursos humanos, participaram alunos de pós-graduação e graduação, com seus trabalhos, que se encontram em fase de conclusão: 2 teses de Doutorado, 1 Dissertação de Mestrado e 1 Bolsa de Iniciação Científica, todas envolvidas com o projeto. Como resultados principais podem ser destacados: a descoberta de novas espécies para estas bacias, três novas descrições de sistemas de cromossomos sexuais do tipo ZZ/ZW, casos de poliploidias naturais e novas descições cariotipicas.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Orlando Moreira Filho - Coordenador / Liano Centofante - Integrante / Paulo Buckup - Integrante / Karine Frehener Kavalco - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa. Número de produções C, T A: 6 / Número de orientações: 1 Membro: Orlando Moreira Filho. |
| 2. | 2001-2003. Citogenetica, Biogeografia e Biodiversidade de Peixes Neotropicais Descrição: Tendo em vista a ampla distribuição geográfica dos peixes nas diversas bacias fluviais do Brasil, assim como em diversos ambientes aquáticos (lagos, lagoas temporárias, corredeiras, cabeceiras de rios e riachos), a investigação dos processos implicados na diversificação cariotípica e na evolução torna-se uma uma ferramenta importante para o conhecimento da biodiversidade.#10;Assim sendo, o presente projeto teve como objetivo básico o estudo da estrutura do cariótipo em diferentes grupos de nossa ictiofaunade de água doce, com vistas à análise da sua biodiversidade e sua distribuição, considerando três condições distintas:#10;a) bacias hidrográficas não adjacentes, separadas por barreiras geográficas intransponíveis pela ictiofauna, constituindo isolados populacionais.#10;b) bacias hidrográficas adjacentes, onde os processos de diversificação podem ocorrer em condições de alopatria e/ou parapatria, e com eventuais regiões de contacto e fluxo gênico entre populações diferenciadas.#10;c) uma mesma bacia hidrográfica, onde condições de simpatria são as mais frequentes, mas também com possibilidade de alopatria (isolamento por acidentes geográficos, como quedas d'água) e mesmo parapatria.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (4) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (2) . Integrantes: Luiz Antonio Carlos Bertollo - Coordenador / ORLANDO MOREIRA FILHO - Integrante / Marcelo Ricardo Vicari - Integrante / Rubens Pazza - Integrante / LIANO CENTOFANTE - Integrante / Karine Frehner Kavalco - Integrante / Debora Diniz Bezerra - Integrante / Marilza Barbosa de Almeida Marques - Integrante / Caroline Garcia - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.Número de orientações: 2 Membro: Luiz Antonio Carlos Bertollo. |
| 1. | 2000-2004. A biodiversidade em ecossistemas de agua doce: bases para o desenvolvimento sustentavel. Descrição: O projeto foi comtemplado dentro do PRONEX/CNPq e objetiva o conhecimento da biodiversidade aquática do rio São Francisco e incluiu estudos de genética e citogenética de populações de peixes daquele sistema hidrográfico.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (3) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (3) . Integrantes: Pedro Manoel Galetti Junior - Integrante / Orlando Moreira Filho - Integrante / Luiz Antonio Carlos Bertollo - Integrante / Odete Rocha - Coordenador / Julio Cesar Garavello - Integrante / Augusto Abe - Integrante / Armando A.H. Vieira - Integrante / Francisco R. Barbosa - Integrante / Gustavo Fonseca - Integrante / Kennedy F. Roche - Integrante / Maria C. Calijuri - Integrante / Mirna J.L. Godinho - Integrante / Pedro Américo C. Senna - Integrante / Takako Matsumura Tundisi - Integrante / Célio Haddad - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Pedro Manoel Galetti Junior. |
| 2. | 2000-2003. Citogenetica e Evolucao Cariotipica em Peixes de Agua Doce (V) Descrição: O objetivo geral desse projeto foi ciontribuir para um melhor conhecimento e caracterização da biodiversidade de nossa ictiofauna, assim como com a taxonomia e sistemática desse grupo. De um modo mais específico, foi enfatizada a diversidade cariotípica na família Erythrinidade, particularmente no grupo Hoplias malabaricus e Hoplerythrinus unitaeniatus, avaliando sua extensa diversidade no que se refere ao número e à morfologia dos cromossomos, sistemas de cromossomos sexuais e a ocorrência de citótipos em simpatria. Paralelamente, o grupo Erythrinus erythrinus foi também analisado, visto que esse era, até então, o gênero menos conhecido do ponto de vista citogenético entre os Erythrinidae. Neste caso, foram analisadas diversas populações de diferentes bacias hidrográficas brasileiras, buscando confirmar alguns dados prévios que sugeriam que esse grupo também representaria um complexo de espécies, da mesma forma como Hoplias malabaricus e Hoplerythrinus unitaeniatus. Um outro grupo considerado foi Astyanax (Characidae), em especial A. scabripinnis e A. fasciatus. Em A. scabripinnis foram enfocados os cromossoms B ou supranumerários em distintas populações, procurando contribuir para o melhor conhecimento desta classe de cromossomos, ainda carente de conhecimentos básicos quanto à sua origem e possível papel biológico. Em A. fasciatus foram analisadas duas formas cariotípicas distintas (formas padrão), assim como formas variantes a partir das mesmas, procurando caracterizar possíveis hibridações existentes nesse grupo. Assim sendo, o presente projeto teve por finalidade contribuir para o desenvolvimento da Citogenética Animal, particularmente dos peixes, e da Biologia Evolutiva, como um todo, em alguns campos de interesse como:#10;a) biodiversidade, citotaxonomia e evolução cariotípica#10;b) diferenciação e evolução de cromossomos sexuais#10;c) distribuição, origem e significado dos cromossomos B. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (3) . Integrantes: Luiz Antonio Carlos Bertollo - Coordenador / GUASSENIR GONÇALVES BORN - Integrante / DAGMAR APARECIDA DE MARCO FERRO - Integrante / Marcelo Ricardo Vicari - Integrante / Débora Diniz Bezerra - Integrante / Rubens Pazza - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.Número de orientações: 5 Membro: Luiz Antonio Carlos Bertollo. |
| 3. | 2000-2000. Identificacao, caracterizacao molecular e localizacao cromossomica de DNA satelite em Prochilodus lineatus (Pisces, Prochilodontidae) Descrição: Auxílio à Pesquisa, Projeto financiado plea FAFESP. 1999/10332-1. Título: Identificação, Caracterização Molecular e Localização Cromossômica de DNA Satélite em Prochilodus lineatus (Pisces, Prochilodontidae). Período: Janeiro de 2000 a Dezembro de 2000.#10;Atraves deste projeto foi possivel a confecção de sondas para o estudos de DNA satelite de Prochilodus lineatus, as 2 sondas foram denominadas de satH1e satH2. Utilizando estas sondas foi possivel dectectar e localizar atraves da hibridação em situ as regiões de 2 famílias de DNA repetitivos nos cromossomos desta espécie.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . Integrantes: Orlando Moreira Filho - Coordenador / Célia Maria de Jesus - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Número de produções C, T A: 2 / Número de orientações: 1 Membro: Orlando Moreira Filho. |
| 1. | 1999-2003. Aspectos adaptativos dos processos digestivo e metabolico de juvenis de pintado (Pseudoplatystoma corruscans) arracoados com diferentes niveis de proteina e energia Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Gilberto Moraes - Coordenador. Membro: Gilberto Moraes. |
| 1. | 1998-2001. Efeitos metabolicos do matil paration no teleosteo de agua doce matrinxa (Brycon cephalus) Descrição: Neste projeto foi proposta a determinação 1) dos efeitos da concentração do organofosforado metil paration sobre o peixe teleósteo de água doce Brycon cephalus, 2) do tempo de exposição a este composto e 3) da recuperação à esta exposição. Os objetivos gerais foram detalhados tal como segue: 1. Definição do valor da CL50 para a espécie. 2. Determinação dos efeitos da concentração do inseticida. 3. Determinação dos efeitos do tempo de exposição a uma concentração subletal do inseticida. 4. Determinação dos efeitos do pH da água sobre a toxicidade do metil paration. 5. Determinação dos efeitos da exposição subletal prolongada ao metil paration sobre o metabolismo de B. cephalus. 6. Caracterização do metabolismo de B. cephalus durante a recuperação da exposição prolongada ao metil paration.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Gilberto Moraes - Coordenador. Número de produções C, T A: 1 Membro: Gilberto Moraes. |
| 2. | 1998-1998. Os cromossomos B em Astynax scabripinnis da regiao de Campos de Jordao-SP. Descrição: Auxílio Pesquisador Visitante: Dr. JUAN PEDRO MARTINEZ CAMACHO. FAPESP proc. número:1998/7271-8,. Título do projeto: Os Cromossomos B em Astyanax scabripinnis da região de Campos de Jordão-SP, 12/10/98.#10;Projeto para a vinda do Prof. Dr. Pedro Camacho, assessoria para os estudos de cromossomos B em A. scabripinnis da região de Campos do Jordão.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Orlando Moreira Filho - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Remuneração. Membro: Orlando Moreira Filho. |
| 1. | 1997-1999. A biodiversidade de Ecossistemas de agua doce naturais e artificiais: base para o desenvolvimneto sustentavel Descrição: Programa de Núcleo de Excelência (PRONEX)-CNPq- Pesquisador Participante. Título:quot;A Biodiversidade de Ecossistemas de Água Doce Naturais e Artificiais : Bases para o Desenvolvimento Sustentávelquot;.1997. Coordenador Odete Rocha, Participante Orlando Moreira Filho. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Orlando Moreira Filho - Integrante / Odete Rocha - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Membro: Orlando Moreira Filho. |
| 2. | 1997-2001. A UTILIZACAO PELO TAMBAQUI Colossoma Macropomum (CUVIER, 1818) DAS FRACOES PROTEICA E ENERGETICA DE ALIMENTOS USADOS EM DIETAS DE CRESCIMENTO: O PADRAO DE ENZIMAS DIGESTIVAS E AS RESPOSTAS METABOLICAS AS VARIACOES DAS DIETAS. Descrição: Os objetivos deste projeto foram: Investigar as respostas digestivas de natureza enzimática e os reflexos metabólicos em alevinos de tambaqui submetido a diferentes tipos de alimento. Especificamente foi feita a: 1) Ensaio da atividade das enzimas digestivas nas diferentes secções do trato digestório de alevinos de tambaqui. 2) Determinação do papel das proteases, amilase e lipase do trato digestivo na digestibilidade aparente dos alimentos utilizados nas dietas. 3) Determinação da influência dos alimentos utilizados no perfil metabólico tissular. 4) Avaliação da eficiência dos teores de proteína e energia digestível das dietas práticas, através do desempenho de produção e da composição corporal dos alevinos. 6) Determinação da influência dos níveis de proteína digestível e energia digestível das dietas no perfil metabólico tissular. 7) Determinação dos efeitos de níveis de proteína digestível e energia digestível das dietas práticas sobre a atividade das proteases, amilase e lípase.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Gilberto Moraes - Coordenador. Número de produções C, T A: 1 / Número de orientações: 1 Membro: Gilberto Moraes. |
| 1. | 1994-1996. Bases geneticas da diversidade no Complexo scabripinnis (Pisces, Characidae) Descrição: 6-.Título do projeto: Bases Genéticas da Diversidade no Complexo quot;scabripinnisquot; (Pisces,Characidae). #10;Auxílio à Pesquisa FAPESP, Proc. número: 94/2775-7Período: 01/12/1994 a 30/11/1996.#10;Os estudos foram realizados em distintas populações de A. scabripinnis coletados em diferentes altitudes da região de Campos do Jordão,como um dos objetivos principais foi verificar a frequência do cromossomo B em cada uma das populações. Durante a realização deste trabalho foram abordados conjuntamente com as áreas da biologia molecular e genética bioquimica. Coordenador: Orlando Moreira Filho. Participantes: Vera Elisa Vicente; Issakar Lima Souza; Daniela Morilha Néo. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Orlando Moreira Filho - Coordenador / Issakar Lima Souza - Integrante / Vera Elisa Vicente - Integrante / Daniela Morilha Néo - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Membro: Orlando Moreira Filho. |
| 1. | 1993-1994. Estudos cariotipicos em Astyanax scabripinnis (Characiformes, Characidae) em ambientes de diferentes altitudes Descrição: 5- Título do Projeto: Estudos cariotípicos em Astyanax scabripinnis (Characiformes, Characidae) em ambientes de diferentes altitudes. Auxílio à Pesquisa CNPq, Proc. número: 400700/91. Período: 01/09/1993 a 28/02/1994.#10;Os estudos foram realizados em 3 distintas populações de A. scabripinnis coletados em diferentes altitudes da região de Campos do Jordão,como um dos objetivos principais foi verificar a frequência do cromossomo B em cada uma das populações. Coordenador: Orlando Moreira Filho. Participantes: Vera Elisa Vicente; Issakar Lima Souza; Daniela Morilha Néo.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Orlando Moreira Filho - Coordenador / Issakar Lima Souza - Integrante / Vera Elisa Vicente - Integrante / Daniela Morilha Néo - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Membro: Orlando Moreira Filho. |
| 1. | 1992-1993. Estudos citogeneticos em populacoes de peixes do genero Astyanax (Pisces, Characidae) Descrição: 4- Titulo do Projeto: Estudos Citogenéticos em Populações de Peixes do gênero Astyanax (Pisces, Characidae). #10;Auxílio à Pesquisa FAPESP, Proc. número: 92/2564-0,Periodo: 01/08/1992 a 31/07/1993.#10;O projeto teve como objetivo principal estudar comparativamente os cariotipos de diferentes espécies do gênero Astyanax de distintas bacias hidrográficas. Neste projeto as pricipais espécies estudadas foram. A. fasciatus;A. scabripinnis e A. eigemnanniorum. Coordenador: Orlando Moreira Filho. Participantes: Álvaro José Justi, Grasiele Fauaz e Issakar Lima Souza.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Orlando Moreira Filho - Coordenador / Grasiele Fauaz - Integrante / Issakar Lima Souza - Integrante / Álvaro José Justi - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa. Membro: Orlando Moreira Filho. |
| 1. | 1991-1992. Estudos cariotipicos em duas especies do genero Parodon Descrição: Estudos cariotípicos em duas espécies do gênero Parodon (Pisces, Parodontidae) FAPESP. Proc. 91/0211-0 . Os estudos citogenéticos foram efetuados em duas espécie do gênero Parodon: P. tortuosus e P.hilarii. Para está última espécie foi descrito pela primeira vez um sistema de cromossomos sexuais do tipo ZZ/ZW para a família Parodontidae. Coordenador: Orlando Moreira Filho. Participantes: Lilian Cristina Jorge.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Orlando Moreira Filho - Coordenador / Luiz Antônio Carlos Bertollo - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 1 Membro: Orlando Moreira Filho. |
| 1. | 1990-1990. A diversidade em Astyanax scabripinnis (Characidae, Tetragonopterinae) Analise morfologicas e citogenetica Descrição: Auxílio à Pesquisa CNPq, Proc. número: 403071/ 89-5 1989. Projeto: A diversidade em Astyanax sacabripinnis (Characidae, Tetragonopterinae): Análises Morfológicas e Citogenéticas.#10;Neste projeto foram estudados exemplares de diferentes populações de Astyanax scabripinnis coletados em distintas bacias hidrográficas brasileiras. Dentre os resultados principais foi possivel demonstrar que A. scabripinnis corresponde a um complexo de espécies, apartir deste projeto A. scabripinnis passou a ser denomida de quot;complexo scabripinnisquot;. Coordenador: Orlando Moreira Filho. Participantes: Lara Bellintani Salvador; Issakar Lima Souza.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Orlando Moreira Filho - Coordenador / Lara Bellintani Salvador - Integrante / Issakar Lima Souza - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Número de produções C, T A: 5 / Número de orientações: 5 Membro: Orlando Moreira Filho. |
| 1. | 1986-1987. Estudos da Familia Parodontidae de duas bacias hidrograficas brasileiras:consideracoes cariotipo-evolutiva Descrição: .#10;Estudos da família Parodontidae de duas bacias hidrográficas brasileiras: considerações cariotípo-evolutiva. Processo n. 408601/85-GE.#10;Os estudos citogenéticos foram realizados em espécies da família Parodontidae nas bacias do rio Paraná e do rio São Francisco. Para a bacia do rio Paraná foram estudadas Parodon tortuosus; Apareiodon affinis, Apareidon ibitiensis e Apareiodon piracicabae. Para a bacia do rio São Francisco foram estudadas Parodon hilarii, Apareiodon sp.A.#10;Os principais resultados obtidos foram: a descrições cariotípicas destas espécies, a descrição das diferenças dentárias entre as espécies e descoberta de um sistema de cromossomos sexuais do tipo ZZ/ZW em Parodon hilarii. Coordenador: Orlando Moreira Filho.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Orlando Moreira Filho - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 2 / Número de orientações: 1 Membro: Orlando Moreira Filho. |
Data de processamento: 12/10/2020 21:32:43